Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162UW30

Protein Details
Accession A0A162UW30    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
447-477LVNTPFKNEYKKRKRSGKNKQKAQLKSKSKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
457-476KKRKRSGKNKQKAQLKSKSK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 7, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MSQEDPNHLEWDMVIRSDLSHNTSVDEALDASNISSHSSVISLESAQNIVSEDTTIDGARFSPNLSSVVQDMHLSTIEHDMQELAISSPTSVHIDNYNLSETSSPSESIFIYRPDTWCAQSTLSSDNTTSTTTEIKTIDQQSNVVIDNTHDRTNPKGCLDWKNVAFNIFLKTTSSQVQSQPGSRISSSTEPFTVDNKDQDCAAEEVESFSPINDYNSAIMWIGFLPKTVSFKDLQRLLYSPDHIKYRRIEHFAHVTYGSDEALFINIQRFDNTVFHGVILQCYPIGLESPTDHQSLPFVYPPLLCDMNNDVAELYQTPMTSIGYTEFSYCYRSGQENEYYTEYSPTATLIPYPNINPYFYVPSVPWYTPYARYFILKPWAPQDLKFSFQTGYWSVSRPKMEHLNINTPKVYLIFSITGSGEYCGCAQMISPVIDILECRKYGRQYGLVNTPFKNEYKKRKRSGKNKQKAQLKSKSKEAPDEVQSKGPIEPLGQIRHPRPWNFVFALEWIVRCRIPFRKSPDFFNPWNMTLVKESVDGTELETSVGEQLIEMFKLKSNTKGKEIDVEGCFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.15
4 0.18
5 0.21
6 0.21
7 0.23
8 0.22
9 0.24
10 0.24
11 0.23
12 0.2
13 0.18
14 0.13
15 0.1
16 0.1
17 0.09
18 0.08
19 0.1
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.12
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.16
56 0.16
57 0.14
58 0.13
59 0.12
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.15
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.12
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.15
82 0.17
83 0.19
84 0.2
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.15
89 0.17
90 0.16
91 0.15
92 0.13
93 0.14
94 0.14
95 0.17
96 0.18
97 0.16
98 0.19
99 0.21
100 0.22
101 0.25
102 0.27
103 0.26
104 0.27
105 0.27
106 0.23
107 0.23
108 0.24
109 0.23
110 0.23
111 0.22
112 0.19
113 0.18
114 0.19
115 0.17
116 0.16
117 0.14
118 0.15
119 0.14
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.22
124 0.27
125 0.29
126 0.27
127 0.27
128 0.24
129 0.25
130 0.25
131 0.18
132 0.13
133 0.11
134 0.17
135 0.19
136 0.2
137 0.19
138 0.2
139 0.25
140 0.3
141 0.32
142 0.27
143 0.3
144 0.33
145 0.39
146 0.44
147 0.46
148 0.44
149 0.46
150 0.44
151 0.4
152 0.36
153 0.3
154 0.27
155 0.2
156 0.18
157 0.15
158 0.15
159 0.16
160 0.19
161 0.2
162 0.19
163 0.21
164 0.27
165 0.27
166 0.28
167 0.3
168 0.29
169 0.28
170 0.25
171 0.24
172 0.22
173 0.25
174 0.24
175 0.23
176 0.21
177 0.2
178 0.21
179 0.22
180 0.23
181 0.19
182 0.22
183 0.21
184 0.21
185 0.19
186 0.19
187 0.19
188 0.15
189 0.14
190 0.1
191 0.09
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.1
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.11
215 0.11
216 0.13
217 0.14
218 0.16
219 0.22
220 0.25
221 0.25
222 0.24
223 0.24
224 0.26
225 0.27
226 0.27
227 0.24
228 0.22
229 0.27
230 0.27
231 0.3
232 0.29
233 0.34
234 0.38
235 0.39
236 0.38
237 0.36
238 0.42
239 0.39
240 0.37
241 0.3
242 0.24
243 0.2
244 0.19
245 0.15
246 0.08
247 0.07
248 0.05
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.11
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.11
266 0.1
267 0.08
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.09
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.12
293 0.14
294 0.17
295 0.16
296 0.16
297 0.12
298 0.11
299 0.12
300 0.1
301 0.08
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.14
320 0.16
321 0.19
322 0.23
323 0.22
324 0.24
325 0.26
326 0.24
327 0.23
328 0.22
329 0.18
330 0.14
331 0.12
332 0.1
333 0.08
334 0.07
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.17
341 0.17
342 0.18
343 0.17
344 0.17
345 0.2
346 0.19
347 0.2
348 0.15
349 0.17
350 0.2
351 0.19
352 0.19
353 0.18
354 0.2
355 0.24
356 0.25
357 0.24
358 0.22
359 0.24
360 0.23
361 0.24
362 0.3
363 0.26
364 0.26
365 0.27
366 0.33
367 0.32
368 0.32
369 0.35
370 0.3
371 0.31
372 0.31
373 0.29
374 0.22
375 0.22
376 0.24
377 0.18
378 0.2
379 0.18
380 0.2
381 0.22
382 0.26
383 0.28
384 0.26
385 0.29
386 0.33
387 0.34
388 0.39
389 0.41
390 0.47
391 0.48
392 0.5
393 0.46
394 0.38
395 0.36
396 0.29
397 0.24
398 0.14
399 0.13
400 0.11
401 0.11
402 0.13
403 0.12
404 0.12
405 0.12
406 0.12
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.08
415 0.11
416 0.11
417 0.11
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.12
423 0.13
424 0.12
425 0.14
426 0.18
427 0.21
428 0.26
429 0.31
430 0.34
431 0.34
432 0.39
433 0.46
434 0.48
435 0.49
436 0.45
437 0.44
438 0.4
439 0.38
440 0.42
441 0.42
442 0.47
443 0.55
444 0.65
445 0.71
446 0.79
447 0.88
448 0.89
449 0.92
450 0.92
451 0.92
452 0.92
453 0.91
454 0.9
455 0.89
456 0.88
457 0.87
458 0.86
459 0.8
460 0.79
461 0.78
462 0.73
463 0.71
464 0.66
465 0.62
466 0.59
467 0.59
468 0.52
469 0.48
470 0.45
471 0.39
472 0.34
473 0.29
474 0.22
475 0.18
476 0.22
477 0.23
478 0.27
479 0.3
480 0.36
481 0.38
482 0.46
483 0.52
484 0.5
485 0.52
486 0.5
487 0.52
488 0.47
489 0.46
490 0.38
491 0.32
492 0.34
493 0.28
494 0.26
495 0.21
496 0.21
497 0.2
498 0.2
499 0.25
500 0.28
501 0.32
502 0.39
503 0.46
504 0.54
505 0.57
506 0.64
507 0.67
508 0.66
509 0.64
510 0.66
511 0.62
512 0.52
513 0.54
514 0.46
515 0.38
516 0.34
517 0.33
518 0.24
519 0.2
520 0.2
521 0.16
522 0.17
523 0.15
524 0.14
525 0.15
526 0.14
527 0.13
528 0.12
529 0.12
530 0.11
531 0.11
532 0.09
533 0.06
534 0.08
535 0.1
536 0.11
537 0.12
538 0.12
539 0.15
540 0.21
541 0.23
542 0.3
543 0.37
544 0.42
545 0.48
546 0.52
547 0.51
548 0.54
549 0.56
550 0.54