Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ECC9

Protein Details
Accession A0A178ECC9    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-126ICRRKDAKSARIKKNKKVNNIKFKVRCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-117RKDAKSARIKKNKKV
160-166KNPKGKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002675  Ribosomal_L38e  
IPR038464  Ribosomal_L38e_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01781  Ribosomal_L38e  
Amino Acid Sequences MFDFYREDNRCIRQQTLELATSPHGGPSSRHTRRQSTIPKTATLAPAPSRPVPQASFHSTTICLGDRLEIHDPELSVTDSSHQSVKMPSEVSDIKQFIEICRRKDAKSARIKKNKKVNNIKFKVRCSRNVYTLVLKDTDKAEKLKQSLPPGLTISDVGKKNPKGKRTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.45
3 0.44
4 0.4
5 0.34
6 0.31
7 0.29
8 0.27
9 0.24
10 0.19
11 0.15
12 0.14
13 0.15
14 0.21
15 0.31
16 0.35
17 0.44
18 0.48
19 0.54
20 0.57
21 0.66
22 0.68
23 0.65
24 0.69
25 0.62
26 0.59
27 0.54
28 0.53
29 0.46
30 0.37
31 0.32
32 0.25
33 0.26
34 0.28
35 0.27
36 0.25
37 0.23
38 0.26
39 0.24
40 0.25
41 0.27
42 0.3
43 0.32
44 0.31
45 0.31
46 0.27
47 0.26
48 0.24
49 0.2
50 0.13
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.13
55 0.15
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.13
61 0.13
62 0.1
63 0.08
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.13
77 0.14
78 0.15
79 0.18
80 0.18
81 0.16
82 0.18
83 0.18
84 0.15
85 0.25
86 0.27
87 0.25
88 0.34
89 0.36
90 0.34
91 0.42
92 0.48
93 0.47
94 0.54
95 0.62
96 0.64
97 0.73
98 0.79
99 0.8
100 0.83
101 0.81
102 0.8
103 0.82
104 0.81
105 0.82
106 0.82
107 0.83
108 0.79
109 0.79
110 0.79
111 0.73
112 0.71
113 0.68
114 0.67
115 0.63
116 0.61
117 0.57
118 0.52
119 0.5
120 0.44
121 0.38
122 0.32
123 0.28
124 0.26
125 0.28
126 0.25
127 0.26
128 0.28
129 0.32
130 0.36
131 0.39
132 0.43
133 0.45
134 0.49
135 0.46
136 0.45
137 0.4
138 0.37
139 0.33
140 0.28
141 0.24
142 0.25
143 0.26
144 0.27
145 0.33
146 0.39
147 0.46
148 0.52