Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162TRS4

Protein Details
Accession A0A162TRS4    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
165-201AELKREEDEERRRRKEKKRQKKEAKKRKAEDEPEDAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-56ARAKLREEREREHAKNAERKRQGLPPIRKKE
174-192ERRRRKEKKRQKKEAKKRK
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12874  zf-met  
Amino Acid Sequences MSSAYGSGKAQDTDFRKKWDKDEYAARAKLREEREREHAKNAERKRQGLPPIRKKEEEEEPRELLKPREEKVVLDANLGKTVVVQGGASGEASRQPGFYCKACDIVVKDSANYLDHINGRKHQKNIGISMKVERASIDSVKERLAMLKRKKEEPEKEYDLDSRVAELKREEDEERRRRKEKKRQKKEAKKRKAEDEPEDAADISEMMGFSGFGSSKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.53
4 0.55
5 0.61
6 0.63
7 0.62
8 0.58
9 0.64
10 0.65
11 0.65
12 0.66
13 0.61
14 0.53
15 0.51
16 0.52
17 0.5
18 0.5
19 0.47
20 0.48
21 0.56
22 0.63
23 0.62
24 0.63
25 0.61
26 0.6
27 0.64
28 0.66
29 0.67
30 0.63
31 0.64
32 0.6
33 0.61
34 0.63
35 0.64
36 0.67
37 0.68
38 0.73
39 0.75
40 0.73
41 0.69
42 0.65
43 0.65
44 0.64
45 0.59
46 0.54
47 0.51
48 0.5
49 0.49
50 0.45
51 0.37
52 0.35
53 0.33
54 0.29
55 0.34
56 0.33
57 0.31
58 0.34
59 0.39
60 0.32
61 0.29
62 0.3
63 0.23
64 0.23
65 0.22
66 0.18
67 0.1
68 0.1
69 0.08
70 0.06
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.1
84 0.13
85 0.14
86 0.15
87 0.15
88 0.17
89 0.17
90 0.18
91 0.17
92 0.17
93 0.2
94 0.18
95 0.17
96 0.15
97 0.16
98 0.15
99 0.13
100 0.11
101 0.09
102 0.11
103 0.15
104 0.16
105 0.21
106 0.28
107 0.32
108 0.33
109 0.34
110 0.37
111 0.37
112 0.43
113 0.44
114 0.38
115 0.34
116 0.35
117 0.34
118 0.29
119 0.26
120 0.19
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.16
125 0.15
126 0.16
127 0.16
128 0.17
129 0.15
130 0.17
131 0.23
132 0.29
133 0.35
134 0.43
135 0.47
136 0.52
137 0.59
138 0.64
139 0.67
140 0.63
141 0.63
142 0.61
143 0.58
144 0.55
145 0.5
146 0.42
147 0.35
148 0.3
149 0.22
150 0.21
151 0.2
152 0.19
153 0.19
154 0.19
155 0.19
156 0.23
157 0.24
158 0.27
159 0.38
160 0.46
161 0.55
162 0.61
163 0.67
164 0.73
165 0.82
166 0.84
167 0.85
168 0.87
169 0.88
170 0.91
171 0.95
172 0.97
173 0.97
174 0.97
175 0.97
176 0.96
177 0.93
178 0.92
179 0.91
180 0.88
181 0.84
182 0.8
183 0.73
184 0.64
185 0.58
186 0.47
187 0.37
188 0.28
189 0.2
190 0.13
191 0.09
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.08