FuNGI

A0A165L417

Protein Details

Accession

A0A165L417

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
48-68	LDTILRFKRMRKFERWNDWIA	Hydrophilic
393-430	VDAAAKSKPAKKAKKPVHPTTREKKKGPTKVQHQIEKM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
398-420	KSKPAKKAKKPVHPTTREKKKGP

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 13.5, cyto 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR002344 Lupus_La IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd12291 RRM1_La

Amino Acid Sequences

GPLTKEDDATLKQRCLRQVEFWFSDSNLPYDEFLWELHAASDDHWVSLDTILRFKRMRKFERWNDWIADVLRSSGSLEVNDTGEMIRRVEPVVDRGEEQWNRTAFIVEDFFDQFGPVNAVRLRRYEDAPWAKDKWPFPHEFKGSVWVEFPSAAAMHKFVATEPKPRWNEKELVISTKEAYFAKKLADTPNFRMTTLDKMRKRNATDRFIASFYALNTDSKSDKPNNPAQQPQKREVHIAFMGQELRAWRLGEGADLPEGAPKPSPDEWEFVRKTDMQHVKGATLLVTAKETKRGDGNVFNATRDCLARLKIVPLPLPSITRETTDETTRTAVFCFQTPVPDDTLARIRAEVHKMYDCQLEWTRYGSKEERELQLERANAMARGALGGYKETNVDAAAKSKPAKKAKKPVHPTTREKKKGPTKVQHQIEKMLANLCKLQEKMTGRPVTKEDMLSWTLERGSVSAEGKRKRPDEDSEDSEEEVEALMQASPSKRARVAGSSDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.53
3	0.53
4	0.54
5	0.58
6	0.61
7	0.59
8	0.56
9	0.51
10	0.45
11	0.47
12	0.39
13	0.32
14	0.25
15	0.23
16	0.22
17	0.2
18	0.2
19	0.14
20	0.13
21	0.15
22	0.14
23	0.13
24	0.12
25	0.13
26	0.13
27	0.13
28	0.2
29	0.16
30	0.16
31	0.16
32	0.16
33	0.15
34	0.17
35	0.21
36	0.15
37	0.21
38	0.22
39	0.28
40	0.3
41	0.35
42	0.43
43	0.48
44	0.55
45	0.59
46	0.69
47	0.74
48	0.82
49	0.81
50	0.77
51	0.7
52	0.63
53	0.57
54	0.48
55	0.39
56	0.29
57	0.24
58	0.19
59	0.16
60	0.16
61	0.13
62	0.13
63	0.11
64	0.12
65	0.13
66	0.13
67	0.13
68	0.13
69	0.1
70	0.13
71	0.13
72	0.13
73	0.13
74	0.14
75	0.14
76	0.17
77	0.18
78	0.18
79	0.21
80	0.21
81	0.21
82	0.22
83	0.31
84	0.3
85	0.31
86	0.34
87	0.3
88	0.3
89	0.29
90	0.28
91	0.19
92	0.2
93	0.2
94	0.14
95	0.16
96	0.15
97	0.15
98	0.14
99	0.13
100	0.1
101	0.09
102	0.12
103	0.1
104	0.13
105	0.15
106	0.18
107	0.2
108	0.22
109	0.27
110	0.26
111	0.29
112	0.28
113	0.36
114	0.41
115	0.43
116	0.45
117	0.44
118	0.44
119	0.47
120	0.48
121	0.46
122	0.44
123	0.47
124	0.47
125	0.53
126	0.53
127	0.5
128	0.46
129	0.47
130	0.41
131	0.36
132	0.31
133	0.22
134	0.2
135	0.17
136	0.17
137	0.09
138	0.08
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.07
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.16
147	0.18
148	0.25
149	0.27
150	0.36
151	0.4
152	0.43
153	0.48
154	0.44
155	0.46
156	0.42
157	0.49
158	0.41
159	0.41
160	0.39
161	0.35
162	0.31
163	0.27
164	0.26
165	0.17
166	0.17
167	0.14
168	0.14
169	0.15
170	0.16
171	0.17
172	0.22
173	0.29
174	0.31
175	0.35
176	0.43
177	0.42
178	0.4
179	0.39
180	0.33
181	0.36
182	0.4
183	0.44
184	0.41
185	0.47
186	0.53
187	0.58
