FuNGI

A0A165CP78

Protein Details

Accession

A0A165CP78

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
239-258	ATSTHKPTRRVNVQKRDWAH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
512-542	RVGARGAAAQRPTGRGTPRGGRGGPGRGGGP

Subcellular Location(s)

cyto 15.5, cyto_nucl 11.5, nucl 6.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MADDERSYSELAELVHNGNADKDVLLKELGLDGVPSRDEILRELEDRYLTPKDVLPDHWLSTYQIHWEHKTDITSLLKLEPSPPQVTLVPTRAGLDGRVVGWAEAATRPPPSARTSMSLNRAPAPPKNFVRGKAGYVPYMPGGLEDVLAEAEERKGQSATSIPGLRTVPPGFERGLRLGGDAEADDVMDLDGQPTSERVQPATETTYRPQAQAPLSAGTERQSEIDELLPTSRAYLTAATSTHKPTRRVNVQKRDWAHVIDVRRPMTRFHELVPNMAHSYPFELDTFQKEAVYHLEMGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAMKHMTRAIYTSPIKALSNQKFRDFKTTFSSASVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDAERGVVWEEVIIMLPDHVNIILLSATVPNTREFADWIGRTKKKDIYVISTPQRPVPLEHFLYAGKDMYKIVDSTGTFLGQGYKDAGEGLRRKQDKEREAAGLPPVQRVGARGAAAQRPTGRGTPRGGRGGPGRGGGPGRTIGVDKNLYVHMLGLLKKKHLLPVVVFTFSKRRCEENASTLTNLDLGSAAERSEVHIVIEKALARLKGSDKRLPQIARMRDLLSRGIGVHHGGLLPIVKEVVEILFSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARCVVFSNTRKHDGRSFRDLNPGEYTQMSGRAGRRGLDSTGVVIIVVNDELPDTGNLTKMLLGTPTRLVSQFRLTYNMILNLLRVEALRVEEMIKRSFSENSTQRLLPDQQKKVLENEDRLRSLARLDCEICNPDINAYYDACFSITAKNQRLVELGMKSVLGDKYMTMGRVVVLRDGHFPGNVAVLLKRAPSTVTGGGVIDSVRVYHVIALATAEVKAGEEEVDPLAVPPRWPPNPKVLLAQDGQYDFSTVPVTNIWMVTNRVIKVDADSIVDRGKVSAVNDAVRQLREVSAEWTAAGDTIPEVDWSKIRALDFQDVLHSRNALAASLQNKSCLLCGDFDAHYQAFHGEKVLRAKIADLKLQISDQNLELLPEYESRIEVLKELNFIDNNSTVVLKGRVACEINTAHELILTELILENTLAAYEPEEVVALLSCFVFQEKTDVEPVIPEKLQGGLDAIRRIADRVGRVQLQHRVSEQDFENKIKSGLVEVVYEWAKGMVRATLDQAFDTEETP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.17
3	0.17
4	0.17
5	0.16
6	0.16
7	0.14
8	0.12
9	0.13
10	0.13
11	0.14
12	0.14
13	0.13
14	0.13
15	0.13
16	0.13
17	0.1
18	0.1
19	0.09
20	0.11
21	0.11
22	0.11
23	0.12
24	0.14
25	0.15
26	0.16
27	0.2
28	0.22
29	0.23
30	0.24
31	0.25
32	0.24
33	0.24
34	0.27
35	0.25
36	0.23
37	0.24
38	0.25
39	0.26
40	0.28
41	0.3
42	0.32
43	0.33
44	0.34
45	0.33
46	0.31
47	0.29
48	0.29
49	0.27
50	0.26
51	0.29
52	0.32
53	0.34
54	0.36
55	0.37
56	0.38
57	0.38
58	0.34
59	0.33
60	0.32
61	0.3
62	0.28
63	0.28
64	0.26
65	0.25
66	0.26
67	0.26
68	0.28
69	0.29
70	0.28
71	0.29
72	0.29
73	0.33
74	0.36
75	0.33
76	0.3
77	0.28
78	0.29
79	0.27
80	0.26
81	0.22
82	0.18
83	0.16
84	0.15
85	0.16
86	0.15
87	0.13
88	0.13
89	0.12
90	0.11
91	0.1
92	0.12
93	0.12
94	0.13
95	0.15
96	0.16
97	0.19
98	0.22
99	0.26
100	0.27
101	0.29
102	0.35
103	0.41
104	0.46
105	0.48
106	0.46
107	0.45
108	0.46
109	0.47
110	0.47
111	0.45
112	0.46
113	0.46
114	0.53
115	0.53
116	0.51
117	0.56
118	0.51
119	0.51
120	0.51
121	0.49
122	0.43
123	0.39
124	0.38
125	0.3
126	0.28
127	0.23
128	0.14
129	0.13
130	0.11
131	0.1
132	0.08
133	0.08
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.06
138	0.07
139	0.09
140	0.1
141	0.11
142	0.11
143	0.11
144	0.13
145	0.16
146	0.18
147	0.22
148	0.25
149	0.23
150	0.28
151	0.29
152	0.28
153	0.3
154	0.28
155	0.25
156	0.24
157	0.26
158	0.23
159	0.25
160	0.27
161	0.24
162	0.27
163	0.23
