Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2H793

Protein Details
Accession I2H793    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-50EGNVPKLYKLRQRKNIESFLTCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR042238  Rad28/ERCC8/Ckn1/ATCSA-1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006283  P:transcription-coupled nucleotide-excision repair  
KEGG tbl:TBLA_0G03080  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MNKLDYTRFCPRKIDYTKEFQLQLERIFEGNVPKLYKLRQRKNIESFLTCLDLDSEANEYLLIGKDDGSVELWDTDDRLTKNDTQYEVVNRRINFYKGTKTGNEIPTHSVSSSSNHRLIHSYTSNNRAYRMYRGSSSSASPSSSSSIQKEGSSTSTLSYHQYSINSILWYPRDNGMFFTGSGDRCVKIWDTNRFSPVQSVDLRFAVNEVSCSTNNVLGIASQDTVPRLIDLREAIGQGAITMGSRSRQPCKNALTSIQFNPVPSREHFILTGDRQSDVRLWDLRVPQQELAIWPGGTAGIAWEPEKAQEFCSMGTDGWLRIRAVGSDGSGRNSDHVGSGRVVGPRDPLRVSSGGETRKHTGRRITWCGNMVLCHTALGTVEAHVPATGRLWRTLEAEGIATDGAAHTGGLALQGGLGHPAGLRLFLGCGSTLVDCGGCSVEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.61
3 0.64
4 0.68
5 0.67
6 0.65
7 0.56
8 0.56
9 0.5
10 0.47
11 0.4
12 0.35
13 0.29
14 0.28
15 0.29
16 0.26
17 0.28
18 0.29
19 0.27
20 0.28
21 0.32
22 0.38
23 0.45
24 0.51
25 0.56
26 0.62
27 0.69
28 0.78
29 0.83
30 0.85
31 0.81
32 0.73
33 0.65
34 0.57
35 0.51
36 0.4
37 0.31
38 0.24
39 0.19
40 0.16
41 0.14
42 0.14
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.14
64 0.14
65 0.16
66 0.2
67 0.24
68 0.29
69 0.33
70 0.34
71 0.3
72 0.34
73 0.41
74 0.41
75 0.44
76 0.44
77 0.39
78 0.42
79 0.44
80 0.42
81 0.39
82 0.38
83 0.4
84 0.38
85 0.43
86 0.4
87 0.42
88 0.48
89 0.48
90 0.47
91 0.4
92 0.4
93 0.38
94 0.38
95 0.33
96 0.26
97 0.21
98 0.22
99 0.27
100 0.28
101 0.29
102 0.28
103 0.29
104 0.31
105 0.32
106 0.35
107 0.32
108 0.33
109 0.33
110 0.4
111 0.44
112 0.42
113 0.42
114 0.38
115 0.37
116 0.37
117 0.38
118 0.33
119 0.3
120 0.33
121 0.34
122 0.32
123 0.32
124 0.28
125 0.24
126 0.22
127 0.2
128 0.18
129 0.18
130 0.2
131 0.21
132 0.19
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.2
137 0.19
138 0.18
139 0.17
140 0.16
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.16
145 0.16
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.15
150 0.17
151 0.18
152 0.16
153 0.15
154 0.16
155 0.15
156 0.16
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.17
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.14
168 0.17
169 0.16
170 0.14
171 0.13
172 0.15
173 0.13
174 0.16
175 0.22
176 0.29
177 0.34
178 0.36
179 0.39
180 0.38
181 0.38
182 0.35
183 0.29
184 0.24
185 0.2
186 0.2
187 0.19
188 0.18
189 0.18
190 0.15
191 0.14
192 0.11
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.09
204 0.07
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.04
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.04
231 0.08
232 0.11
233 0.17
234 0.22
235 0.25
236 0.31
237 0.36
238 0.4
239 0.38
240 0.4
241 0.39
242 0.38
243 0.36
244 0.35
245 0.31
246 0.27
247 0.27
248 0.24
249 0.22
250 0.19
251 0.23
252 0.19
253 0.2
254 0.2
255 0.2
256 0.22
257 0.21
258 0.24
259 0.19
260 0.19
261 0.17
262 0.18
263 0.18
264 0.15
265 0.17
266 0.15
267 0.16
268 0.2
269 0.23
270 0.26
271 0.28
272 0.3
273 0.27
274 0.25
275 0.25
276 0.21
277 0.21
278 0.17
279 0.13
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.05
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.08
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.15
296 0.16
297 0.16
298 0.18
299 0.17
300 0.13
301 0.15
302 0.15
303 0.12
304 0.14
305 0.15
306 0.13
307 0.13
308 0.14
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.16
314 0.17
315 0.17
316 0.18
317 0.18
318 0.17
319 0.17
320 0.17
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.16
326 0.18
327 0.19
328 0.2
329 0.18
330 0.22
331 0.23
332 0.26
333 0.25
334 0.23
335 0.25
336 0.26
337 0.27
338 0.26
339 0.29
340 0.32
341 0.35
342 0.37
343 0.38
344 0.44
345 0.46
346 0.46
347 0.48
348 0.5
349 0.56
350 0.61
351 0.62
352 0.6
353 0.59
354 0.56
355 0.49
356 0.42
357 0.35
358 0.28
359 0.23
360 0.18
361 0.15
362 0.12
363 0.11
364 0.12
365 0.1
366 0.08
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.09
373 0.11
374 0.15
375 0.15
376 0.18
377 0.2
378 0.22
379 0.24
380 0.25
381 0.24
382 0.2
383 0.19
384 0.16
385 0.15
386 0.12
387 0.09
388 0.08
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.04
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.09
413 0.1
414 0.09
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.09