188	0.61
189	0.6
190	0.6
191	0.56
192	0.55
193	0.53
194	0.49
195	0.43
196	0.38
197	0.31
198	0.23
199	0.18
200	0.16
201	0.13
202	0.11
203	0.11
204	0.12
205	0.13
206	0.13
207	0.18
208	0.2
209	0.24
210	0.29
211	0.37
212	0.42
213	0.44
214	0.51
215	0.56
216	0.59
217	0.59
218	0.6
219	0.57
220	0.51
221	0.51
222	0.44
223	0.39
224	0.31
225	0.27
226	0.21
227	0.17
228	0.17
229	0.12
230	0.13
231	0.09
232	0.09
233	0.1
234	0.09
235	0.08
236	0.08
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.07
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.11
250	0.12
251	0.16
252	0.16
253	0.18
254	0.19
255	0.28
256	0.28
257	0.25
258	0.26
259	0.24
260	0.23
261	0.31
262	0.35
263	0.29
264	0.32
265	0.31
266	0.29
267	0.28
268	0.27
269	0.17
270	0.12
271	0.1
272	0.07
273	0.08
274	0.1
275	0.09
276	0.16
277	0.17
278	0.17
279	0.19
280	0.2
281	0.22
282	0.24
283	0.26
284	0.27
285	0.27
286	0.26
287	0.24
288	0.22
289	0.21
290	0.17
291	0.16
292	0.11
293	0.12
294	0.14
295	0.15
296	0.17
297	0.18
298	0.2
299	0.21
300	0.2
301	0.21
302	0.19
303	0.2
304	0.18
305	0.2
306	0.19
307	0.18
308	0.19
309	0.21
310	0.22
311	0.23
312	0.23
313	0.2
314	0.22
315	0.2
316	0.19
317	0.15
318	0.15
319	0.13
320	0.13
321	0.16
322	0.14
323	0.17
324	0.19
325	0.2
326	0.2
327	0.2
328	0.19
329	0.19
330	0.24
331	0.22
332	0.19
333	0.18
334	0.18
335	0.22
336	0.26
337	0.25
338	0.24
339	0.25
340	0.26
341	0.28
342	0.29
343	0.24
344	0.25
345	0.28
346	0.27
347	0.24
348	0.27
349	0.29
350	0.27
351	0.32
352	0.3
353	0.29
354	0.34
355	0.38
356	0.38
357	0.38
358	0.39
359	0.37
360	0.37
361	0.35
362	0.28
363	0.25
364	0.22
365	0.18
366	0.16
367	0.13
368	0.09
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.08
380	0.1
381	0.09
382	0.12
383	0.13
384	0.16
385	0.21
386	0.26
387	0.35
388	0.43
389	0.53
390	0.6
391	0.69
392	0.76
393	0.82
394	0.87
395	0.88
396	0.89
397	0.88
398	0.88
399	0.88
400	0.9
401	0.87
402	0.82
403	0.81
404	0.8
405	0.82
406	0.83
407	0.82
408	0.81
409	0.83
410	0.88
411	0.85
412	0.78
413	0.73
414	0.66
415	0.57
416	0.49
417	0.44
418	0.36
419	0.3
420	0.3
421	0.26
422	0.28
423	0.26
424	0.27
425	0.28
426	0.32
427	0.37
428	0.43
429	0.49
430	0.45
431	0.49
432	0.5
433	0.48
434	0.47
435	0.42
436	0.34
437	0.32
438	0.32
439	0.29
440	0.27
441	0.23
442	0.2
443	0.19
444	0.17
445	0.12
446	0.14
447	0.16
448	0.18
449	0.22
450	0.3
451	0.35
452	0.41
453	0.5
454	0.5
455	0.52
456	0.55
457	0.58
458	0.58
459	0.61
460	0.6
461	0.59
462	0.58
463	0.53
464	0.47
465	0.38
466	0.3
467	0.22
468	0.15
469	0.08
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.1
474	0.11
475	0.18
476	0.21
477	0.25
478	0.27
479	0.31
480	0.34
481	0.38

A0A165L417

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer