Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A178DTU8

Protein Details
Accession A0A178DTU8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-217MVKRGAIHREKLRRKKERALEATLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-211RGAIHREKLRRKKER
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_mito 6, mito 5.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045237  COPS7/eIF3m  
IPR000717  PCI_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MEQTKALNALEPFLALSKSATSPRAASDLVVQATSAPNTYVFAELLQTPNIQNLRSSTEYAPFLKLLEIFAWGTWEDYKAQADLPKLSAQQHQKLLLLSLLPLSRSHSTLTYKHLLTALDLPTTRALEELITTAIYSGLITATLDPAHSLVSVTSISPLRDLAPGSIPSLQNTLQTWSQRCDSALADLEAQVEMVKRGAIHREKLRRKKERALEATLQTSDEKNVGKRGLGGGGVDDVMDIDDEGTGGSRVTRGSKRGPGGFGFGGMGRRLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.14
6 0.17
7 0.18
8 0.19
9 0.2
10 0.22
11 0.25
12 0.22
13 0.2
14 0.21
15 0.24
16 0.23
17 0.22
18 0.19
19 0.17
20 0.18
21 0.18
22 0.14
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.12
36 0.17
37 0.18
38 0.17
39 0.17
40 0.17
41 0.22
42 0.24
43 0.27
44 0.23
45 0.26
46 0.29
47 0.29
48 0.29
49 0.23
50 0.21
51 0.19
52 0.17
53 0.14
54 0.11
55 0.12
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.1
67 0.12
68 0.13
69 0.15
70 0.15
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.2
75 0.25
76 0.28
77 0.32
78 0.34
79 0.34
80 0.33
81 0.31
82 0.3
83 0.24
84 0.18
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.18
96 0.2
97 0.25
98 0.26
99 0.24
100 0.24
101 0.25
102 0.21
103 0.19
104 0.21
105 0.17
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.13
110 0.14
111 0.12
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.16
154 0.15
155 0.15
156 0.17
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.17
161 0.16
162 0.2
163 0.21
164 0.22
165 0.23
166 0.22
167 0.22
168 0.21
169 0.18
170 0.17
171 0.17
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.11
177 0.11
178 0.08
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.16
186 0.2
187 0.27
188 0.35
189 0.46
190 0.56
191 0.66
192 0.75
193 0.77
194 0.81
195 0.84
196 0.84
197 0.84
198 0.8
199 0.78
200 0.74
201 0.67
202 0.63
203 0.53
204 0.45
205 0.36
206 0.3
207 0.23
208 0.2
209 0.19
210 0.17
211 0.22
212 0.22
213 0.21
214 0.22
215 0.23
216 0.21
217 0.19
218 0.17
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.1
223 0.08
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.15
239 0.2
240 0.24
241 0.32
242 0.4
243 0.46
244 0.5
245 0.52
246 0.48
247 0.49
248 0.44
249 0.37
250 0.31
251 0.26
252 0.24