Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162UP04

Protein Details
Accession A0A162UP04    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
629-655KEMSAKIKKSAHRRKLKETKKQSFELSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
620-649GKKKEKEKEKEMSAKIKKSAHRRKLKETKK
728-738RNARGRGRGKG
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 9, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR008669  LSM_interact  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05391  Lsm_interact  
Amino Acid Sequences MASPKDITAHGNAAVDQTIYSVPAKDSGDNDMAINEQSLTDATTMDLTGIVNKNPTYSMEVNESSDDDLLDNQISELDDPAAIQAQKTLEALEQLPQVMEQLDQDNTRFELHVRLIEILSLLDFPDQLESARENMHELFPLPESMWLDWINDAKKNLDTEDGEAKLRLLYNEAEKDYLSIPIWKSYVDFILARFDSVWGDDETGLNNEAEAEMVIENTREDLMKAVRATSYHVMESHEIWNKYSGFEIRVLKRFQSPERFEKVKKAFMERLSTLHIACEQTFSDYSGLISTFDNENYESNMVEANKIYAKTKEAAIERDYFEQQLTQHGYSLDMFYQYIENEKITTKKPSLNNVRGLYERAVSMYCTDVGLWNDYVLFFFERVRVQIFLEATTLRAVRNCPWSGILWAHLGRVLETGKKSHEKISEIFDRALENKALLASLEDLVALLRAKCDFERRRVDWEEPDEETIMDLRVAFEEALVYISEADRGYTAFGKIGDPYYRIEKYYAYIEGKKLGNVKKAREIWEGVIKKHGRQSEAWIQYIDFERSAGNEHRCASLFKQALSKNLDYPERIMDAWMTFEHEEGTVDSMEDALIRINKGSKLLTRNWQANLAEQETAEGKKKEKEKEKEMSAKIKKSAHRRKLKETKKQSFELSMAPSEKENKVHSVPTVPILKRKASEMNIFENDVFKKPKPIQKISAEPKVEKKAVANVETKPASGLGMIPHGMRNARGRGRGKGTRLAISRNQAKPAEQATSTHAPTAGPTAPQTITPKSNDDFRALLLGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.17
3 0.13
4 0.12
5 0.1
6 0.11
7 0.11
8 0.12
9 0.12
10 0.17
11 0.19
12 0.2
13 0.21
14 0.25
15 0.27
16 0.26
17 0.25
18 0.21
19 0.2
20 0.18
21 0.17
22 0.11
23 0.09
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.13
36 0.15
37 0.16
38 0.19
39 0.19
40 0.2
41 0.2
42 0.22
43 0.24
44 0.23
45 0.25
46 0.28
47 0.29
48 0.3
49 0.3
50 0.29
51 0.23
52 0.21
53 0.18
54 0.13
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.15
75 0.15
76 0.11
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.13
84 0.13
85 0.11
86 0.11
87 0.09
88 0.11
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.16
93 0.17
94 0.18
95 0.16
96 0.15
97 0.18
98 0.19
99 0.21
100 0.21
101 0.21
102 0.2
103 0.2
104 0.19
105 0.13
106 0.11
107 0.09
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.1
116 0.1
117 0.12
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.16
122 0.17
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.15
128 0.13
129 0.14
130 0.15
131 0.15
132 0.17
133 0.15
134 0.15
135 0.16
136 0.2
137 0.2
138 0.21
139 0.21
140 0.21
141 0.23
142 0.23
143 0.23
144 0.23
145 0.22
146 0.23
147 0.27
148 0.27
149 0.25
150 0.24
151 0.23
152 0.2
153 0.2
154 0.16
155 0.13
156 0.13
157 0.18
158 0.23
159 0.23
160 0.22
161 0.21
162 0.23
163 0.21
164 0.21
165 0.15
166 0.16
167 0.16
168 0.18
169 0.18
170 0.17
171 0.17
172 0.17
173 0.17
174 0.15
175 0.14
176 0.12
177 0.19
178 0.18
179 0.18
180 0.16
181 0.16
182 0.14
183 0.14
184 0.16
185 0.09
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.06
208 0.08
209 0.09
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.18
216 0.2
217 0.2
218 0.18
219 0.18
220 0.2
221 0.2
222 0.22
223 0.23
224 0.26
225 0.24
226 0.24
227 0.27
228 0.25
229 0.24
230 0.24
231 0.2
232 0.15
233 0.2
234 0.26
235 0.28
236 0.33
237 0.34
238 0.34
239 0.38
240 0.4
241 0.42
242 0.45
243 0.46
244 0.48
245 0.54
246 0.57
247 0.53
248 0.59
249 0.57
250 0.53
251 0.5
252 0.49
253 0.47
254 0.46
255 0.51
256 0.42
257 0.4
258 0.37
259 0.36
260 0.29
261 0.23
262 0.22
263 0.17
264 0.16
265 0.15
266 0.11
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.09
286 0.08
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.12
295 0.11
296 0.13
297 0.14
298 0.16
299 0.19
300 0.19
301 0.22
302 0.23
303 0.25
304 0.25
305 0.26
306 0.25
307 0.21
308 0.19
309 0.17
310 0.14
311 0.16
312 0.18
313 0.15
314 0.15
315 0.15
316 0.16
317 0.15
318 0.15
319 0.11
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.08
324 0.07
