Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EDX5

Protein Details
Accession A0A178EDX5    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-61RHAPPKPRKSFLEKLNKRHRSLSLHMRSKRGEKKSSKNEDQKTHSRTSBasic
380-399ACNTVQPNKKCRTCNRCEACHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-50APPKPRKSFLEKLNKRHRSLSLHMRSKRGEKKSSK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
IPR001810  F-box_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF00646  F-box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
CDD cd09917  F-box_SF  
Amino Acid Sequences MSTIGTDYRFNEERHAPPKPRKSFLEKLNKRHRSLSLHMRSKRGEKKSSKNEDQKTHSRTSSSSQKEVSVTSSVTSASRSDTNYSYSLSSQYEEQEGTSLKDAKQSPVLPQDGGFAVPFQHAAAQNERPGNQDFAQSIQDLMLRKKTSCNSGIGNMARLSPVHSRVSSQGTMSEEQMEDWLEKPEDAEVHRHRKLSADQATPSLEEKEEVAERQLDETVDSIDHISDAYFSGWDSDPEDGSKSKTSPSPGIQPSSIITQQSQLLDLPEEVLRAIAAHLDMTSICSFRLTCKPLHSAIPTPPNPLTASPETIYLFLQHLRPSPPLPLRFCPECKAPHPWTPQDYYTNPLQTPATLRCRRYLLSGREPMASILSAKHFLCEACNTVQPNKKCRTCNRCEACAGLRRSWVLLSWVEDECDECVARDGPRWKEWKEEFEGRGNAGGQREWVGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.56
3 0.57
4 0.63
5 0.73
6 0.75
7 0.75
8 0.75
9 0.77
10 0.77
11 0.78
12 0.8
13 0.78
14 0.8
15 0.84
16 0.86
17 0.81
18 0.78
19 0.75
20 0.71
21 0.71
22 0.71
23 0.71
24 0.72
25 0.73
26 0.73
27 0.71
28 0.73
29 0.74
30 0.72
31 0.71
32 0.71
33 0.77
34 0.81
35 0.87
36 0.87
37 0.88
38 0.88
39 0.87
40 0.86
41 0.84
42 0.8
43 0.76
44 0.68
45 0.6
46 0.53
47 0.52
48 0.54
49 0.5
50 0.49
51 0.43
52 0.44
53 0.43
54 0.42
55 0.37
56 0.29
57 0.23
58 0.19
59 0.18
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.12
64 0.12
65 0.15
66 0.16
67 0.19
68 0.2
69 0.23
70 0.23
71 0.24
72 0.23
73 0.21
74 0.22
75 0.19
76 0.19
77 0.17
78 0.17
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.18
86 0.19
87 0.17
88 0.24
89 0.26
90 0.26
91 0.31
92 0.31
93 0.32
94 0.36
95 0.37
96 0.31
97 0.3
98 0.29
99 0.23
100 0.22
101 0.17
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.07
107 0.1
108 0.12
109 0.15
110 0.19
111 0.21
112 0.25
113 0.27
114 0.28
115 0.27
116 0.27
117 0.28
118 0.24
119 0.24
120 0.21
121 0.2
122 0.21
123 0.18
124 0.16
125 0.13
126 0.14
127 0.14
128 0.15
129 0.19
130 0.19
131 0.2
132 0.25
133 0.28
134 0.31
135 0.32
136 0.34
137 0.3
138 0.31
139 0.36
140 0.31
141 0.3
142 0.25
143 0.22
144 0.19
145 0.17
146 0.17
147 0.15
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.19
152 0.22
153 0.27
154 0.24
155 0.21
156 0.2
157 0.2
158 0.21
159 0.2
160 0.19
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.11
165 0.09
166 0.08
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.18
175 0.22
176 0.3
177 0.33
178 0.34
179 0.33
180 0.35
181 0.37
182 0.38
183 0.39
184 0.34
185 0.32
186 0.33
187 0.34
188 0.31
189 0.29
190 0.2
191 0.13
192 0.1
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.08
227 0.1
228 0.12
229 0.11
230 0.13
231 0.15
232 0.17
233 0.2
234 0.22
235 0.28
236 0.29
237 0.31
238 0.29
239 0.28
240 0.26
241 0.25
242 0.24
243 0.16
244 0.14
245 0.13
246 0.15
247 0.14
248 0.14
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.11
274 0.19
275 0.19
276 0.21
277 0.25
278 0.29
279 0.3
280 0.34
281 0.34
282 0.3
283 0.33
284 0.4
285 0.37
286 0.38
287 0.36
288 0.34
289 0.32
290 0.29
291 0.29
292 0.22
293 0.24
294 0.21
295 0.23
296 0.21
297 0.21
298 0.2
299 0.15
300 0.14
301 0.13
302 0.14
303 0.14
304 0.16
305 0.18
306 0.2
307 0.2
308 0.27
309 0.32
310 0.36
311 0.4
312 0.41
313 0.44
314 0.48
315 0.49
316 0.46
317 0.44
318 0.43
319 0.42
320 0.47
321 0.46
322 0.49
323 0.54
324 0.56
325 0.55
326 0.54
327 0.54
328 0.52
329 0.47
330 0.43
331 0.41
332 0.39
333 0.34
334 0.31
335 0.28
336 0.23
337 0.26
338 0.3
339 0.35
340 0.37
341 0.39
342 0.41
343 0.45
344 0.44
345 0.48
346 0.5
347 0.48
348 0.52
349 0.57
350 0.54
351 0.52
352 0.51
353 0.44
354 0.36
355 0.27
356 0.18
357 0.14
358 0.15
359 0.17
360 0.16
361 0.16
362 0.16
363 0.16
364 0.18
365 0.18
366 0.2
367 0.19
368 0.23
369 0.26
370 0.33
371 0.41
372 0.44
373 0.5
374 0.56
375 0.6
376 0.65
377 0.73
378 0.75
379 0.76
380 0.8
381 0.79
382 0.76
383 0.71
384 0.67
385 0.63
386 0.62
387 0.58
388 0.5
389 0.46
390 0.41
391 0.4
392 0.35
393 0.29
394 0.24
395 0.22
396 0.22
397 0.22
398 0.22
399 0.21
400 0.2
401 0.2
402 0.17
403 0.17
404 0.14
405 0.11
406 0.13
407 0.15
408 0.16
409 0.22
410 0.29
411 0.33
412 0.41
413 0.47
414 0.45
415 0.53
416 0.58
417 0.59
418 0.6
419 0.62
420 0.59
421 0.61
422 0.62
423 0.53
424 0.5
425 0.44
426 0.38
427 0.32
428 0.29
429 0.22