Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EJV8

Protein Details
Accession A0A178EJV8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-47QPAGRSPKPAAKRRRIASSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-42RSPKPAAKRRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MLKLVEYPDSSSGDDEEQGDKSIVPAAQPAGRSPKPAAKRRRIASSTSTASLPPLPAAFHDLYANNARVSTSDDPALHGGRRRAVPHVDGNWPSHVYLEWIPSQTEADSLHALIHHIQDIVGQQNAAQKKKNMSVPELIPSLTSELGVALPLHVSMSRTLQIKTEDREAFVESLQSAVRKSSVRVFYFTFSGLKWVPNFERNRWFLALSIKKPEHDELNKLLNACNHAARSTGHAALYTGGEGDGPMQDTSPPSAKRVKRDAYTEDHTDRSEYFHISIAWNLTEPNPDWISKVQDIDVNKHISSPQASIDSVKARVGNIVHNIPLAAQRVGLGFGGGPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.18
4 0.17
5 0.17
6 0.17
7 0.15
8 0.14
9 0.17
10 0.15
11 0.13
12 0.15
13 0.16
14 0.18
15 0.19
16 0.22
17 0.27
18 0.28
19 0.31
20 0.33
21 0.39
22 0.46
23 0.55
24 0.62
25 0.64
26 0.72
27 0.75
28 0.81
29 0.75
30 0.71
31 0.69
32 0.66
33 0.6
34 0.52
35 0.47
36 0.36
37 0.35
38 0.31
39 0.25
40 0.18
41 0.14
42 0.12
43 0.12
44 0.18
45 0.16
46 0.15
47 0.17
48 0.16
49 0.19
50 0.23
51 0.24
52 0.18
53 0.18
54 0.17
55 0.15
56 0.21
57 0.2
58 0.18
59 0.2
60 0.2
61 0.22
62 0.24
63 0.26
64 0.22
65 0.23
66 0.24
67 0.26
68 0.29
69 0.29
70 0.31
71 0.33
72 0.34
73 0.37
74 0.38
75 0.39
76 0.38
77 0.39
78 0.37
79 0.34
80 0.29
81 0.23
82 0.19
83 0.16
84 0.15
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.17
91 0.13
92 0.13
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.13
112 0.18
113 0.19
114 0.21
115 0.22
116 0.26
117 0.32
118 0.35
119 0.33
120 0.32
121 0.35
122 0.34
123 0.34
124 0.31
125 0.25
126 0.21
127 0.18
128 0.16
129 0.11
130 0.1
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.07
144 0.1
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.17
149 0.19
150 0.2
151 0.26
152 0.24
153 0.23
154 0.24
155 0.23
156 0.2
157 0.17
158 0.15
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.16
169 0.22
170 0.23
171 0.25
172 0.26
173 0.25
174 0.26
175 0.26
176 0.19
177 0.13
178 0.15
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.15
183 0.17
184 0.23
185 0.27
186 0.28
187 0.35
188 0.35
189 0.38
190 0.36
191 0.34
192 0.28
193 0.34
194 0.36
195 0.3
196 0.36
197 0.34
198 0.33
199 0.36
200 0.36
201 0.34
202 0.31
203 0.33
204 0.29
205 0.34
206 0.34
207 0.32
208 0.32
209 0.26
210 0.26
211 0.23
212 0.21
213 0.16
214 0.15
215 0.16
216 0.15
217 0.19
218 0.19
219 0.19
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.15
224 0.15
225 0.1
226 0.07
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.11
238 0.17
239 0.17
240 0.19
241 0.28
242 0.32
243 0.4
244 0.48
245 0.52
246 0.51
247 0.56
248 0.58
249 0.56
250 0.58
251 0.56
252 0.5
253 0.45
254 0.41
255 0.37
256 0.32
257 0.29
258 0.25
259 0.2
260 0.18
261 0.18
262 0.19
263 0.18
264 0.2
265 0.17
266 0.16
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.16
271 0.16
272 0.2
273 0.2
274 0.2
275 0.22
276 0.24
277 0.29
278 0.28
279 0.28
280 0.24
281 0.25
282 0.28
283 0.31
284 0.34
285 0.32
286 0.29
287 0.29
288 0.28
289 0.28
290 0.28
291 0.24
292 0.22
293 0.21
294 0.22
295 0.22
296 0.26
297 0.26
298 0.25
299 0.26
300 0.23
301 0.21
302 0.24
303 0.24
304 0.25
305 0.27
306 0.29
307 0.27
308 0.26
309 0.26
310 0.23
311 0.25
312 0.23
313 0.17
314 0.14
315 0.14
316 0.15
317 0.16
318 0.15
319 0.11