Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A166BN79

Protein Details
Accession A0A166BN79    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-238SDDGRPKRGKGKAKARQRELBasic
251-277SDDGRPRKGKGKKAKGKQKPPVEHDDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-235RPKRGKGKAKARQ
255-274RPRKGKGKKAKGKQKPPVEH
278-284PAPAKAK
Subcellular Location(s) mito_nucl 10.666, nucl 10, mito 10, cyto_nucl 9.166, cyto_mito 9.166, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018023  Ribosome_mat_SBDS_CS  
IPR036786  Ribosome_mat_SBDS_N_sf  
IPR002140  Sdo1/SBDS  
IPR039100  Sdo1/SBDS-like  
IPR046928  SDO1/SBDS_C  
IPR018978  SDO1/SBDS_central  
IPR037188  Sdo1/SBDS_central_sf  
IPR019783  SDO1/SBDS_N  
Gene Ontology GO:0042256  P:cytosolic ribosome assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01172  SBDS  
PF20268  SBDS_C  
PF09377  SBDS_domain_II  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01267  UPF0023  
Amino Acid Sequences MLVQQPSNQIKLTNVSIVRLKKGGKRFEIACYKNKVQEWRSGVETDLDDVLQIANVFMNVSKGEVAKSEDLSKAFGTSDIEAIVKEILKKGELQVGEKERAHELDNLWKEIAAQVAEKCVDPSTGRPYSVGIIEKAMREAGFSVETGKPAKSQVSKCIKLIQTESKLPLQRARMRIRVVLAAAAAPQTPPVAAASRAEPKLLASDGGTPAAGSAIDSDSDDGRPKRGKGKAKARQRELEIAAASLTLDSDSDDGRPRKGKGKKAKGKQKPPVEHDDAPAPAKAKKALPAHVQQLSSISDAELRKRIVECAEQVEKETTNDGALGDEWEVVMLIDPASLKTINDLLQKESRGRGRTETLALNASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.35
4 0.36
5 0.38
6 0.38
7 0.4
8 0.4
9 0.49
10 0.54
11 0.53
12 0.57
13 0.55
14 0.6
15 0.66
16 0.63
17 0.62
18 0.62
19 0.61
20 0.61
21 0.63
22 0.63
23 0.55
24 0.59
25 0.56
26 0.52
27 0.51
28 0.45
29 0.41
30 0.35
31 0.32
32 0.25
33 0.2
34 0.16
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.08
39 0.07
40 0.06
41 0.05
42 0.05
43 0.06
44 0.05
45 0.07
46 0.06
47 0.07
48 0.08
49 0.09
50 0.09
51 0.11
52 0.15
53 0.16
54 0.18
55 0.2
56 0.21
57 0.21
58 0.23
59 0.21
60 0.18
61 0.16
62 0.15
63 0.14
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.18
79 0.18
80 0.2
81 0.25
82 0.29
83 0.33
84 0.33
85 0.33
86 0.29
87 0.29
88 0.29
89 0.25
90 0.21
91 0.26
92 0.28
93 0.27
94 0.26
95 0.24
96 0.22
97 0.2
98 0.2
99 0.11
100 0.1
101 0.09
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.13
110 0.19
111 0.21
112 0.21
113 0.2
114 0.21
115 0.21
116 0.23
117 0.21
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.15
122 0.15
123 0.14
124 0.11
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.11
131 0.1
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.12
136 0.13
137 0.17
138 0.2
139 0.22
140 0.31
141 0.39
142 0.4
143 0.41
144 0.47
145 0.44
146 0.4
147 0.42
148 0.39
149 0.34
150 0.35
151 0.36
152 0.34
153 0.34
154 0.33
155 0.33
156 0.32
157 0.34
158 0.4
159 0.43
160 0.43
161 0.42
162 0.43
163 0.4
164 0.34
165 0.28
166 0.21
167 0.15
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.06
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.14
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.14
188 0.13
189 0.11
190 0.07
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.09
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.12
208 0.11
209 0.15
210 0.19
211 0.21
212 0.28
213 0.35
214 0.44
215 0.5
216 0.6
217 0.65
218 0.73
219 0.8
220 0.79
221 0.77
222 0.72
223 0.69
224 0.59
225 0.54
226 0.43
227 0.34
228 0.27
229 0.2
230 0.16
231 0.09
232 0.07
233 0.04
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.14
240 0.15
241 0.19
242 0.23
243 0.25
244 0.34
245 0.41
246 0.5
247 0.54
248 0.65
249 0.71
250 0.77
251 0.86
252 0.87
253 0.91
254 0.9
255 0.9
256 0.87
257 0.84
258 0.82
259 0.79
260 0.7
261 0.62
262 0.56
263 0.48
264 0.4
265 0.35
266 0.28
267 0.22
268 0.22
269 0.23
270 0.21
271 0.27
272 0.3
273 0.35
274 0.4
275 0.44
276 0.49
277 0.5
278 0.48
279 0.4
280 0.38
281 0.33
282 0.27
283 0.21
284 0.15
285 0.16
286 0.17
287 0.21
288 0.23
289 0.22
290 0.24
291 0.25
292 0.27
293 0.25
294 0.29
295 0.28
296 0.31
297 0.35
298 0.33
299 0.34
300 0.35
301 0.32
302 0.28
303 0.27
304 0.2
305 0.15
306 0.15
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.11
327 0.14
328 0.18
329 0.24
330 0.25
331 0.28
332 0.33
333 0.37
334 0.38
335 0.43
336 0.46
337 0.44
338 0.46
339 0.46
340 0.47
341 0.48
342 0.5
343 0.46
344 0.42