Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162UPJ5

Protein Details
Accession A0A162UPJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-251AMEQWNRVRRPKKKQKWNSLEREQKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-244VRRPKKKQKWNS
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 10.5, cyto 7, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASAKLMAKLHADQSAVAQLAEFHSRQGSSVVGKSASRKAPIARPVSQPQSTEPTQRLSRRDEKDLIQRHANEPPSLVLHLYPTYFKFEHEDGFFSYKSQFKILIDFLSSIKNKQLPADLMDVFDEASCRYYEGCLIVEIHDHRSPKKFHTNGQNGSQSDSETQVKRLAMQPTAESLWTDIHLLSEEWGFPWTEQVAVEVEAKILLATEEPLCLDPSFQVSRISNAMEQWNRVRRPKKKQKWNSLEREQKLAKKAEDVKAMTIMDTRAKREFPFEPSFGKISFVQDWRSKKHKQSEEPLGAVEVKKSKGRKVLVEPPAGLDGRKCVRTIRFERNEDHRKVYTVINIYAQGETFDGVFCWGTTPDTSLNGGNIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.23
4 0.19
5 0.16
6 0.13
7 0.15
8 0.19
9 0.17
10 0.14
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.17
15 0.17
16 0.17
17 0.2
18 0.21
19 0.21
20 0.23
21 0.26
22 0.33
23 0.35
24 0.34
25 0.35
26 0.38
27 0.44
28 0.51
29 0.53
30 0.51
31 0.53
32 0.58
33 0.62
34 0.6
35 0.53
36 0.49
37 0.49
38 0.47
39 0.45
40 0.4
41 0.39
42 0.43
43 0.48
44 0.49
45 0.5
46 0.57
47 0.57
48 0.62
49 0.6
50 0.58
51 0.62
52 0.66
53 0.62
54 0.6
55 0.57
56 0.53
57 0.55
58 0.53
59 0.43
60 0.35
61 0.32
62 0.27
63 0.24
64 0.21
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.15
70 0.14
71 0.19
72 0.19
73 0.2
74 0.22
75 0.22
76 0.25
77 0.25
78 0.26
79 0.22
80 0.26
81 0.25
82 0.21
83 0.23
84 0.22
85 0.22
86 0.21
87 0.21
88 0.18
89 0.22
90 0.23
91 0.21
92 0.18
93 0.18
94 0.17
95 0.22
96 0.22
97 0.19
98 0.21
99 0.23
100 0.22
101 0.22
102 0.26
103 0.21
104 0.23
105 0.26
106 0.22
107 0.2
108 0.2
109 0.18
110 0.14
111 0.12
112 0.1
113 0.06
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.12
126 0.13
127 0.16
128 0.17
129 0.18
130 0.2
131 0.25
132 0.27
133 0.31
134 0.4
135 0.38
136 0.41
137 0.51
138 0.58
139 0.56
140 0.6
141 0.6
142 0.5
143 0.49
144 0.43
145 0.33
146 0.25
147 0.24
148 0.21
149 0.16
150 0.17
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.22
155 0.22
156 0.2
157 0.2
158 0.19
159 0.18
160 0.18
161 0.17
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.1
204 0.11
205 0.12
206 0.14
207 0.14
208 0.16
209 0.17
210 0.18
211 0.14
212 0.15
213 0.21
214 0.18
215 0.21
216 0.25
217 0.32
218 0.34
219 0.42
220 0.49
221 0.52
222 0.62
223 0.72
224 0.76
225 0.8
226 0.86
227 0.9
228 0.92
229 0.93
230 0.91
231 0.9
232 0.89
233 0.8
234 0.77
235 0.7
236 0.64
237 0.6
238 0.55
239 0.45
240 0.43
241 0.48
242 0.45
243 0.48
244 0.44
245 0.39
246 0.38
247 0.37
248 0.29
249 0.24
250 0.2
251 0.19
252 0.2
253 0.21
254 0.21
255 0.23
256 0.23
257 0.27
258 0.29
259 0.3
260 0.34
261 0.34
262 0.34
263 0.35
264 0.36
265 0.31
266 0.31
267 0.25
268 0.23
269 0.26
270 0.25
271 0.27
272 0.32
273 0.37
274 0.41
275 0.47
276 0.5
277 0.54
278 0.62
279 0.66
280 0.69
281 0.73
282 0.77
283 0.76
284 0.7
285 0.62
286 0.53
287 0.45
288 0.37
289 0.31
290 0.24
291 0.21
292 0.25
293 0.28
294 0.32
295 0.38
296 0.42
297 0.46
298 0.51
299 0.58
300 0.61
301 0.63
302 0.58
303 0.52
304 0.51
305 0.44
306 0.35
307 0.26
308 0.25
309 0.25
310 0.26
311 0.25
312 0.26
313 0.32
314 0.42
315 0.5
316 0.54
317 0.58
318 0.61
319 0.67
320 0.72
321 0.76
322 0.7
323 0.69
324 0.6
325 0.54
326 0.51
327 0.48
328 0.45
329 0.4
330 0.37
331 0.33
332 0.33
333 0.31
334 0.3
335 0.26
336 0.2
337 0.15
338 0.13
339 0.11
340 0.09
341 0.07
342 0.08
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.12
348 0.12
349 0.15
350 0.16
351 0.18
352 0.2
353 0.2