Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E4L4

Protein Details
Accession A0A178E4L4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSGEKRKRHSEGKERPKKKAAIVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-20KRKRHSEGKERPKKKA
437-445VGGPRKSRR
Subcellular Location(s) mito 19, cyto_mito 12.333, mito_nucl 11.833, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MSGEKRKRHSEGKERPKKKAAIVPEGNVDVEFLENKEVLGPLLAATPGLSFPSRMSFKPYKHTKILPSGESTELLLQSSDHARLDYLAQEERDGSSESQLKDYIGVFDPATNKLKIVPVRRVVVRSSLRSETEELREEQAALEARQSTMSAKRYALAAEFGSKKSRKALEERTLNAIRSGNAEDPTAIRNVAVAENVLQNMAGSLGAMPTKDELAAAVDSSKPRPTPNLAAEYPGDVYTTDTVIGSELMTMLDVKDWVMAAAAGEGVSVSSKFVAKRISKLAQNKQIQKLKALRFILLCIDFHAALFGGGGTKPKKIPVKGKLEAHMGEHVPAGCVAAIRRKFAPESGNDMPRWNIDNLLTHVAAAALIVEDHELDVNDLREDLKLENKAIKQYFMELGCKVVPPNQTDLTKYKLTKNESVNHHIAKLKLPLSFPKVGGPRKSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.87
3 0.87
4 0.82
5 0.79
6 0.75
7 0.73
8 0.73
9 0.71
10 0.66
11 0.61
12 0.57
13 0.49
14 0.4
15 0.32
16 0.21
17 0.16
18 0.14
19 0.1
20 0.11
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.11
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.07
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.18
40 0.21
41 0.21
42 0.29
43 0.35
44 0.38
45 0.48
46 0.57
47 0.57
48 0.61
49 0.67
50 0.65
51 0.68
52 0.7
53 0.63
54 0.58
55 0.54
56 0.48
57 0.42
58 0.36
59 0.28
60 0.22
61 0.19
62 0.14
63 0.11
64 0.12
65 0.14
66 0.14
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.15
73 0.15
74 0.17
75 0.16
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.18
80 0.17
81 0.15
82 0.17
83 0.22
84 0.22
85 0.23
86 0.23
87 0.21
88 0.21
89 0.2
90 0.19
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.16
95 0.18
96 0.2
97 0.23
98 0.2
99 0.18
100 0.19
101 0.24
102 0.28
103 0.32
104 0.36
105 0.38
106 0.43
107 0.45
108 0.46
109 0.42
110 0.45
111 0.44
112 0.4
113 0.39
114 0.38
115 0.36
116 0.36
117 0.38
118 0.33
119 0.32
120 0.31
121 0.27
122 0.26
123 0.25
124 0.23
125 0.2
126 0.19
127 0.16
128 0.13
129 0.14
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.15
136 0.19
137 0.19
138 0.19
139 0.19
140 0.2
141 0.2
142 0.18
143 0.15
144 0.12
145 0.14
146 0.16
147 0.17
148 0.23
149 0.23
150 0.24
151 0.28
152 0.32
153 0.31
154 0.37
155 0.45
156 0.47
157 0.53
158 0.54
159 0.56
160 0.53
161 0.49
162 0.43
163 0.34
164 0.26
165 0.21
166 0.22
167 0.16
168 0.15
169 0.15
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.12
174 0.1
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.13
212 0.16
213 0.21
214 0.24
215 0.29
216 0.27
217 0.29
218 0.28
219 0.26
220 0.23
221 0.17
222 0.14
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.06
259 0.06
260 0.09
261 0.17
262 0.18
263 0.22
264 0.29
265 0.33
266 0.37
267 0.46
268 0.53
269 0.55
270 0.61
271 0.64
272 0.66
273 0.68
274 0.63
275 0.61
276 0.61
277 0.56
278 0.56
279 0.5
280 0.43
281 0.37
282 0.37
283 0.34
284 0.27
285 0.22
286 0.16
287 0.17
288 0.14
289 0.13
290 0.13
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.05
295 0.04
296 0.05
297 0.09
298 0.1
299 0.13
300 0.14
301 0.2
302 0.27
303 0.32
304 0.42
305 0.47
306 0.56
307 0.6
308 0.64
309 0.62
310 0.6
311 0.55
312 0.47
313 0.42
314 0.32
315 0.26
316 0.23
317 0.19
318 0.15
319 0.13
320 0.12
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.15
325 0.17
326 0.19
327 0.21
328 0.23
329 0.24
330 0.27
331 0.31
332 0.26
333 0.33
334 0.36
335 0.4
336 0.38
337 0.39
338 0.36
339 0.33
340 0.34
341 0.26
342 0.22
343 0.18
344 0.22
345 0.24
346 0.27
347 0.24
348 0.2
349 0.2
350 0.17
351 0.16
352 0.11
353 0.07
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.12
370 0.12
371 0.17
372 0.19
373 0.21
374 0.28
375 0.3
376 0.38
377 0.37
378 0.39
379 0.33
380 0.34
381 0.37
382 0.33
383 0.33
384 0.25
385 0.27
386 0.25
387 0.25
388 0.23
389 0.22
390 0.25
391 0.25
392 0.3
393 0.34
394 0.35
395 0.38
396 0.41
397 0.42
398 0.44
399 0.44
400 0.46
401 0.48
402 0.53
403 0.56
404 0.6
405 0.63
406 0.63
407 0.68
408 0.67
409 0.62
410 0.6
411 0.56
412 0.5
413 0.46
414 0.46
415 0.41
416 0.37
417 0.38
418 0.41
419 0.44
420 0.48
421 0.43
422 0.44
423 0.5
424 0.54
425 0.6