164	0.22
165	0.2
166	0.19
167	0.16
168	0.13
169	0.11
170	0.08
171	0.08
172	0.06
173	0.06
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.04
178	0.05
179	0.05
180	0.06
181	0.07
182	0.09
183	0.13
184	0.14
185	0.14
186	0.16
187	0.17
188	0.2
189	0.25
190	0.26
191	0.26
192	0.28
193	0.36
194	0.35
195	0.35
196	0.34
197	0.34
198	0.33
199	0.33
200	0.33
201	0.26
202	0.26
203	0.25
204	0.24
205	0.2
206	0.2
207	0.16
208	0.14
209	0.13
210	0.13
211	0.13
212	0.15
213	0.14
214	0.13
215	0.13
216	0.14
217	0.12
218	0.13
219	0.12
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.11
224	0.13
225	0.14
226	0.15
227	0.18
228	0.23
229	0.3
230	0.34
231	0.37
232	0.42
233	0.51
234	0.59
235	0.67
236	0.72
237	0.76
238	0.78
239	0.82
240	0.79
241	0.75
242	0.67
243	0.58
244	0.51
245	0.45
246	0.41
247	0.39
248	0.41
249	0.37
250	0.38
251	0.37
252	0.36
253	0.38
254	0.4
255	0.35
256	0.32
257	0.38
258	0.35
259	0.38
260	0.37
261	0.33
262	0.28
263	0.27
264	0.25
265	0.16
266	0.19
267	0.16
268	0.16
269	0.13
270	0.13
271	0.14
272	0.18
273	0.2
274	0.17
275	0.17
276	0.16
277	0.17
278	0.18
279	0.19
280	0.15
281	0.13
282	0.13
283	0.12
284	0.12
285	0.11
286	0.07
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.06
308	0.05
309	0.07
310	0.07
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.1
316	0.12
317	0.17
318	0.19
319	0.2
320	0.21
321	0.22
322	0.22
323	0.26
324	0.34
325	0.35
326	0.43
327	0.45
328	0.51
329	0.54
330	0.55
331	0.6
332	0.51
333	0.45
334	0.42
335	0.43
336	0.37
337	0.33
338	0.33
339	0.23
340	0.23
341	0.2
342	0.13
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.07
366	0.08
367	0.09
368	0.12
369	0.1
370	0.1
371	0.11
372	0.13
373	0.14
374	0.13
375	0.15
376	0.12
377	0.12
378	0.12
379	0.11
380	0.09
381	0.09
382	0.1
383	0.07
384	0.06
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.09
389	0.09
390	0.07
391	0.09
392	0.09
393	0.07
394	0.07
395	0.08
396	0.09
397	0.08
398	0.08
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.05
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.05
417	0.05
418	0.06
419	0.07
420	0.08
421	0.09
422	0.1
423	0.1
424	0.1
425	0.12
426	0.17
427	0.17
428	0.22
429	0.29
430	0.31
431	0.33
432	0.36
433	0.39
434	0.36
435	0.41
436	0.38
437	0.37
438	0.4
439	0.45
440	0.46
441	0.46
442	0.43
443	0.39
444	0.39
445	0.33
446	0.29
447	0.26
448	0.27
449	0.24
450	0.24
451	0.23
452	0.21
453	0.21
454	0.2
455	0.16
456	0.1
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.08
462	0.08
463	0.1
464	0.1
465	0.12
466	0.12
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.12
471	0.09
472	0.1
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.12
479	0.15
480	0.17
481	0.24
482	0.26
483	0.28
484	0.35
485	0.43
486	0.42
487	0.45
488	0.45
489	0.4
490	0.4
491	0.39
492	0.34
493	0.29
494	0.25
495	0.2
496	0.17
497	0.14
498	0.13
499	0.12
500	0.13
501	0.11
502	0.11
503	0.12
504	0.14
505	0.17
506	0.17
507	0.18
508	0.16
509	0.16
510	0.18
511	0.2
512	0.19
513	0.2
514	0.23
515	0.26
516	0.3
517	0.31
518	0.3
519	0.29
520	0.3
521	0.3
522	0.28
523	0.23
524	0.19
525	0.17
526	0.17
