Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165PGC2

Protein Details
Accession A0A165PGC2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-53SAAAQPPPAKRRRKSKGGKNNNAYAQGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-45PPAKRRRKSKGGK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, cyto 4, mito 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MQRTLVSYSDIADPQPPEPIAAQSTSSAAAQPPPAKRRRKSKGGKNNNAYAQGDFGPPEQSRDLAHEEIWDDSALIDAWNAATEEYEVLNGPDKKWKHEPVHKSALWYNSLPQAAAAPSGSKADDSAPLDFDSYVPTHVPLPNQKDGAPAMHAPSFSFPPMPSAPNVSSDEALQNAYGAWYWAGYWSGVYQTMNAGKTRGTAVVEDPEEITGAELDESVNMDLEDGPEDGEVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.24
3 0.22
4 0.19
5 0.2
6 0.21
7 0.19
8 0.19
9 0.2
10 0.15
11 0.16
12 0.16
13 0.15
14 0.13
15 0.12
16 0.13
17 0.17
18 0.22
19 0.29
20 0.37
21 0.45
22 0.54
23 0.61
24 0.7
25 0.74
26 0.79
27 0.82
28 0.85
29 0.87
30 0.89
31 0.92
32 0.88
33 0.87
34 0.8
35 0.74
36 0.64
37 0.53
38 0.44
39 0.35
40 0.28
41 0.21
42 0.17
43 0.17
44 0.15
45 0.18
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.19
50 0.23
51 0.19
52 0.19
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.17
57 0.13
58 0.09
59 0.07
60 0.08
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.18
80 0.19
81 0.24
82 0.31
83 0.38
84 0.41
85 0.49
86 0.56
87 0.57
88 0.65
89 0.6
90 0.56
91 0.52
92 0.46
93 0.4
94 0.32
95 0.26
96 0.21
97 0.2
98 0.17
99 0.14
100 0.12
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.09
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.11
126 0.14
127 0.18
128 0.24
129 0.26
130 0.27
131 0.27
132 0.27
133 0.26
134 0.24
135 0.21
136 0.16
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.11
146 0.14
147 0.16
148 0.17
149 0.16
150 0.2
151 0.2
152 0.23
153 0.26
154 0.22
155 0.21
156 0.2
157 0.2
158 0.16
159 0.16
160 0.11
161 0.09
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.12
179 0.16
180 0.18
181 0.18
182 0.17
183 0.16
184 0.17
185 0.19
186 0.17
187 0.14
188 0.14
189 0.16
190 0.21
191 0.22
192 0.21
193 0.2
194 0.18
195 0.17
196 0.16
197 0.14
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.1
212 0.08
213 0.08