FuNGI

A0A165N806

Protein Details

Accession

A0A165N806

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
268-373	EGASSSKKKNGKKSKEKAKDKKRRRSKRSDDESSEDERPKKRSKKSKRDSDSDEDSDDDAPKKKKSKSKKKKAVSDDEESDEDDSPKKRKKKASSSSSKKRKRESS	Basic
380-405	EEEAGSSKRRSKKKRRARTPSSSESG	Hydrophilic
614-635	IKQNIKCTPQPKYERPRKSTGG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
273-315	SKKKNGKKSKEKAKDKKRRRSKRSDDESSEDERPKKRSKKSKR
328-340	PKKKKSKSKKKKA
353-372	PKKRKKKASSSSSKKRKRES
384-397	GSSKRRSKKKRRAR

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf IPR036864 Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf IPR001138 Zn2Cys6_DnaBD
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0000981 F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34
PROSITE	View protein in PROSITE PS00463 ZN2_CY6_FUNGAL_1 PS50048 ZN2_CY6_FUNGAL_2
CDD	cd00067 GAL4

Amino Acid Sequences

MSRPLNALEKRIHSECTSKANKIISQKEVDAVAPDAKPRVDAINFLLKAGMFVVLTDKNGTVSYRAVSKKELEVKKEISGDENIILQAIQAAKNEGIWTKHLKNTTNLHQTIITRTLKTLEQKGLIKPIKSVKNPTRKIYILSHLEPSVEVTGGPWYTDHELDTEFIRMLLSAALRFITDRSFPKTDDDEARPLFPISQAPTYPSATNILSFLMKSRITEIVLGLDDMESLLDVLVYDGLIERLPAFGGMSWSMTMLRDDDDDEDDDEGASSSKKKNGKKSKEKAKDKKRRRSKRSDDESSEDERPKKRSKKSKRDSDSDEDSDDDAPKKKKSKSKKKKAVSDDEESDEDDSPKKRKKKASSSSSKKRKRESSESPSDSEEEAGSSKRRSKKKRRARTPSSSESGSDDESDDDEGPVSRSGRKSADAHSSAAHVYRAIRSELVEPLQAFAQAPCTKCPQFEFCESTGPVNAKGCEYFGQWLAPMNRHPHLPRRAVAPPPHPPPPSHMLSMHPPRSQEFHPMGPPTTPRFQPQFAHHYSQPAPPSPSPQQQDMSIYYNQFPQVGYTFGAPQQAWEYVGAKPLAEETRSLRACAECRRRKVCCNTMPGMSSCERCIKQNIKCTPQPKYERPRKSTGGEGESGAASKSGPVRSGRRSHEHPHPYARDDGDFTAPRRASLGDEEALPRTRSKSKFFKTQPIVPIVLELQRSSSLPDIRFPHLPSHSQPNFERRASFA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.44
3	0.48
4	0.48
5	0.44
6	0.47
7	0.49
8	0.51
9	0.54
10	0.57
11	0.53
12	0.52
13	0.5
14	0.48
15	0.44
16	0.39
17	0.32
18	0.27
19	0.25
20	0.21
21	0.22
22	0.22
23	0.2
24	0.21
25	0.2
26	0.23
27	0.2
28	0.22
29	0.24
30	0.32
31	0.32
32	0.31
33	0.31
34	0.24
35	0.24
36	0.22
37	0.18
38	0.07
39	0.08
40	0.12
41	0.12
42	0.13
43	0.14
44	0.14
45	0.14
46	0.15
47	0.16
48	0.14
49	0.14
50	0.15
51	0.22
52	0.25
53	0.26
54	0.29
55	0.32
56	0.38
57	0.46
58	0.5
59	0.48
60	0.52
61	0.53
62	0.54
63	0.54
64	0.47
65	0.4
66	0.36
67	0.33
68	0.27
69	0.24
70	0.19
71	0.16
72	0.15
73	0.11
74	0.11
75	0.11
76	0.11
77	0.11
78	0.13
79	0.13
80	0.14
81	0.16
82	0.16
83	0.16
84	0.19
85	0.26
86	0.29
87	0.33
88	0.38
89	0.4
90	0.44
91	0.49
92	0.55
93	0.58
94	0.53
95	0.51
96	0.49
97	0.47
98	0.45
99	0.45
100	0.39
101	0.3
102	0.3
103	0.3
104	0.31
105	0.35
106	0.36
107	0.33
108	0.36
109	0.39
110	0.41
111	0.49
112	0.49
113	0.44
114	0.42
115	0.47
116	0.49
117	0.51
118	0.58
119	0.57