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.13
331 0.14
332 0.18
333 0.19
334 0.24
335 0.28
336 0.36
337 0.45
338 0.48
339 0.54
340 0.51
341 0.51
342 0.45
343 0.44
344 0.35
345 0.26
346 0.2
347 0.13
348 0.12
349 0.1
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.05
366 0.06
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.09
373 0.12
374 0.12
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.11
385 0.18
386 0.18
387 0.17
388 0.18
389 0.18
390 0.19
391 0.18
392 0.17
393 0.13
394 0.13
395 0.12
396 0.12
397 0.11
398 0.1
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.11
403 0.12
404 0.14
405 0.18
406 0.19
407 0.22
408 0.25
409 0.25
410 0.26
411 0.31
412 0.34
413 0.32
414 0.31
415 0.26
416 0.24
417 0.23
418 0.23
419 0.17
420 0.11
421 0.09
422 0.09
423 0.08
424 0.07
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.05
433 0.05
434 0.04
435 0.04
436 0.05
437 0.06
438 0.07
439 0.17
440 0.2
441 0.28
442 0.36
443 0.38
444 0.45
445 0.48
446 0.5
447 0.46
448 0.46
449 0.42
450 0.34
451 0.33
452 0.26
453 0.22
454 0.19
455 0.14
456 0.1
457 0.07
458 0.06
459 0.05
460 0.05
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.05
475 0.05
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.09
482 0.1
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.14
487 0.18
488 0.19
489 0.19
490 0.19
491 0.17
492 0.18
493 0.19
494 0.22
495 0.2
496 0.22
497 0.22
498 0.26
499 0.26
500 0.26
501 0.3
502 0.3
503 0.35
504 0.37
505 0.39
506 0.43
507 0.47
508 0.5
509 0.47
510 0.44
511 0.39
512 0.44
513 0.43
514 0.35
515 0.4
516 0.36
517 0.34
518 0.38
519 0.37
520 0.3
521 0.29
522 0.37
523 0.38
524 0.41
525 0.4
526 0.35
527 0.32
528 0.32
529 0.33
530 0.26
531 0.16
532 0.12
533 0.11
534 0.11
535 0.16
536 0.19
537 0.19
538 0.21
539 0.22
540 0.24
541 0.24
542 0.26
543 0.24
544 0.27
545 0.26
546 0.24
547 0.31
548 0.3
549 0.35
550 0.39
551 0.38
552 0.33
553 0.36
554 0.37
555 0.3
556 0.31
557 0.27
558 0.24
559 0.22
560 0.19
561 0.16
562 0.14
563 0.14
564 0.12
565 0.13
566 0.11
567 0.11
568 0.11
569 0.1
570 0.11
571 0.09
572 0.11
573 0.08
574 0.08
575 0.08
576 0.07
577 0.07
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.07
582 0.08
583 0.09
584 0.12
585 0.13
586 0.15
587 0.17
588 0.2
589 0.25
590 0.3
591 0.37
592 0.41
593 0.45
594 0.45
595 0.49
596 0.44
597 0.43
598 0.42
599 0.36
600 0.3
601 0.25
602 0.24
603 0.2
604 0.22
605 0.22
606 0.2
607 0.2
608 0.26
609 0.33
610 0.41
611 0.5
612 0.57
613 0.6
614 0.68
615 0.74
616 0.78
617 0.77
618 0.78
619 0.75
620 0.72
621 0.69
622 0.68
623 0.65
624 0.67
625 0.72
626 0.72
627 0.74
628 0.76
629 0.81
630 0.85
631 0.89
632 0.88
633 0.88
634 0.88
635 0.85
636 0.82
637 0.75
638 0.68
639 0.6
640 0.54
641 0.46
642 0.41
643 0.35
644 0.32
645 0.3
646 0.3
647 0.3
648 0.29
649 0.28
650 0.29
651 0.3
652 0.32
653 0.31
654 0.3
655 0.29
656 0.31
657 0.37
658 0.34
659 0.38
660 0.4
661 0.42
662 0.39
663 0.42
664 0.44
665 0.4
666 0.47
667 0.44
668 0.48
669 0.47
670 0.47
671 0.43
672 0.39
673 0.36
674 0.33
675 0.34
676 0.27
677 0.34
678 0.4
679 0.47
680 0.52
681 0.58
682 0.61
683 0.65
684 0.75
685 0.74
686 0.76
687 0.74
688 0.68
689 0.69
690 0.68
691 0.61
692 0.52
693 0.46
694 0.45
695 0.47
696 0.48
697 0.44
698 0.38
699 0.45
700 0.44
701 0.41
702 0.33
703 0.27
704 0.22
705 0.18
706 0.17
707 0.11
708 0.13
709 0.14
710 0.14
711 0.15
712 0.17
713 0.18
714 0.2
715 0.25
716 0.31
717 0.36
718 0.44
719 0.47
720 0.52
721 0.6
722 0.64
723 0.63
724 0.63
725 0.61
726 0.61
727 0.6
728 0.59
729 0.56
730 0.58
731 0.62
732 0.58
733 0.6
734 0.54
735 0.53
736 0.52
737 0.49
738 0.44
739 0.36
740 0.34
741 0.34
742 0.39
743 0.38
744 0.33
745 0.3
746 0.25
747 0.25
748 0.28
749 0.23
750 0.18
751 0.19
752 0.21
753 0.21
754 0.26
755 0.3
756 0.3
757 0.33
758 0.35
759 0.39
760 0.38
761 0.45
762 0.43
763 0.42
764 0.37
765 0.33
766 0.38