Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162UCQ1

Protein Details
Accession A0A162UCQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-49GLDSRGHKPELKKRLRKATKQNVNKNESLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-38HKPELKKRLRKA
267-276KAPHKNIRKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047201  ERI-1_3'hExo-like  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50800  SAP  
CDD cd06133  ERI-1_3'hExo_like  
Amino Acid Sequences MSDSPKPTTVDSLRKALEELGLDSRGHKPELKKRLRKATKQNVNKNESLEPVKVELPETKQDIKTKLPLYDYYLFFDVEATCEVNGGFEFPNEIIEFPVVLVDANTFKIVDEYRSYVKPTINPTLTKFCLELTGIDQATVDNSPCFIDVLDDFQEFLGKWSLFQKKSAVFVTDGPFDIRDFITKQCKHSNLKKRPAYFSTPWINIRKLFREFYNYPVNKNIGAMLEALDMKFEGREHSGLDDSRNLVAIGRKMWEDGCVFKTNIKWKAPHKNIRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.44
3 0.37
4 0.33
5 0.25
6 0.23
7 0.2
8 0.21
9 0.2
10 0.22
11 0.26
12 0.26
13 0.27
14 0.29
15 0.33
16 0.41
17 0.53
18 0.61
19 0.65
20 0.72
21 0.82
22 0.87
23 0.88
24 0.9
25 0.9
26 0.9
27 0.91
28 0.92
29 0.9
30 0.86
31 0.79
32 0.71
33 0.63
34 0.57
35 0.5
36 0.41
37 0.32
38 0.28
39 0.27
40 0.24
41 0.23
42 0.22
43 0.22
44 0.26
45 0.28
46 0.31
47 0.33
48 0.38
49 0.39
50 0.4
51 0.43
52 0.41
53 0.4
54 0.38
55 0.36
56 0.38
57 0.41
58 0.38
59 0.34
60 0.31
61 0.28
62 0.25
63 0.24
64 0.17
65 0.12
66 0.12
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.12
100 0.15
101 0.16
102 0.18
103 0.19
104 0.2
105 0.22
106 0.25
107 0.29
108 0.29
109 0.3
110 0.31
111 0.34
112 0.34
113 0.31
114 0.27
115 0.2
116 0.18
117 0.17
118 0.14
119 0.1
120 0.13
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.09
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.16
148 0.23
149 0.24
150 0.25
151 0.28
152 0.26
153 0.3
154 0.3
155 0.26
156 0.2
157 0.22
158 0.23
159 0.21
160 0.2
161 0.17
162 0.16
163 0.14
164 0.14
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.15
169 0.24
170 0.26
171 0.31
172 0.37
173 0.43
174 0.48
175 0.57
176 0.64
177 0.64
178 0.73
179 0.75
180 0.73
181 0.74
182 0.72
183 0.69
184 0.62
185 0.59
186 0.55
187 0.52
188 0.53
189 0.51
190 0.48
191 0.44
192 0.46
193 0.44
194 0.42
195 0.4
196 0.36
197 0.41
198 0.4
199 0.4
200 0.46
201 0.41
202 0.39
203 0.41
204 0.41
205 0.33
206 0.32
207 0.28
208 0.17
209 0.17
210 0.15
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.13
224 0.16
225 0.19
226 0.2
227 0.22
228 0.22
229 0.21
230 0.21
231 0.21
232 0.18
233 0.16
234 0.19
235 0.2
236 0.18
237 0.19
238 0.19
239 0.19
240 0.2
241 0.21
242 0.19
243 0.21
244 0.24
245 0.27
246 0.27
247 0.29
248 0.35
249 0.41
250 0.47
251 0.48
252 0.5
253 0.55
254 0.66
255 0.74
256 0.77