Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162YC85

Protein Details
Accession A0A162YC85    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
344-374GTTSVDPKVKPKKPRVKRKPKPKDPEDANAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
350-382PKVKPKKPRVKRKPKPKDPEDANAPPKPKRKTG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019835  SWIB_domain  
IPR036885  SWIB_MDM2_dom_sf  
IPR003121  SWIB_MDM2_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF02201  SWIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51925  SWIB_MDM2  
CDD cd10567  SWIB-MDM2_like  
Amino Acid Sequences MNSVVSDVPLSVPIKDLQTRTVPSHSSFEYNGEIWCVKGVGYYLPECQRSRSNMSATAYESTIPTHYAQTHAQTHAQTPSTAVTCGEAVGPGFLDESLNLNPYQQFEKFSFDDLVVSNSLEQQMRTIEHTNTNININLSTNTQPQPQPQPQPQPQPQSQSQPQPQLQSQLQSQPQSQSQFMDQMFSHPENVPTHHMSKCSYQIPQFTDPVFDDNQPQNASLVYSADSIGAHTPESHVFQRRVEYTSPHCTVESQTMVDYPFYNPCAAIQDYPVTQPFSALTSLDMGRSPSVTGHMYSPYMMQNSPHTAHSPSPYPTPRSPSHVIDTSHDPPRTKRAYKRKTEDGTTSVDPKVKPKKPRVKRKPKPKDPEDANAPPKPKRKTGLNKPLIPSPALSAVLGGDTELSRPEIVKKLWFYIKSNELQDPVDRRFILCDHKLRSLFGQDRINSFRMNRDLSAHLTNTTIDTHSQFDFKSKDEFCLGVLFDQKNDLVPVVCVSPTGTADTPDVMTPMEGYHV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.27
4 0.27
5 0.33
6 0.37
7 0.39
8 0.42
9 0.41
10 0.39
11 0.43
12 0.4
13 0.37
14 0.34
15 0.33
16 0.31
17 0.29
18 0.26
19 0.24
20 0.22
21 0.18
22 0.18
23 0.15
24 0.11
25 0.11
26 0.12
27 0.11
28 0.15
29 0.17
30 0.22
31 0.27
32 0.33
33 0.33
34 0.36
35 0.4
36 0.42
37 0.48
38 0.48
39 0.47
40 0.48
41 0.5
42 0.48
43 0.44
44 0.4
45 0.33
46 0.27
47 0.23
48 0.19
49 0.17
50 0.16
51 0.14
52 0.16
53 0.16
54 0.19
55 0.21
56 0.26
57 0.3
58 0.31
59 0.33
60 0.31
61 0.33
62 0.35
63 0.34
64 0.27
65 0.24
66 0.25
67 0.22
68 0.21
69 0.18
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.09
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.09
84 0.09
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.15
90 0.18
91 0.16
92 0.19
93 0.19
94 0.25
95 0.24
96 0.26
97 0.25
98 0.21
99 0.22
100 0.19
101 0.2
102 0.14
103 0.14
104 0.11
105 0.11
106 0.14
107 0.13
108 0.12
109 0.11
110 0.13
111 0.14
112 0.17
113 0.19
114 0.19
115 0.23
116 0.26
117 0.27
118 0.26
119 0.27
120 0.25
121 0.22
122 0.2
123 0.17
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.19
128 0.19
129 0.23
130 0.24
131 0.28
132 0.36
133 0.4
134 0.45
135 0.48
136 0.57
137 0.59
138 0.68
139 0.7
140 0.69
141 0.66
142 0.65
143 0.61
144 0.6
145 0.59
146 0.58
147 0.56
148 0.57
149 0.56
150 0.53
151 0.5
152 0.48
153 0.43
154 0.37
155 0.34
156 0.32
157 0.33
158 0.31
159 0.31
160 0.29
161 0.31
162 0.31
163 0.29
164 0.24
165 0.21
166 0.24
167 0.22
168 0.22
169 0.18
170 0.17
171 0.21
172 0.2
173 0.21
174 0.16
175 0.2
176 0.19
177 0.21
178 0.23
179 0.23
180 0.26
181 0.25
182 0.25
183 0.24
184 0.26
185 0.28
186 0.27
187 0.26
188 0.26
189 0.29
190 0.33
191 0.34
192 0.33
193 0.28
194 0.27
195 0.25
196 0.25
197 0.21
198 0.17
199 0.18
200 0.18
201 0.21
202 0.19
203 0.19
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.1
208 0.09
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.1
222 0.13
223 0.17
224 0.17
225 0.18
226 0.22
227 0.23
228 0.24
229 0.23
230 0.24
231 0.24
232 0.3
233 0.31
234 0.28
235 0.26
236 0.24
237 0.24
238 0.24
239 0.2
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.12
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.06
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.11
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.13
290 0.16
291 0.18
292 0.17
293 0.17
294 0.18
295 0.2
296 0.21
297 0.22
298 0.2
299 0.25
300 0.27
301 0.31
302 0.32
303 0.37
304 0.36
305 0.4
306 0.42
307 0.39
308 0.4
309 0.4
310 0.39
311 0.35
312 0.4
313 0.37
314 0.39
315 0.38
316 0.35
317 0.32
318 0.39
319 0.44
320 0.45
321 0.5
322 0.55
323 0.63
324 0.72
325 0.77
326 0.79
327 0.76
328 0.74
329 0.69
330 0.6
331 0.56
332 0.48
333 0.43
334 0.35
335 0.33
336 0.29
337 0.33
338 0.4
339 0.42
340 0.49
341 0.57
342 0.66
343 0.73
344 0.84
345 0.87
346 0.88
347 0.92
348 0.94
349 0.95
350 0.95
351 0.95
352 0.9
353 0.89
354 0.84
355 0.82
356 0.79
357 0.76
358 0.72
359 0.66
360 0.63
361 0.59
362 0.61
363 0.57
364 0.54
365 0.52
366 0.56
367 0.62
368 0.7
369 0.74
370 0.75
371 0.77
372 0.73
373 0.73
374 0.64
375 0.54
376 0.43
377 0.34
378 0.28
379 0.22
380 0.19
381 0.14
382 0.12
383 0.11
384 0.1
385 0.08
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.12
394 0.17
395 0.18
396 0.24
397 0.25
398 0.31
399 0.37
400 0.39
401 0.4
402 0.41
403 0.46
404 0.46
405 0.47
406 0.43
407 0.39
408 0.37
409 0.39
410 0.38
411 0.34
412 0.35
413 0.31
414 0.29
415 0.3
416 0.31
417 0.34
418 0.35
419 0.4
420 0.38
421 0.46
422 0.47
423 0.46
424 0.46
425 0.48
426 0.45
427 0.44
428 0.48
429 0.42
430 0.47
431 0.5
432 0.49
433 0.42
434 0.38
435 0.39
436 0.37
437 0.39
438 0.34
439 0.33
440 0.35
441 0.37
442 0.4
443 0.34
444 0.29
445 0.26
446 0.25
447 0.22
448 0.21
449 0.18
450 0.15
451 0.16
452 0.18
453 0.18
454 0.2
455 0.19
456 0.23
457 0.24
458 0.24
459 0.3
460 0.29
461 0.31
462 0.32
463 0.32
464 0.27
465 0.28
466 0.27
467 0.22
468 0.27
469 0.24
470 0.22
471 0.24
472 0.23
473 0.21
474 0.21
475 0.19
476 0.13
477 0.13
478 0.15
479 0.14
480 0.13
481 0.12
482 0.12
483 0.13
484 0.14
485 0.17
486 0.16
487 0.17
488 0.18
489 0.19
490 0.2
491 0.18
492 0.17
493 0.13
494 0.12
495 0.11