120	0.64
121	0.69
122	0.69
123	0.68
124	0.61
125	0.6
126	0.56
127	0.55
128	0.51
129	0.47
130	0.46
131	0.38
132	0.37
133	0.32
134	0.29
135	0.21
136	0.14
137	0.11
138	0.08
139	0.11
140	0.11
141	0.11
142	0.09
143	0.1
144	0.13
145	0.14
146	0.13
147	0.12
148	0.13
149	0.13
150	0.14
151	0.13
152	0.1
153	0.1
154	0.09
155	0.08
156	0.07
157	0.08
158	0.08
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.09
166	0.13
167	0.16
168	0.22
169	0.24
170	0.25
171	0.3
172	0.32
173	0.34
174	0.37
175	0.38
176	0.38
177	0.37
178	0.37
179	0.33
180	0.3
181	0.26
182	0.2
183	0.2
184	0.16
185	0.18
186	0.18
187	0.19
188	0.22
189	0.24
190	0.23
191	0.21
192	0.2
193	0.17
194	0.17
195	0.15
196	0.13
197	0.11
198	0.11
199	0.12
200	0.13
201	0.13
202	0.13
203	0.15
204	0.15
205	0.16
206	0.16
207	0.15
208	0.13
209	0.13
210	0.12
211	0.1
212	0.08
213	0.07
214	0.06
215	0.05
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.02
220	0.02
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.08
247	0.09
248	0.1
249	0.11
250	0.11
251	0.11
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.06
257	0.06
258	0.08
259	0.1
260	0.15
261	0.22
262	0.28
263	0.39
264	0.49
265	0.6
266	0.69
267	0.77
268	0.82
269	0.87
270	0.92
271	0.92
272	0.93
273	0.93
274	0.92
275	0.93
276	0.93
277	0.93
278	0.92
279	0.93
280	0.92
281	0.93
282	0.91
283	0.89
284	0.83
285	0.77
286	0.71
287	0.64
288	0.58
289	0.5
290	0.45
291	0.4
292	0.4
293	0.45
294	0.5
295	0.54
296	0.61
297	0.69
298	0.76
299	0.82
300	0.88
301	0.85
302	0.84
303	0.82
304	0.78
305	0.74
306	0.64
307	0.55
308	0.44
309	0.38
310	0.31
311	0.25
312	0.2
313	0.18
314	0.19
315	0.22
316	0.28
317	0.33
318	0.41
319	0.51
320	0.61
321	0.67
322	0.76
323	0.82
324	0.85
325	0.88
326	0.89
327	0.88
328	0.83
329	0.77
330	0.68
331	0.6
332	0.51
333	0.42
334	0.34
335	0.24
336	0.19
337	0.15
338	0.15
339	0.18
340	0.25
341	0.31
342	0.37
343	0.45
344	0.54
345	0.63
346	0.71
347	0.76
348	0.8
349	0.84
350	0.88
351	0.9
352	0.89
353	0.84
354	0.82
355	0.8
356	0.77
357	0.76
358	0.75
359	0.73
360	0.74
361	0.71
362	0.65
363	0.57
364	0.5
365	0.41
366	0.31
367	0.22
368	0.12
369	0.1
370	0.09
371	0.1
372	0.1
373	0.17
374	0.24
375	0.33
376	0.43
377	0.54
378	0.64
379	0.73
380	0.83
381	0.88
382	0.91
383	0.92
384	0.92
385	0.88
386	0.84
387	0.76
388	0.66
389	0.56
390	0.47
391	0.39
392	0.29
393	0.21
394	0.15
395	0.11
396	0.11
397	0.11
398	0.09
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.08
404	0.09
405	0.11
406	0.11
407	0.14
408	0.16
409	0.19
410	0.2
411	0.22
412	0.3
413	0.29
414	0.29
415	0.27
416	0.26
417	0.23
418	0.22
419	0.18
420	0.1
421	0.09
422	0.1
423	0.12
424	0.11
425	0.11
426	0.12
427	0.13
