Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A163BBS8

Protein Details
Accession A0A163BBS8    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-77ETTETSKGKRKRTTTQSKVTVTHydrophilic
245-272KMANNGFTERKKKKNKKKPLDPPYTQTFHydrophilic
348-369AQDTKKQIIQRETRSRDRKESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-167KALKRR
238-263KKMAKKAKMANNGFTERKKKKNKKKP
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPKRKTRAAAAAAAAAAEDTTTTTTLDKKETETPVVSQKSIPTKTETITETIVEETTETSKGKRKRTTTQSKVTVTVDNSAQDASEESEQNVGSDDTKMIESNDKTNENEKSQNLESGSTTSVNNNNDENSTDNSNDDNNDDEAQPATPKGALAERMEKLKALKRRRVTEVEQGNRRDRNLEFQRSKENPRLDARNERKKQESLKLKEKQDAKDNGEDYERKQFWKYSAESVDSWEKKMAKKAKMANNGFTERKKKKNKKKPLDPPYTQTFTLLLFVDHTQAAHKKYIKLMSDFKPDMNSYAEKKLESIERAIRNGEDPSDFASAANNLEYASVTDKTSKEAIERLAQDTKKQIIQRETRSRDRKESSDDISWINEKNRVFNQKISRFYDKYTREIRENLERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.3
3 0.19
4 0.13
5 0.07
6 0.06
7 0.04
8 0.06
9 0.07
10 0.08
11 0.09
12 0.13
13 0.16
14 0.2
15 0.21
16 0.24
17 0.31
18 0.35
19 0.39
20 0.37
21 0.38
22 0.43
23 0.45
24 0.42
25 0.36
26 0.38
27 0.42
28 0.43
29 0.42
30 0.39
31 0.39
32 0.39
33 0.43
34 0.38
35 0.32
36 0.3
37 0.28
38 0.23
39 0.21
40 0.2
41 0.14
42 0.12
43 0.11
44 0.11
45 0.13
46 0.13
47 0.15
48 0.23
49 0.3
50 0.4
51 0.47
52 0.52
53 0.6
54 0.71
55 0.79
56 0.8
57 0.83
58 0.83
59 0.77
60 0.74
61 0.66
62 0.6
63 0.5
64 0.44
65 0.35
66 0.27
67 0.24
68 0.2
69 0.17
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.12
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.16
89 0.17
90 0.21
91 0.25
92 0.27
93 0.28
94 0.33
95 0.36
96 0.34
97 0.38
98 0.34
99 0.35
100 0.34
101 0.35
102 0.3
103 0.28
104 0.24
105 0.21
106 0.21
107 0.16
108 0.16
109 0.15
110 0.19
111 0.2
112 0.21
113 0.2
114 0.19
115 0.19
116 0.19
117 0.19
118 0.17
119 0.17
120 0.16
121 0.16
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.11
141 0.13
142 0.18
143 0.19
144 0.21
145 0.21
146 0.21
147 0.22
148 0.26
149 0.32
150 0.35
151 0.42
152 0.47
153 0.53
154 0.58
155 0.61
156 0.6
157 0.6
158 0.61
159 0.61
160 0.6
161 0.59
162 0.58
163 0.53
164 0.49
165 0.43
166 0.34
167 0.36
168 0.38
169 0.43
170 0.41
171 0.41
172 0.5
173 0.51
174 0.55
175 0.52
176 0.47
177 0.42
178 0.44
179 0.47
180 0.41
181 0.48
182 0.53
183 0.56
184 0.58
185 0.56
186 0.56
187 0.55
188 0.56
189 0.54
190 0.56
191 0.52
192 0.58
193 0.62
194 0.6
195 0.61
196 0.62
197 0.56
198 0.55
199 0.54
200 0.48
201 0.46
202 0.44
203 0.39
204 0.37
205 0.35
206 0.28
207 0.31
208 0.28
209 0.24
210 0.25
211 0.25
212 0.25
213 0.3
214 0.3
215 0.27
216 0.28
217 0.29
218 0.28
219 0.3
220 0.36
221 0.3
222 0.29
223 0.27
224 0.27
225 0.26
226 0.34
227 0.38
228 0.35
229 0.41
230 0.49
231 0.54
232 0.62
233 0.63
234 0.6
235 0.58
236 0.58
237 0.54
238 0.51
239 0.52
240 0.48
241 0.56
242 0.61
243 0.67
244 0.73
245 0.81
246 0.87
247 0.89
248 0.93
249 0.94
250 0.94
251 0.94
252 0.86
253 0.81
254 0.77
255 0.7
256 0.58
257 0.48
258 0.38
259 0.28
260 0.26
261 0.2
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.15
270 0.17
271 0.21
272 0.24
273 0.25
274 0.3
275 0.36
276 0.37
277 0.38
278 0.43
279 0.43
280 0.49
281 0.48
282 0.44
283 0.41
284 0.38
285 0.35
286 0.31
287 0.29
288 0.24
289 0.29
290 0.3
291 0.26
292 0.26
293 0.27
294 0.28
295 0.27
296 0.28
297 0.3
298 0.32
299 0.33
300 0.34
301 0.32
302 0.29
303 0.28
304 0.25
305 0.18
306 0.15
307 0.17
308 0.17
309 0.17
310 0.15
311 0.15
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.1
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.16
324 0.17
325 0.2
326 0.22
327 0.21
328 0.2
329 0.23
330 0.25
331 0.28
332 0.3
333 0.32
334 0.38
335 0.38
336 0.38
337 0.4
338 0.41
339 0.4
340 0.41
341 0.44
342 0.45
343 0.54
344 0.61
345 0.66
346 0.7
347 0.75
348 0.81
349 0.8
350 0.8
351 0.78
352 0.73
353 0.7
354 0.69
355 0.65
356 0.61
357 0.57
358 0.49
359 0.46
360 0.43
361 0.39
362 0.35
363 0.34
364 0.29
365 0.33
366 0.39
367 0.44
368 0.45
369 0.5
370 0.57
371 0.61
372 0.68
373 0.69
374 0.7
375 0.63
376 0.65
377 0.67
378 0.6
379 0.6
380 0.61
381 0.59
382 0.55
383 0.58
384 0.6
385 0.6
386 0.61
387 0.54