FuNGI

J5JVA6

Protein Details

Accession

J5JVA6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
47-72	ARRLKESGGQFKRRRQEKRATQVKMG	Hydrophilic
425-449	NGPASPAKTEKRRRSPSEDSPRKAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
58-62	KRRRQ
432-448	KTEKRRRSPSEDSPRKA

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 13.5, cyto 10.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR002501 PsdUridine_synth_N IPR014780 tRNA_psdUridine_synth_TruB
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01509 TruB_N
CDD	cd02867 PseudoU_synth_TruB_4

Amino Acid Sequences

MASDIARDGIFAINKPCGESSAQVIRVCQQHFNPSTFFKPMLDNEVARRLKESGGQFKRRRQEKRATQVKMGHGGTLDPLATGVLILGIGTGTKHLSQFLDCTKAYETVVVFGASTDTYDRVGRVLSKRPYDHITKEKLEEALQSFKGKQIQIPPLYSALKMNGKPLYEYAREGKPIPREIKGREVEVLDIELVEYYEPGKHNHRWPTEEASASERNLAEQVWSIKKSQETAKKLTPEEKEADDQAIAAHESFKKSFDERQDDLIRDSPKPSRQRNSKDAMMSGALGALPQAATHSNKGSNLVQPAPDKNTPPPWKDEGPPAAKIRLTVTSGYYIRSFCHDLGTKLDSAGLMAELCRTRQSDFTVGGINCLEYADLAKGEAVWGPKVADMLARWNGEPGGNWTSGDVRTNGASSSKAHTPGINGNGPASPAKTEKRRRSPSEDSPRKAAARGDSDSLRPDTPGRRRSDSDKSWNGFEG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.25
3	0.24
4	0.22
5	0.23
6	0.22
7	0.26
8	0.3
9	0.35
10	0.34
11	0.34
12	0.37
13	0.41
14	0.41
15	0.4
16	0.35
17	0.4
18	0.43
19	0.45
20	0.44
21	0.42
22	0.44
23	0.42
24	0.4
25	0.31
26	0.32
27	0.32
28	0.35
29	0.34
30	0.32
31	0.33
32	0.42
33	0.42
34	0.37
35	0.37
36	0.31
37	0.29
38	0.33
39	0.37
40	0.38
41	0.47
42	0.57
43	0.61
44	0.68
45	0.77
46	0.8
47	0.81
48	0.79
49	0.8
50	0.8
51	0.84
52	0.86
53	0.81
54	0.79
55	0.78
56	0.74
57	0.71
58	0.6
59	0.51
60	0.41
61	0.35
62	0.29
63	0.23
64	0.17
65	0.09
66	0.08
67	0.07
68	0.06
69	0.06
70	0.05
71	0.03
72	0.03
73	0.03
74	0.03
75	0.03
76	0.03
77	0.03
78	0.04
79	0.05
80	0.07
81	0.07
82	0.09
83	0.11
84	0.12
85	0.16
86	0.18
87	0.23
88	0.22
89	0.23
90	0.24
91	0.24
92	0.23
93	0.22
94	0.19
95	0.15
96	0.16
97	0.14
98	0.12
99	0.1
100	0.1
101	0.07
102	0.08
103	0.07
104	0.07
105	0.08
106	0.09
107	0.09
108	0.09
109	0.1
110	0.15
111	0.19
112	0.27
113	0.32
114	0.38
115	0.4
116	0.43
117	0.47
118	0.47
119	0.5
120	0.5
121	0.5
122	0.47
123	0.48
124	0.46
125	0.43
126	0.37
127	0.34
128	0.28
129	0.27
130	0.25
131	0.25
132	0.23
133	0.24
134	0.28
135	0.25
136	0.25
137	0.28
138	0.34
139	0.36
140	0.37
141	0.35
142	0.34
143	0.35
144	0.32
145	0.25
146	0.21
147	0.24
148	0.23
149	0.25
150	0.24
151	0.24
152	0.24
153	0.25
154	0.26
155	0.22
156	0.24
157	0.24
158	0.24
159	0.25
160	0.26
161	0.29
162	0.29
163	0.34
164	0.35
165	0.36
166	0.38
167	0.39
168	0.46
169	0.43
170	0.39
171	0.34
172	0.32
173	0.27
174	0.23
175	0.2
176	0.11
177	0.09
178	0.07
179	0.05
180	0.05
181	0.04
182	0.04
183	0.03
184	0.06
185	0.07
186	0.09
187	0.15
188	0.19
189	0.26
190	0.34
191	0.37
192	0.38
193	0.41
194	0.46
195	0.43
196	0.4
197	0.34
198	0.32
199	0.3
200	0.27
201	0.26
202	0.18
203	0.15
204	0.15
205	0.13
206	0.09
207	0.09
208	0.12
209	0.13
210	0.14
211	0.15
212	0.16
213	0.17
214	0.19
215	0.24
216	0.3
217	0.32
218	0.36
219	0.4
220	0.42
221	0.43
222	0.47
223	0.41
224	0.37
225	0.34
226	0.31
227	0.28
228	0.24
229	0.23
230	0.16
231	0.14
232	0.11
233	0.08
234	0.07
235	0.05
236	0.07
237	0.07
238	0.09
239	0.09
240	0.1
241	0.12
242	0.13
243	0.18
244	0.23
245	0.3
246	0.29
247	0.36
248	0.38
249	0.37
250	0.37
251	0.38
252	0.32
253	0.26
254	0.27
255	0.25
256	0.29
257	0.37
258	0.43
259	0.47
260	0.55
261	0.62
262	0.67
263	0.68
264	0.65
265	0.58
266	0.52
267	0.44
268	0.34
269	0.26
270	0.19
271	0.13
272	0.08
273	0.06
274	0.05
275	0.04
276	0.03
277	0.03
278	0.04
279	0.06
280	0.07
281	0.09
282	0.11
283	0.13
284	0.13
285	0.17
286	0.18
287	0.19
288	0.21
289	0.21
290	0.22
291	0.23
292	0.25
293	0.27
294	0.28
295	0.27
296	0.27
297	0.36
298	0.39
299	0.39
300	0.42
301	0.42
302	0.43
303	0.43
304	0.47
305	0.45
306	0.42
307	0.45
308	0.42
309	0.39
310	0.36
311	0.34
312	0.29
313	0.24
314	0.22
315	0.18
316	0.18
317	0.21
318	0.21
319	0.22
320	0.21
321	0.18
322	0.17
323	0.2
324	0.21
325	0.16
326	0.22
327	0.22
328	0.22
329	0.26
330	0.28
331	0.24
332	0.22
333	0.22
334	0.15
335	0.13
336	0.12
337	0.08
338	0.05
339	0.05
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.11
344	0.12
345	0.14
346	0.16
347	0.21
348	0.22
349	0.23
350	0.24
351	0.28
352	0.27
353	0.27
354	0.24
355	0.2
356	0.15
357	0.14
358	0.12
359	0.05
360	0.07
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.1
371	0.1
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.11
376	0.1
377	0.16
378	0.2
379	0.21
380	0.2
381	0.21
382	0.22
383	0.2
384	0.2
385	0.2
386	0.19
387	0.18
388	0.18
389	0.18
390	0.2
391	0.21
392	0.22
393	0.17
394	0.15
395	0.15
396	0.16
397	0.16
398	0.14
399	0.15
400	0.15
401	0.19
402	0.22
403	0.24
404	0.24
405	0.25
406	0.27
407	0.33
408	0.36
409	0.35
410	0.31
411	0.29
412	0.29
413	0.29
414	0.27
415	0.21
416	0.18
417	0.2
418	0.27
419	0.36
420	0.47
421	0.56
422	0.66
423	0.74
424	0.79
425	0.84
426	0.85
427	0.86
428	0.87
429	0.87
430	0.81
431	0.77
432	0.75
433	0.68
434	0.61
435	0.55
436	0.51
437	0.47
438	0.45
439	0.44
440	0.41
441	0.41
442	0.43
443	0.41
444	0.34
445	0.29
446	0.32
447	0.36
448	0.44
449	0.49
450	0.52
451	0.56
452	0.6
453	0.66
454	0.71
455	0.71
456	0.71
457	0.73
458	0.7

J5JVA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer