Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162THH4

Protein Details
Accession A0A162THH4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
428-460GDLEWEQHKKSRWHRKSSKRKRMEELTANKPPLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
436-449KKSRWHRKSSKRKR
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 9.5, nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MRKILSVIGTTGVGKSNLAVDLCRTLRGQAINSDAMQASQVYKGLDIITNKMPLEERHGVTHHLMDFLDPEDEYKVTEFKRDATQCIEKLSNENQLPVLVGGTNYYMQSLLWRNTLIKETNGESDEEEDRSRSRSPSPEIVPELEVLETPELYDRLKQVDPIMATKWHVSDRRKIMRSLQIFHATGKPQSEIIKEQKAQKETHGAQPRFKALVFWLYADPVALYPRLDERVDKMIETGLFEEIKDLRRRVVAGSITLPGQELEKYQRGLWQAIGYKEFDPYFTAVEENTLEEPDTSPKFKLSELKKIKDECTERMKAATRRYARRQVQWIRNKFLPSVFDSKGDVLVYLLDAGDLDAWNTNVQQKAIDVARAFLEDRPMPDPASFGDVAAKMLSKSDAEDTHARVLNWKKHVCPVCITNKGEVAIMNGDLEWEQHKKSRWHRKSSKRKRMEELTANKPPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.13
4 0.15
5 0.14
6 0.14
7 0.14
8 0.21
9 0.22
10 0.23
11 0.22
12 0.21
13 0.25
14 0.28
15 0.28
16 0.26
17 0.3
18 0.3
19 0.3
20 0.31
21 0.26
22 0.23
23 0.21
24 0.17
25 0.13
26 0.12
27 0.14
28 0.11
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.16
33 0.17
34 0.2
35 0.22
36 0.25
37 0.25
38 0.25
39 0.26
40 0.23
41 0.3
42 0.33
43 0.3
44 0.32
45 0.33
46 0.35
47 0.34
48 0.37
49 0.29
50 0.24
51 0.22
52 0.18
53 0.18
54 0.16
55 0.15
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.15
63 0.14
64 0.2
65 0.19
66 0.21
67 0.3
68 0.32
69 0.34
70 0.37
71 0.43
72 0.39
73 0.44
74 0.43
75 0.34
76 0.37
77 0.38
78 0.39
79 0.33
80 0.32
81 0.28
82 0.25
83 0.25
84 0.2
85 0.17
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.12
96 0.16
97 0.16
98 0.17
99 0.18
100 0.19
101 0.21
102 0.26
103 0.23
104 0.2
105 0.21
106 0.22
107 0.24
108 0.24
109 0.23
110 0.19
111 0.2
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.15
116 0.15
117 0.17
118 0.19
119 0.18
120 0.21
121 0.25
122 0.3
123 0.37
124 0.39
125 0.41
126 0.41
127 0.41
128 0.37
129 0.31
130 0.27
131 0.19
132 0.16
133 0.11
134 0.09
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.1
141 0.1
142 0.13
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.18
147 0.19
148 0.19
149 0.2
150 0.17
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.19
155 0.25
156 0.26
157 0.33
158 0.41
159 0.5
160 0.51
161 0.51
162 0.53
163 0.55
164 0.56
165 0.51
166 0.46
167 0.42
168 0.4
169 0.4
170 0.38
171 0.3
172 0.28
173 0.25
174 0.21
175 0.17
176 0.18
177 0.19
178 0.2
179 0.24
180 0.29
181 0.31
182 0.37
183 0.4
184 0.42
185 0.41
186 0.37
187 0.41
188 0.36
189 0.42
190 0.46
191 0.42
192 0.42
193 0.44
194 0.44
195 0.36
196 0.34
197 0.26
198 0.17
199 0.2
200 0.17
201 0.16
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.11
207 0.06
208 0.07
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.07
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.12
217 0.17
218 0.17
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.13
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.13
231 0.16
232 0.16
233 0.15
234 0.16
235 0.17
236 0.17
237 0.2
238 0.17
239 0.15
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.13
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.11
250 0.13
251 0.14
252 0.14
253 0.18
254 0.19
255 0.2
256 0.19
257 0.19
258 0.2
259 0.2
260 0.21
261 0.2
262 0.18
263 0.19
264 0.18
265 0.15
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.1
270 0.1
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.12
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.15
285 0.16
286 0.18
287 0.25
288 0.26
289 0.35
290 0.42
291 0.47
292 0.51
293 0.54
294 0.55
295 0.55
296 0.54
297 0.49
298 0.49
299 0.47
300 0.42
301 0.42
302 0.47
303 0.43
304 0.46
305 0.49
306 0.49
307 0.54
308 0.62
309 0.68
310 0.67
311 0.69
312 0.73
313 0.74
314 0.76
315 0.78
316 0.77
317 0.72
318 0.7
319 0.65
320 0.56
321 0.49
322 0.42
323 0.36
324 0.36
325 0.31
326 0.29
327 0.28
328 0.27
329 0.26
330 0.23
331 0.18
332 0.11
333 0.1
334 0.08
335 0.07
336 0.06
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.11
348 0.12
349 0.13
350 0.13
351 0.12
352 0.16
353 0.17
354 0.2
355 0.16
356 0.16
357 0.17
358 0.17
359 0.18
360 0.15
361 0.19
362 0.17
363 0.19
364 0.21
365 0.21
366 0.21
367 0.2
368 0.2
369 0.16
370 0.2
371 0.17
372 0.15
373 0.17
374 0.16
375 0.17
376 0.16
377 0.16
378 0.11
379 0.12
380 0.13
381 0.09
382 0.11
383 0.15
384 0.15
385 0.2
386 0.24
387 0.26
388 0.32
389 0.35
390 0.33
391 0.36
392 0.43
393 0.46
394 0.51
395 0.52
396 0.48
397 0.54
398 0.61
399 0.57
400 0.54
401 0.55
402 0.55
403 0.59
404 0.59
405 0.53
406 0.5
407 0.47
408 0.42
409 0.34
410 0.27
411 0.2
412 0.18
413 0.15
414 0.12
415 0.12
416 0.11
417 0.12
418 0.12
419 0.14
420 0.16
421 0.21
422 0.29
423 0.37
424 0.48
425 0.59
426 0.65
427 0.73
428 0.81
429 0.87
430 0.92
431 0.94
432 0.95
433 0.94
434 0.93
435 0.91
436 0.9
437 0.89
438 0.88
439 0.85
440 0.84