527	0.15
528	0.13
529	0.1
530	0.09
531	0.09
532	0.09
533	0.08
534	0.11
535	0.11
536	0.1
537	0.11
538	0.11
539	0.11
540	0.1
541	0.09
542	0.07
543	0.09
544	0.12
545	0.14
546	0.15
547	0.15
548	0.18
549	0.18
550	0.2
551	0.2
552	0.19
553	0.16
554	0.21
555	0.23
556	0.22
557	0.21
558	0.19
559	0.25
560	0.24
561	0.29
562	0.24
563	0.25
564	0.26
565	0.33
566	0.35
567	0.34
568	0.38
569	0.35
570	0.33
571	0.3
572	0.28
573	0.21
574	0.18
575	0.11
576	0.06
577	0.04
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.04
582	0.04
583	0.06
584	0.07
585	0.07
586	0.06
587	0.09
588	0.09
589	0.1
590	0.11
591	0.1
592	0.1
593	0.11
594	0.11
595	0.08
596	0.1
597	0.14
598	0.19
599	0.24
600	0.28
601	0.29
602	0.31
603	0.37
604	0.36
605	0.38
606	0.4
607	0.38
608	0.36
609	0.36
610	0.35
611	0.3
612	0.31
613	0.25
614	0.17
615	0.14
616	0.11
617	0.1
618	0.09
619	0.08
620	0.07
621	0.06
622	0.06
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.04
628	0.04
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.04
633	0.04
634	0.05
635	0.06
636	0.06
637	0.07
638	0.07
639	0.08
640	0.08
641	0.07
642	0.07
643	0.06
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.07
648	0.06
649	0.07
650	0.07
651	0.06
652	0.06
653	0.06
654	0.07
655	0.08
656	0.08
657	0.07
658	0.08
659	0.08
660	0.08
661	0.08
662	0.1
663	0.17
664	0.23
665	0.31
666	0.34
667	0.41
668	0.42
669	0.43
670	0.48
671	0.47
672	0.48
673	0.49
674	0.5
675	0.45
676	0.53
677	0.51
678	0.46
679	0.42
680	0.37
681	0.29
682	0.24
683	0.24
684	0.15
685	0.17
686	0.15
687	0.14
688	0.14
689	0.17
690	0.17
691	0.17
692	0.19
693	0.18
694	0.18
695	0.17
696	0.15
697	0.12
698	0.12
699	0.11
700	0.09
701	0.07
702	0.06
703	0.04
704	0.04
705	0.03
706	0.03
707	0.03
708	0.03
709	0.04
710	0.04
711	0.05
712	0.06
713	0.07
714	0.07
715	0.07
716	0.08
717	0.08
718	0.08
719	0.08
720	0.09
721	0.09
722	0.11
723	0.11
724	0.12
725	0.13
726	0.14
727	0.14
728	0.19
729	0.21
730	0.21
731	0.24
732	0.24
733	0.25
734	0.25
735	0.24
736	0.19
737	0.16
738	0.15
739	0.11
740	0.11
741	0.09
742	0.07
743	0.06
744	0.06
745	0.07
746	0.07
747	0.07
748	0.08
749	0.11
750	0.13
751	0.14
752	0.14
753	0.14
754	0.16
755	0.18
756	0.18
757	0.24
758	0.26
759	0.29
760	0.32
761	0.31
762	0.3
763	0.32
764	0.36
765	0.36
766	0.4
767	0.4
768	0.42
769	0.45
770	0.46
771	0.44
772	0.47
773	0.43
774	0.41
775	0.44
776	0.43
777	0.41
778	0.4
779	0.37
780	0.3
781	0.29
782	0.25
783	0.2
784	0.19
785	0.2
786	0.2
787	0.22
788	0.24
789	0.21
790	0.19
791	0.17
792	0.15
793	0.15
794	0.16
795	0.15
796	0.13
797	0.13
798	0.12
799	0.13
800	0.12
801	0.1
802	0.09
803	0.12
804	0.17
805	0.24
806	0.26
807	0.31
808	0.31
809	0.32
810	0.32
811	0.29
812	0.28
813	0.22
814	0.2
815	0.15
816	0.15
817	0.14
818	0.16
819	0.14
820	0.1
821	0.09
822	0.09
823	0.11
824	0.13
825	0.13
826	0.09
827	0.1
828	0.09
829	0.12
830	0.12
831	0.12
832	0.12
833	0.13
834	0.16
835	0.18
836	0.18
837	0.15
838	0.15
839	0.13
840	0.13
841	0.12
842	0.1
843	0.08
844	0.09
845	0.09
846	0.1
847	0.1
848	0.09
849	0.09
850	0.1
851	0.14
852	0.14
853	0.14
854	0.14
855	0.14
