Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A165C6F1

Protein Details
Accession A0A165C6F1    Localization Confidence Low Confidence Score 5.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-90GPKSKAKSLLKKAVRNHNKEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 18.5, cyto_nucl 11, mito 4, nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR029319  DNA_ligase_OB  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF14743  DNA_ligase_OB_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd07896  Adenylation_kDNA_ligase_like  
cd08041  OBF_kDNA_ligase_like  
Amino Acid Sequences SDATYIIKRTGDCYRCECMAWRTAGGQNNARSCKHLKELLGEEYENARCRSKDLPEIQPAPSVAAHKDDGGPKSKAKSLLKKAVRNHNKEDKDADEDTAKVNTQAFKLLLANKWNPENSPDLQGWWCSEKLDGVRAFYDDDTFISRLGNPFPVPDWFLAGLPKDVQLDGELFTGRGNFKQTVSIVRTKNSPNWEAIRFHVFDIPSHGAQPFEKRLELLGSIFGKGGSHACDHVVVVKQTLVKDRDHVLEMLQDVEAQGGEGLMLRKPKSIYVHARSATLLKVKTFHDAEARVTGHSEGKGKYQGLCGALICEMESGKTFKCGSGLTDKDRESPPAVGSIIVYRFQELTLQGRPRFPTFVSEAADKTEPKDADLTKAVLGDGEDVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.42
3 0.44
4 0.44
5 0.39
6 0.41
7 0.39
8 0.35
9 0.34
10 0.38
11 0.42
12 0.43
13 0.45
14 0.45
15 0.5
16 0.53
17 0.5
18 0.49
19 0.47
20 0.47
21 0.47
22 0.46
23 0.41
24 0.44
25 0.48
26 0.48
27 0.48
28 0.42
29 0.37
30 0.36
31 0.37
32 0.33
33 0.3
34 0.28
35 0.24
36 0.27
37 0.31
38 0.32
39 0.38
40 0.41
41 0.48
42 0.53
43 0.56
44 0.55
45 0.52
46 0.47
47 0.39
48 0.34
49 0.28
50 0.2
51 0.2
52 0.2
53 0.18
54 0.21
55 0.24
56 0.26
57 0.3
58 0.31
59 0.31
60 0.34
61 0.37
62 0.42
63 0.45
64 0.52
65 0.56
66 0.64
67 0.69
68 0.72
69 0.76
70 0.79
71 0.81
72 0.78
73 0.77
74 0.77
75 0.72
76 0.68
77 0.64
78 0.56
79 0.51
80 0.46
81 0.38
82 0.29
83 0.27
84 0.25
85 0.22
86 0.19
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.17
92 0.15
93 0.15
94 0.18
95 0.21
96 0.22
97 0.26
98 0.28
99 0.28
100 0.31
101 0.3
102 0.28
103 0.27
104 0.28
105 0.24
106 0.25
107 0.23
108 0.21
109 0.21
110 0.22
111 0.21
112 0.19
113 0.17
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.2
119 0.19
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.19
124 0.17
125 0.16
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.13
136 0.1
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.13
141 0.12
142 0.13
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.13
167 0.14
168 0.18
169 0.21
170 0.27
171 0.26
172 0.26
173 0.29
174 0.29
175 0.33
176 0.32
177 0.3
178 0.26
179 0.28
180 0.3
181 0.27
182 0.27
183 0.26
184 0.23
185 0.22
186 0.22
187 0.18
188 0.15
189 0.19
190 0.2
191 0.16
192 0.16
193 0.16
194 0.14
195 0.14
196 0.18
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.15
202 0.16
203 0.16
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.13
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.14
225 0.15
226 0.21
227 0.2
228 0.18
229 0.2
230 0.23
231 0.23
232 0.23
233 0.22
234 0.16
235 0.16
236 0.16
237 0.14
238 0.11
239 0.09
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.05
249 0.07
250 0.1
251 0.11
252 0.14
253 0.15
254 0.19
255 0.22
256 0.3
257 0.38
258 0.4
259 0.48
260 0.46
261 0.47
262 0.43
263 0.4
264 0.35
265 0.3
266 0.26
267 0.19
268 0.21
269 0.21
270 0.26
271 0.26
272 0.25
273 0.25
274 0.26
275 0.27
276 0.29
277 0.29
278 0.23
279 0.23
280 0.23
281 0.2
282 0.2
283 0.22
284 0.18
285 0.21
286 0.25
287 0.25
288 0.26
289 0.26
290 0.27
291 0.25
292 0.25
293 0.21
294 0.18
295 0.17
296 0.15
297 0.12
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.14
305 0.15
306 0.15
307 0.17
308 0.17
309 0.19
310 0.27
311 0.31
312 0.33
313 0.39
314 0.4
315 0.43
316 0.44
317 0.44
318 0.38
319 0.35
320 0.3
321 0.27
322 0.26
323 0.21
324 0.2
325 0.21
326 0.2
327 0.19
328 0.19
329 0.16
330 0.16
331 0.16
332 0.18
333 0.16
334 0.19
335 0.25
336 0.32
337 0.34
338 0.38
339 0.42
340 0.42
341 0.44
342 0.39
343 0.38
344 0.35
345 0.37
346 0.36
347 0.35
348 0.33
349 0.34
350 0.36
351 0.31
352 0.28
353 0.31
354 0.27
355 0.26
356 0.32
357 0.29
358 0.32
359 0.35
360 0.35
361 0.28
362 0.29
363 0.26
364 0.2
365 0.2