Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DYN5

Protein Details
Accession A0A178DYN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
311-340RRQSAAIRKSRDWHRRKRRLWQEVEDNPLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
311-329RRQSAAIRKSRDWHRRKRR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, cyto 11, nucl 10, pero 2, mito 1, plas 1, E.R. 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010989  SNARE  
IPR045242  Syntaxin  
IPR006012  Syntaxin/epimorphin_CS  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005484  F:SNAP receptor activity  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF05739  SNARE  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00914  SYNTAXIN  
PS50192  T_SNARE  
CDD cd15845  SNARE_syntaxin16  
Amino Acid Sequences MAGGGYDDGDAVIEMDLLPPRWLDVQDEITEHLAEIAKQTRKLDQLHQKHILPGFDDEDVKKREEREIEQLTQGITRHFQKCQQAIKRIETMVRESKQQGNINQGEEIMARNLKISLATRVGEVSAMFRKKQAAYLKKLRDLGGFASPFRSVTPIQNPYNDPALQESDADRSFSQSTLLQTKQQRLRHDPNEALIAQREREIEDIAQGIIELANIFQELQTMVIDQGSMLDRIDYNVENVTRDVKEADKELKVASGYQKRSIKRKIMLLLAILIAGVFILLSLKLGRKGGDGMAAVPQVPDVPPAAAVRSRRQSAAIRKSRDWHRRKRRLWQEVEDNPLLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.07
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.11
8 0.14
9 0.15
10 0.16
11 0.19
12 0.23
13 0.24
14 0.25
15 0.25
16 0.24
17 0.24
18 0.2
19 0.17
20 0.13
21 0.12
22 0.15
23 0.21
24 0.24
25 0.27
26 0.29
27 0.32
28 0.37
29 0.41
30 0.47
31 0.5
32 0.55
33 0.61
34 0.65
35 0.62
36 0.61
37 0.6
38 0.52
39 0.43
40 0.37
41 0.3
42 0.26
43 0.27
44 0.23
45 0.27
46 0.28
47 0.28
48 0.27
49 0.27
50 0.31
51 0.34
52 0.37
53 0.39
54 0.44
55 0.44
56 0.43
57 0.42
58 0.36
59 0.33
60 0.29
61 0.21
62 0.18
63 0.23
64 0.24
65 0.25
66 0.31
67 0.37
68 0.43
69 0.52
70 0.56
71 0.59
72 0.61
73 0.63
74 0.62
75 0.55
76 0.51
77 0.44
78 0.42
79 0.41
80 0.37
81 0.36
82 0.35
83 0.39
84 0.43
85 0.46
86 0.42
87 0.42
88 0.43
89 0.41
90 0.38
91 0.32
92 0.25
93 0.2
94 0.19
95 0.12
96 0.1
97 0.08
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.1
102 0.1
103 0.12
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.14
113 0.16
114 0.16
115 0.16
116 0.19
117 0.19
118 0.26
119 0.32
120 0.34
121 0.41
122 0.5
123 0.54
124 0.56
125 0.58
126 0.53
127 0.45
128 0.38
129 0.32
130 0.29
131 0.24
132 0.19
133 0.18
134 0.17
135 0.16
136 0.15
137 0.15
138 0.1
139 0.14
140 0.21
141 0.26
142 0.27
143 0.3
144 0.31
145 0.3
146 0.33
147 0.29
148 0.22
149 0.17
150 0.18
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.12
162 0.1
163 0.12
164 0.16
165 0.17
166 0.2
167 0.23
168 0.31
169 0.37
170 0.4
171 0.43
172 0.47
173 0.55
174 0.54
175 0.56
176 0.49
177 0.43
178 0.43
179 0.37
180 0.29
181 0.23
182 0.19
183 0.14
184 0.15
185 0.14
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.1
221 0.08
222 0.08
223 0.11
224 0.12
225 0.12
226 0.13
227 0.15
228 0.14
229 0.14
230 0.15
231 0.14
232 0.15
233 0.18
234 0.22
235 0.19
236 0.2
237 0.19
238 0.2
239 0.18
240 0.19
241 0.24
242 0.28
243 0.3
244 0.37
245 0.44
246 0.47
247 0.55
248 0.61
249 0.61
250 0.58
251 0.63
252 0.6
253 0.58
254 0.55
255 0.47
256 0.4
257 0.31
258 0.25
259 0.18
260 0.12
261 0.07
262 0.05
263 0.04
264 0.02
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.03
269 0.05
270 0.07
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.14
275 0.16
276 0.16
277 0.18
278 0.17
279 0.16
280 0.18
281 0.17
282 0.16
283 0.14
284 0.13
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.08
289 0.08
290 0.1
291 0.11
292 0.14
293 0.17
294 0.21
295 0.29
296 0.35
297 0.38
298 0.37
299 0.41
300 0.47
301 0.54
302 0.61
303 0.62
304 0.61
305 0.63
306 0.71
307 0.76
308 0.78
309 0.78
310 0.78
311 0.8
312 0.84
313 0.89
314 0.91
315 0.92
316 0.92
317 0.91
318 0.89
319 0.88
320 0.84
321 0.84