Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A167PV82

Protein Details
Accession A0A167PV82    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-50MTTFIKDRLKSRRLRKPEKEKPIPNTSTVRRGRGRPRKQSHPIIKNEKIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-42RLKSRRLRKPEKEKPIPNTSTVRRGRGRPRKQSHP
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MTTFIKDRLKSRRLRKPEKEKPIPNTSTVRRGRGRPRKQSHPIIKNEKIDPERELLEKGIHPVYQQLLKDIHRDKLERQARVTKTRDLEYEAARKWFEAREKQAWDEFYTGQVRARLEMTHSLQASIAKLEQEMLELSRRKDRDNRRSSTPTLAYSDLESNSIYTSPIALPESVMHTPYYKGLLDPSTKTM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.88
3 0.89
4 0.91
5 0.93
6 0.93
7 0.91
8 0.89
9 0.88
10 0.8
11 0.74
12 0.72
13 0.65
14 0.65
15 0.61
16 0.6
17 0.56
18 0.61
19 0.66
20 0.69
21 0.75
22 0.75
23 0.79
24 0.81
25 0.85
26 0.88
27 0.87
28 0.85
29 0.85
30 0.83
31 0.82
32 0.77
33 0.7
34 0.67
35 0.59
36 0.52
37 0.44
38 0.37
39 0.32
40 0.28
41 0.26
42 0.19
43 0.19
44 0.18
45 0.18
46 0.17
47 0.15
48 0.14
49 0.15
50 0.16
51 0.18
52 0.17
53 0.17
54 0.19
55 0.2
56 0.26
57 0.27
58 0.29
59 0.29
60 0.3
61 0.3
62 0.37
63 0.42
64 0.37
65 0.38
66 0.43
67 0.43
68 0.5
69 0.51
70 0.46
71 0.43
72 0.42
73 0.39
74 0.35
75 0.33
76 0.28
77 0.31
78 0.26
79 0.25
80 0.23
81 0.22
82 0.19
83 0.2
84 0.21
85 0.22
86 0.27
87 0.31
88 0.33
89 0.35
90 0.36
91 0.34
92 0.31
93 0.26
94 0.21
95 0.19
96 0.18
97 0.17
98 0.16
99 0.17
100 0.16
101 0.14
102 0.15
103 0.12
104 0.13
105 0.17
106 0.19
107 0.2
108 0.2
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.18
113 0.14
114 0.12
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.13
123 0.16
124 0.18
125 0.24
126 0.25
127 0.29
128 0.37
129 0.47
130 0.53
131 0.6
132 0.63
133 0.64
134 0.7
135 0.68
136 0.68
137 0.6
138 0.52
139 0.46
140 0.43
141 0.35
142 0.31
143 0.31
144 0.23
145 0.2
146 0.17
147 0.14
148 0.13
149 0.13
150 0.11
151 0.08
152 0.09
153 0.08
154 0.11
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.18
160 0.17
161 0.18
162 0.16
163 0.16
164 0.17
165 0.18
166 0.2
167 0.15
168 0.15
169 0.18
170 0.23
171 0.26