Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EDR0

Protein Details
Accession A0A178EDR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-258DSEQSKSKSVSKRKELEHRSRESAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
242-275KSVSKRKELEHRSRESARSGAQRTSRSRSPKRRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012479  SAP30BP  
Gene Ontology GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07818  HCNGP  
Amino Acid Sequences MLGIDYPSSDEEEEVAANKPDARLADLAVAPSAISPRSPPPLAQPLVAPEPVSGPLQGPSISPPPADNDDRDDAPPGSPYTSNRAIVQTLTLPTVPNFKIPPSPPGSPPRKATSKFAQFLDLKRTGQHFNQRLEGSTVLRDPTHMQRLMKFARVQEEDLHASTLSQDAGVPAVFPPWAYVEELRASQKKLSKAKEQERSKAPRQAVEFVSATQSDKISGQTSRQSTAKRTVTGSDSEQSKSKSVSKRKELEHRSRESARSGAQRTSRSRSPKRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.12
4 0.13
5 0.14
6 0.14
7 0.15
8 0.15
9 0.17
10 0.16
11 0.16
12 0.19
13 0.18
14 0.19
15 0.16
16 0.15
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.08
21 0.08
22 0.1
23 0.14
24 0.2
25 0.22
26 0.22
27 0.28
28 0.37
29 0.38
30 0.36
31 0.33
32 0.31
33 0.33
34 0.33
35 0.26
36 0.17
37 0.17
38 0.18
39 0.18
40 0.13
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.11
46 0.13
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.15
51 0.19
52 0.24
53 0.26
54 0.23
55 0.25
56 0.28
57 0.29
58 0.29
59 0.28
60 0.23
61 0.21
62 0.22
63 0.17
64 0.16
65 0.16
66 0.17
67 0.21
68 0.24
69 0.25
70 0.24
71 0.25
72 0.23
73 0.22
74 0.22
75 0.17
76 0.14
77 0.13
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.16
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.16
86 0.22
87 0.22
88 0.28
89 0.28
90 0.3
91 0.32
92 0.41
93 0.46
94 0.44
95 0.47
96 0.47
97 0.49
98 0.49
99 0.5
100 0.5
101 0.52
102 0.51
103 0.48
104 0.48
105 0.42
106 0.42
107 0.43
108 0.37
109 0.28
110 0.27
111 0.29
112 0.26
113 0.27
114 0.34
115 0.33
116 0.32
117 0.37
118 0.35
119 0.33
120 0.32
121 0.3
122 0.21
123 0.16
124 0.15
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.11
129 0.15
130 0.2
131 0.21
132 0.21
133 0.22
134 0.29
135 0.3
136 0.31
137 0.28
138 0.24
139 0.28
140 0.29
141 0.28
142 0.24
143 0.26
144 0.23
145 0.22
146 0.21
147 0.15
148 0.13
149 0.12
150 0.1
151 0.07
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.1
168 0.12
169 0.14
170 0.17
171 0.18
172 0.19
173 0.22
174 0.26
175 0.32
176 0.39
177 0.42
178 0.48
179 0.56
180 0.64
181 0.7
182 0.72
183 0.71
184 0.73
185 0.76
186 0.73
187 0.71
188 0.63
189 0.58
190 0.55
191 0.53
192 0.45
193 0.42
194 0.35
195 0.28
196 0.29
197 0.24
198 0.22
199 0.17
200 0.16
201 0.12
202 0.12
203 0.14
204 0.14
205 0.15
206 0.17
207 0.23
208 0.26
209 0.28
210 0.32
211 0.33
212 0.35
213 0.44
214 0.45
215 0.41
216 0.4
217 0.4
218 0.39
219 0.39
220 0.38
221 0.34
222 0.32
223 0.31
224 0.33
225 0.32
226 0.31
227 0.31
228 0.35
229 0.4
230 0.47
231 0.56
232 0.61
233 0.67
234 0.74
235 0.81
236 0.83
237 0.85
238 0.84
239 0.81
240 0.79
241 0.77
242 0.72
243 0.65
244 0.59
245 0.55
246 0.54
247 0.51
248 0.5
249 0.51
250 0.56
251 0.59
252 0.62
253 0.63
254 0.65
255 0.72