856	0.13
857	0.13
858	0.12
859	0.08
860	0.06
861	0.05
862	0.05
863	0.06
864	0.06
865	0.06
866	0.07
867	0.07
868	0.07
869	0.07
870	0.07
871	0.08
872	0.07
873	0.07
874	0.05
875	0.05
876	0.05
877	0.05
878	0.05
879	0.05
880	0.06
881	0.06
882	0.07
883	0.06
884	0.07
885	0.1
886	0.09
887	0.1
888	0.13
889	0.2
890	0.27
891	0.31
892	0.33
893	0.4
894	0.45
895	0.47
896	0.49
897	0.43
898	0.41
899	0.38
900	0.37
901	0.3
902	0.26
903	0.25
904	0.19
905	0.18
906	0.13
907	0.13
908	0.13
909	0.1
910	0.1
911	0.09
912	0.1
913	0.1
914	0.11
915	0.11
916	0.11
917	0.13
918	0.16
919	0.2
920	0.19
921	0.2
922	0.2
923	0.2
924	0.2
925	0.21
926	0.18
927	0.16
928	0.16
929	0.17
930	0.17
931	0.17
932	0.15
933	0.12
934	0.12
935	0.11
936	0.12
937	0.16
938	0.16
939	0.18
940	0.19
941	0.22
942	0.24
943	0.23
944	0.23
945	0.19
946	0.18
947	0.18
948	0.18
949	0.17
950	0.16
951	0.16
952	0.14
953	0.13
954	0.12
955	0.11
956	0.09
957	0.07
958	0.05
959	0.05
960	0.06
961	0.07
962	0.08
963	0.09
964	0.11
965	0.12
966	0.15
967	0.17
968	0.17
969	0.2
970	0.22
971	0.27
972	0.27
973	0.26
974	0.3
975	0.29
976	0.3
977	0.28
978	0.24
979	0.18
980	0.2
981	0.2
982	0.13
983	0.12
984	0.15
985	0.16
986	0.21
987	0.21
988	0.2
989	0.2
990	0.2
991	0.2
992	0.19
993	0.17
994	0.14
995	0.15
996	0.18
997	0.18
998	0.18
999	0.22
1000	0.19
1001	0.17
1002	0.17
1003	0.17
1004	0.14
1005	0.13
1006	0.16
1007	0.13
1008	0.17
1009	0.23
1010	0.25
1011	0.24
1012	0.24
1013	0.27
1014	0.31
1015	0.33
1016	0.34
1017	0.29
1018	0.29
1019	0.29
1020	0.3
1021	0.29
1022	0.24
1023	0.22
1024	0.18
1025	0.19
1026	0.17
1027	0.16
1028	0.16
1029	0.15
1030	0.14
1031	0.13
1032	0.15
1033	0.12
1034	0.12
1035	0.13
1036	0.14
1037	0.13
1038	0.13
1039	0.16
1040	0.15
1041	0.17
1042	0.18
1043	0.21
1044	0.2
1045	0.2
1046	0.22
1047	0.2
1048	0.19
1049	0.18
1050	0.16
1051	0.13
1052	0.15
1053	0.16
1054	0.15
1055	0.17
1056	0.17
1057	0.21
1058	0.22
1059	0.22
1060	0.24
1061	0.25
1062	0.26
1063	0.25
1064	0.25
1065	0.2
1066	0.19
1067	0.19
1068	0.15
1069	0.14
1070	0.11
1071	0.09
1072	0.09
1073	0.09
1074	0.08
1075	0.08
1076	0.06
1077	0.05
1078	0.06
1079	0.05
1080	0.05
1081	0.06
1082	0.07
1083	0.07
1084	0.07
1085	0.08
1086	0.07
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.07
1090	0.06
1091	0.06
1092	0.06
1093	0.06
1094	0.07
1095	0.08
1096	0.07
1097	0.13
1098	0.14
1099	0.17
1100	0.19
1101	0.2
1102	0.19
1103	0.22
1104	0.24
1105	0.24
1106	0.23
1107	0.21
1108	0.19
1109	0.2
1110	0.21
1111	0.16
1112	0.17
1113	0.16
1114	0.2
1115	0.22
1116	0.21
1117	0.21
1118	0.21
1119	0.22
1120	0.24
1121	0.24
1122	0.24
1123	0.28
1124	0.34
1125	0.36
1126	0.39
1127	0.44
1128	0.49
1129	0.48
1130	0.47
1131	0.43
1132	0.43
1133	0.41
1134	0.44
1135	0.4
1136	0.41
1137	0.41
1138	0.41
1139	0.42
1140	0.36
1141	0.35
1142	0.31
1143	0.28
1144	0.21
1145	0.22
1146	0.2
1147	0.18
1148	0.17
1149	0.22
1150	0.21
1151	0.21
1152	0.18
1153	0.15
1154	0.14
1155	0.14
1156	0.15
1157	0.12
1158	0.14
1159	0.16
1160	0.2
1161	0.22
1162	0.22
1163	0.22
1164	0.22
1165	0.22

A0A165CP78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer