Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162TJ38

Protein Details
Accession A0A162TJ38    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
271-295LITVGVRKPRPTKKRKADGYISSGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-286RKPRPTKKRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.333, cyto 6, cyto_mito 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Amino Acid Sequences MIYTVIPTSNVVDENGAPEPMKYIINQDEFIVEAIATHSEYLKNVTFSEFSSACPMQIDRPKDDDIRMKEANVKRDSVYYTFQDKIEKCMSTSAAAKQLGIHVRTAQRWVKQYNMCPDNIFVNCNRVGRKCILTEEHKNVVINFIDTNPSATVVEETEHLLKRLSDLKVSRRTVYNFMRNKRNLSLKKADFHSIGRNSPAKIEKRFDWVRKWENTDMNFLTNCVFLDESAFDINMKRSRAWTQKGTRAIFTRPITRVNTAPILGDIYASGLITVGVRKPRPTKKRKADGYISSGTVTSH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.16
4 0.14
5 0.13
6 0.15
7 0.14
8 0.15
9 0.12
10 0.17
11 0.23
12 0.26
13 0.27
14 0.25
15 0.24
16 0.23
17 0.23
18 0.18
19 0.1
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.13
29 0.15
30 0.15
31 0.16
32 0.18
33 0.17
34 0.17
35 0.23
36 0.19
37 0.18
38 0.23
39 0.23
40 0.21
41 0.21
42 0.21
43 0.23
44 0.29
45 0.33
46 0.3
47 0.34
48 0.38
49 0.38
50 0.42
51 0.43
52 0.41
53 0.44
54 0.41
55 0.38
56 0.43
57 0.45
58 0.5
59 0.43
60 0.4
61 0.34
62 0.36
63 0.38
64 0.32
65 0.32
66 0.26
67 0.29
68 0.29
69 0.29
70 0.33
71 0.3
72 0.33
73 0.33
74 0.3
75 0.26
76 0.27
77 0.27
78 0.22
79 0.25
80 0.22
81 0.23
82 0.23
83 0.22
84 0.2
85 0.23
86 0.25
87 0.23
88 0.21
89 0.19
90 0.22
91 0.23
92 0.29
93 0.28
94 0.28
95 0.33
96 0.34
97 0.37
98 0.39
99 0.44
100 0.47
101 0.45
102 0.42
103 0.37
104 0.36
105 0.33
106 0.29
107 0.25
108 0.16
109 0.17
110 0.18
111 0.2
112 0.21
113 0.19
114 0.21
115 0.22
116 0.25
117 0.22
118 0.23
119 0.25
120 0.29
121 0.34
122 0.36
123 0.36
124 0.34
125 0.33
126 0.3
127 0.28
128 0.22
129 0.16
130 0.11
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.06
143 0.07
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.11
150 0.16
151 0.16
152 0.17
153 0.21
154 0.28
155 0.37
156 0.39
157 0.39
158 0.37
159 0.39
160 0.42
161 0.46
162 0.48
163 0.46
164 0.49
165 0.57
166 0.56
167 0.57
168 0.55
169 0.58
170 0.53
171 0.54
172 0.58
173 0.52
174 0.55
175 0.54
176 0.51
177 0.43
178 0.4
179 0.41
180 0.35
181 0.33
182 0.32
183 0.32
184 0.29
185 0.32
186 0.37
187 0.34
188 0.36
189 0.38
190 0.36
191 0.42
192 0.49
193 0.49
194 0.5
195 0.53
196 0.56
197 0.57
198 0.62
199 0.59
200 0.58
201 0.55
202 0.54
203 0.46
204 0.41
205 0.36
206 0.29
207 0.24
208 0.18
209 0.16
210 0.11
211 0.1
212 0.07
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.1
220 0.15
221 0.18
222 0.19
223 0.19
224 0.22
225 0.3
226 0.39
227 0.44
228 0.49
229 0.53
230 0.6
231 0.67
232 0.66
233 0.63
234 0.58
235 0.55
236 0.53
237 0.49
238 0.48
239 0.42
240 0.46
241 0.44
242 0.44
243 0.42
244 0.39
245 0.38
246 0.31
247 0.29
248 0.24
249 0.22
250 0.19
251 0.17
252 0.12
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.08
261 0.11
262 0.18
263 0.21
264 0.28
265 0.37
266 0.48
267 0.59
268 0.67
269 0.74
270 0.78
271 0.87
272 0.9
273 0.9
274 0.89
275 0.86
276 0.83
277 0.77
278 0.67
279 0.57