Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E188

Protein Details
Accession A0A178E188    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-80NFPFRERAQPRRRSRSPARTPPPKRGNEQRRDDKCBasic
228-247REQTKRLKETRSRSNPELKQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-72RERAQPRRRSRSPARTPPPKRGN
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 8.5, cyto_mito 6, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Amino Acid Sequences MQNTYGLFFTPKFFITHAGVDVTPWHNQFKYKYASIRRKHESKDDNFPFRERAQPRRRSRSPARTPPPKRGNEQRRDDKCWLCGKIHKMADCPDFGKCLNCHMAGHTTAQCPQKSTHTATRIMRGMERLTIERPMNTTADAHGYKALCIAINEKAAVTEQLAVANRTMAELHAANTKLQHGIEKLQRDMEKLQCDMEKLQRDKDKLQRDKEEAIKQKTVLKQQRDVLREQTKRLKETRSRSNPELKQQPNVLAEQVKQEETSEEEELRPWRTQYFW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.24
4 0.23
5 0.23
6 0.21
7 0.2
8 0.24
9 0.22
10 0.22
11 0.22
12 0.24
13 0.23
14 0.28
15 0.31
16 0.34
17 0.38
18 0.4
19 0.47
20 0.53
21 0.62
22 0.66
23 0.73
24 0.75
25 0.76
26 0.75
27 0.77
28 0.76
29 0.72
30 0.74
31 0.73
32 0.72
33 0.67
34 0.64
35 0.59
36 0.51
37 0.54
38 0.49
39 0.51
40 0.54
41 0.62
42 0.7
43 0.76
44 0.79
45 0.79
46 0.84
47 0.84
48 0.84
49 0.85
50 0.85
51 0.85
52 0.85
53 0.86
54 0.85
55 0.79
56 0.76
57 0.76
58 0.77
59 0.76
60 0.81
61 0.81
62 0.78
63 0.8
64 0.79
65 0.71
66 0.67
67 0.64
68 0.57
69 0.49
70 0.48
71 0.45
72 0.47
73 0.48
74 0.43
75 0.38
76 0.41
77 0.4
78 0.36
79 0.33
80 0.25
81 0.23
82 0.21
83 0.23
84 0.17
85 0.19
86 0.2
87 0.2
88 0.19
89 0.19
90 0.21
91 0.18
92 0.21
93 0.19
94 0.17
95 0.22
96 0.26
97 0.25
98 0.24
99 0.24
100 0.26
101 0.28
102 0.33
103 0.34
104 0.34
105 0.4
106 0.39
107 0.43
108 0.39
109 0.36
110 0.32
111 0.26
112 0.23
113 0.19
114 0.19
115 0.15
116 0.14
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.09
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.05
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.13
165 0.13
166 0.14
167 0.11
168 0.17
169 0.22
170 0.24
171 0.24
172 0.28
173 0.29
174 0.3
175 0.33
176 0.32
177 0.31
178 0.28
179 0.29
180 0.25
181 0.26
182 0.27
183 0.29
184 0.33
185 0.32
186 0.38
187 0.42
188 0.45
189 0.51
190 0.56
191 0.6
192 0.6
193 0.66
194 0.66
195 0.65
196 0.68
197 0.69
198 0.69
199 0.68
200 0.65
201 0.6
202 0.54
203 0.55
204 0.54
205 0.57
206 0.56
207 0.53
208 0.54
209 0.57
210 0.64
211 0.6
212 0.58
213 0.57
214 0.59
215 0.57
216 0.57
217 0.6
218 0.58
219 0.61
220 0.62
221 0.63
222 0.62
223 0.67
224 0.71
225 0.72
226 0.74
227 0.75
228 0.8
229 0.77
230 0.77
231 0.79
232 0.71
233 0.67
234 0.63
235 0.62
236 0.54
237 0.49
238 0.43
239 0.36
240 0.34
241 0.34
242 0.33
243 0.28
244 0.26
245 0.25
246 0.23
247 0.23
248 0.26
249 0.22
250 0.21
251 0.2
252 0.24
253 0.26
254 0.28
255 0.28
256 0.25