Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162TJN9

Protein Details
Accession A0A162TJN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
275-304DHLHFTQNTKKQRRYKSKKNKTENNHNDDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-292RRYKSK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003316  E2F_WHTH_DNA-bd_dom  
IPR015648  Transcrpt_fac_DP  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005667  C:transcription regulator complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0051726  P:regulation of cell cycle  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02319  E2F_TDP  
Amino Acid Sequences MEPTYPSLHPLPNRLSPPTLPYTRHQSDNLNQHYNHHTNYKDYHHYNHTQHWRSHDLLQLQSLLCNKPQQDTNNHLPPLILLSSISSSTTTSTNNNSPYGGQSPSLSTSFSSSSSSSSSSSSSSPPLSSSSPSPSPAAESISTFPSPQQDQDFDLDHNKQHHWSPSPPSSSASDNVVVVDDSVRGIVSVTSLLNPVPELPEPKRKKNRSGYLSDARNQMPATKIAPNRSSSNILLKRGRPRQLTLNNTNMNMNMNSNNINSSIFGTSGTPPVAADHLHFTQNTKKQRRYKSKKNKTENNHNDDDDDNHIALDVSEDHRRLNKGLRHFSKQVCDKVAKRGTTTYNEIADELATDIRNSPQDNQPGCDQKNIRRRVYDALNVLTAINIIEKDKKEIKWLGIPGCTNTHSETAKREADLLREIEEEERCHIELTASVEAAREKLAQASLSQMFALPNCPTAFPCPSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.5
3 0.45
4 0.48
5 0.49
6 0.48
7 0.44
8 0.45
9 0.51
10 0.51
11 0.54
12 0.51
13 0.5
14 0.53
15 0.59
16 0.62
17 0.6
18 0.55
19 0.56
20 0.61
21 0.57
22 0.52
23 0.48
24 0.42
25 0.4
26 0.45
27 0.48
28 0.48
29 0.48
30 0.51
31 0.52
32 0.59
33 0.59
34 0.63
35 0.67
36 0.64
37 0.64
38 0.64
39 0.62
40 0.56
41 0.56
42 0.53
43 0.47
44 0.43
45 0.41
46 0.38
47 0.32
48 0.32
49 0.31
50 0.26
51 0.24
52 0.27
53 0.26
54 0.27
55 0.33
56 0.36
57 0.4
58 0.45
59 0.52
60 0.56
61 0.55
62 0.5
63 0.44
64 0.38
65 0.35
66 0.27
67 0.18
68 0.1
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.12
77 0.12
78 0.14
79 0.19
80 0.24
81 0.26
82 0.26
83 0.26
84 0.25
85 0.27
86 0.27
87 0.23
88 0.19
89 0.17
90 0.18
91 0.2
92 0.2
93 0.17
94 0.14
95 0.15
96 0.16
97 0.16
98 0.16
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.17
103 0.16
104 0.16
105 0.16
106 0.15
107 0.16
108 0.16
109 0.18
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.2
117 0.23
118 0.24
119 0.25
120 0.25
121 0.22
122 0.23
123 0.22
124 0.22
125 0.17
126 0.17
127 0.16
128 0.19
129 0.19
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.18
134 0.18
135 0.2
136 0.18
137 0.2
138 0.22
139 0.23
140 0.2
141 0.24
142 0.23
143 0.22
144 0.23
145 0.22
146 0.22
147 0.24
148 0.28
149 0.28
150 0.3
151 0.35
152 0.39
153 0.42
154 0.41
155 0.39
156 0.36
157 0.34
158 0.31
159 0.26
160 0.2
161 0.16
162 0.16
163 0.14
164 0.11
165 0.09
166 0.08
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.11
186 0.15
187 0.25
188 0.3
189 0.4
190 0.51
191 0.54
192 0.63
193 0.69
194 0.75
195 0.71
196 0.72
197 0.7
198 0.67
199 0.66
200 0.6
201 0.53
202 0.44
203 0.39
204 0.33
205 0.27
206 0.2
207 0.18
208 0.16
209 0.19
210 0.21
211 0.24
212 0.27
213 0.28
214 0.29
215 0.3
216 0.31
217 0.26
218 0.33
219 0.31
220 0.33
221 0.35
222 0.36
223 0.43
224 0.46
225 0.51
226 0.44
227 0.44
228 0.49
229 0.53
230 0.57
231 0.53
232 0.55
233 0.5
234 0.48
235 0.46
236 0.37
237 0.3
238 0.22
239 0.19
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.1
263 0.11
264 0.13
265 0.13
266 0.14
267 0.21
268 0.28
269 0.38
270 0.42
271 0.49
272 0.57
273 0.68
274 0.78
275 0.8
276 0.85
277 0.86
278 0.9
279 0.91
280 0.93
281 0.92
282 0.89
283 0.91
284 0.9
285 0.85
286 0.79
287 0.69
288 0.6
289 0.51
290 0.44
291 0.36
292 0.27
293 0.19
294 0.14
295 0.14
296 0.12
297 0.11
298 0.1
299 0.08
300 0.09
301 0.12
302 0.12
303 0.13
304 0.17
305 0.19
306 0.2
307 0.26
308 0.29
309 0.36
310 0.46
311 0.5
312 0.54
313 0.59
314 0.6
315 0.61
316 0.63
317 0.58
318 0.53
319 0.54
320 0.49
321 0.54
322 0.56
323 0.49
324 0.45
325 0.45
326 0.44
327 0.43
328 0.47
329 0.4
330 0.36
331 0.34
332 0.32
333 0.27
334 0.22
335 0.17
336 0.12
337 0.1
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.11
342 0.13
343 0.15
344 0.18
345 0.23
346 0.31
347 0.33
348 0.34
349 0.39
350 0.45
351 0.44
352 0.49
353 0.47
354 0.47
355 0.55
356 0.61
357 0.59
358 0.54
359 0.56
360 0.55
361 0.57
362 0.55
363 0.49
364 0.43
365 0.39
366 0.36
367 0.33
368 0.25
369 0.19
370 0.12
371 0.09
372 0.07
373 0.08
374 0.14
375 0.15
376 0.22
377 0.28
378 0.28
379 0.35
380 0.39
381 0.41
382 0.43
383 0.48
384 0.46
385 0.45
386 0.45
387 0.4
388 0.4
389 0.37
390 0.32
391 0.28
392 0.29
393 0.27
394 0.28
395 0.3
396 0.33
397 0.34
398 0.33
399 0.35
400 0.32
401 0.33
402 0.36
403 0.32
404 0.28
405 0.26
406 0.26
407 0.26
408 0.26
409 0.24
410 0.22
411 0.23
412 0.21
413 0.21
414 0.2
415 0.17
416 0.17
417 0.21
418 0.2
419 0.17
420 0.17
421 0.17
422 0.18
423 0.18
424 0.17
425 0.13
426 0.11
427 0.13
428 0.15
429 0.15
430 0.15
431 0.2
432 0.2
433 0.2
434 0.19
435 0.18
436 0.17
437 0.17
438 0.21
439 0.15
440 0.18
441 0.18
442 0.19
443 0.2
444 0.25