428	0.14
429	0.14
430	0.14
431	0.12
432	0.12
433	0.12
434	0.11
435	0.1
436	0.08
437	0.14
438	0.15
439	0.16
440	0.17
441	0.23
442	0.23
443	0.24
444	0.27
445	0.25
446	0.26
447	0.3
448	0.33
449	0.29
450	0.33
451	0.32
452	0.3
453	0.28
454	0.25
455	0.21
456	0.19
457	0.18
458	0.14
459	0.14
460	0.14
461	0.13
462	0.13
463	0.13
464	0.12
465	0.12
466	0.11
467	0.16
468	0.16
469	0.18
470	0.2
471	0.22
472	0.23
473	0.26
474	0.29
475	0.34
476	0.4
477	0.42
478	0.4
479	0.42
480	0.46
481	0.48
482	0.52
483	0.49
484	0.5
485	0.5
486	0.55
487	0.51
488	0.47
489	0.46
490	0.46
491	0.42
492	0.37
493	0.33
494	0.29
495	0.36
496	0.45
497	0.45
498	0.4
499	0.38
500	0.37
501	0.4
502	0.38
503	0.38
504	0.32
505	0.3
506	0.32
507	0.33
508	0.33
509	0.3
510	0.33
511	0.29
512	0.31
513	0.29
514	0.3
515	0.32
516	0.35
517	0.37
518	0.4
519	0.43
520	0.43
521	0.47
522	0.43
523	0.44
524	0.43
525	0.44
526	0.41
527	0.37
528	0.37
529	0.32
530	0.38
531	0.39
532	0.44
533	0.42
534	0.43
535	0.41
536	0.37
537	0.4
538	0.36
539	0.34
540	0.29
541	0.27
542	0.24
543	0.25
544	0.24
545	0.21
546	0.18
547	0.15
548	0.14
549	0.14
550	0.13
551	0.12
552	0.13
553	0.14
554	0.17
555	0.15
556	0.15
557	0.16
558	0.16
559	0.15
560	0.15
561	0.16
562	0.13
563	0.17
564	0.16
565	0.14
566	0.13
567	0.16
568	0.17
569	0.16
570	0.17
571	0.17
572	0.26
573	0.27
574	0.27
575	0.26
576	0.27
577	0.31
578	0.4
579	0.47
580	0.46
581	0.55
582	0.62
583	0.66
584	0.72
585	0.78
586	0.78
587	0.74
588	0.73
589	0.68
590	0.64
591	0.62
592	0.53
593	0.48
594	0.41
595	0.35
596	0.3
597	0.34
598	0.31
599	0.31
600	0.39
601	0.42
602	0.47
603	0.55
604	0.61
605	0.6
606	0.66
607	0.69
608	0.68
609	0.7
610	0.72
611	0.72
612	0.75
613	0.77
614	0.81
615	0.82
616	0.82
617	0.78
618	0.72
619	0.71
620	0.68
621	0.62
622	0.53
623	0.47
624	0.41
625	0.35
626	0.31
627	0.22
628	0.15
629	0.09
630	0.1
631	0.14
632	0.14
633	0.17
634	0.23
635	0.3
636	0.38
637	0.46
638	0.51
639	0.55
640	0.6
641	0.64
642	0.69
643	0.71
644	0.69
645	0.71
646	0.69
647	0.64
648	0.63
649	0.59
650	0.51
651	0.45
652	0.41
653	0.38
654	0.37
655	0.35
656	0.39
657	0.36
658	0.34
659	0.32
660	0.3
661	0.26
662	0.27
663	0.3
664	0.22
665	0.24
666	0.26
667	0.28
668	0.31
669	0.29
670	0.26
671	0.26
672	0.34
673	0.37
674	0.44
675	0.51
676	0.55
677	0.65
678	0.69
679	0.75
680	0.74
681	0.77
682	0.76
683	0.71
684	0.65
685	0.54
686	0.5
687	0.41
688	0.37
689	0.3
690	0.23
691	0.2
692	0.2
693	0.2
694	0.2
695	0.24
696	0.27
697	0.26
698	0.33
699	0.35
700	0.38
701	0.43
702	0.42
703	0.44
704	0.43
705	0.47
706	0.45
707	0.51
708	0.5
709	0.52
710	0.55
711	0.56
712	0.58
713	0.56

A0A165N806

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer