Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4WIJ8

Protein Details
Accession J4WIJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
578-597QVNKMLKKKGREARLKVANNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
584-592KKKGREARL
609-632RERAKQTRMHKDEEKAEKRAGKPK
Subcellular Location(s) mito 24.5, cyto_mito 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001412  aa-tRNA-synth_I_CS  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
IPR024088  Tyr-tRNA-ligase_bac-type  
IPR032005  TyrRSs_C  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
PF16714  TyrRSs_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00178  AA_TRNA_LIGASE_I  
CDD cd00805  TyrRS_core  
Amino Acid Sequences MAARLTATALAPIRTASHSLCVGRQLRNPLSRDQQIRGIAHSYLLKVAEGEKRWKERAKQIQDGELRHVWDILDERGYIKDVAGDPDRIKEIMRVKRIGAYVGIDPTADSMHVGHMLALMPLFWLWFHGHPAVTLIGGATARIGDPTGRLTSRQQLSNADISKNITKLHYQLTKLWHNVIQMRIKYGYSDDWAAKRHLLNNNMWLGGLTTYDFIKRLARHTRIGPMLSRDTVKRKMSEGDGMSLGEFMYPLMQGWDFWHMYSKINIQMQIGGSDQYGNIVAGIDALKTIRETEEAPYARMETGWQHEPVGFTVPLLTDSAGNKLGKSEGNAIWLDEFKTSAFDLYGYFMCRPDEEVEKLLKLFTFLPMDKIESVMEQHKADPTKRIAQHNLAFEFVSLIHGSQKALVEAQQHQYRFGGQLPHITKEPEPSSGLISANTRPRSDIRLPRSVMQLSPARLLFAAGLAPTAVEGQRLVKQQGAYVAAQPGQKRGLVPGNLNWTPMKMWYPEETAKFLLDDRMLILRKGKHNVRIIELMDDDEWKASGQTYPGEPYTGQVRRMKQEIIAQAAERGETLTMTQVNKMLKKKGREARLKVANNPEIEMPSKLEMRERAKQTRMHKDEEKAEKRAGKPKSGEDFDW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.17
4 0.2
5 0.23
6 0.25
7 0.26
8 0.32
9 0.35
10 0.38
11 0.43
12 0.48
13 0.52
14 0.57
15 0.58
16 0.57
17 0.61
18 0.63
19 0.63
20 0.58
21 0.57
22 0.56
23 0.54
24 0.5
25 0.44
26 0.36
27 0.34
28 0.32
29 0.26
30 0.22
31 0.21
32 0.18
33 0.16
34 0.2
35 0.24
36 0.26
37 0.33
38 0.39
39 0.45
40 0.52
41 0.59
42 0.62
43 0.66
44 0.72
45 0.73
46 0.75
47 0.72
48 0.74
49 0.73
50 0.68
51 0.64
52 0.56
53 0.48
54 0.39
55 0.36
56 0.26
57 0.22
58 0.22
59 0.18
60 0.17
61 0.15
62 0.16
63 0.17
64 0.19
65 0.16
66 0.13
67 0.16
68 0.15
69 0.2
70 0.22
71 0.25
72 0.24
73 0.27
74 0.29
75 0.24
76 0.24
77 0.25
78 0.31
79 0.36
80 0.42
81 0.41
82 0.4
83 0.45
84 0.45
85 0.41
86 0.33
87 0.27
88 0.23
89 0.22
90 0.21
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.12
95 0.09
96 0.07
97 0.06
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.04
111 0.06
112 0.08
113 0.09
114 0.13
115 0.14
116 0.14
117 0.15
118 0.17
119 0.15
120 0.12
121 0.11
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.05
132 0.06
133 0.09
134 0.13
135 0.14
136 0.16
137 0.19
138 0.27
139 0.32
140 0.34
141 0.33
142 0.33
143 0.36
144 0.41
145 0.4
146 0.32
147 0.29
148 0.29
149 0.3
150 0.28
151 0.25
152 0.2
153 0.19
154 0.21
155 0.28
156 0.3
157 0.29
158 0.33
159 0.38
160 0.43
161 0.43
162 0.43
163 0.37
164 0.35
165 0.37
166 0.38
167 0.38
168 0.32
169 0.34
170 0.32
171 0.3
172 0.27
173 0.25
174 0.21
175 0.17
176 0.19
177 0.19
178 0.2
179 0.22
180 0.23
181 0.24
182 0.24
183 0.28
184 0.31
185 0.33
186 0.33
187 0.36
188 0.36
189 0.33
190 0.31
191 0.24
192 0.19
193 0.15
194 0.13
195 0.07
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.13
202 0.14
203 0.2
204 0.29
205 0.33
206 0.36
207 0.38
208 0.44
209 0.42
210 0.43
211 0.38
212 0.33
213 0.32
214 0.3
215 0.29
216 0.26
217 0.29
218 0.34
219 0.35
220 0.32
221 0.31
222 0.33
223 0.33
224 0.36
225 0.31
226 0.26
227 0.24
228 0.22
229 0.2
230 0.17
231 0.14
232 0.08
233 0.06
234 0.04
235 0.04
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.06
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.14
246 0.14
247 0.16
248 0.17
249 0.18
250 0.19
251 0.21
252 0.22
253 0.18
254 0.19
255 0.18
256 0.17
257 0.15
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.07
279 0.08
280 0.16
281 0.16
282 0.17
283 0.17
284 0.17
285 0.16
286 0.15
287 0.14
288 0.08
289 0.12
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.11
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.06
305 0.07
306 0.09
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.11
313 0.12
314 0.15
315 0.12
316 0.15
317 0.15
318 0.15
319 0.14
320 0.14
321 0.13
322 0.09
323 0.08
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.06
331 0.07
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.14
341 0.15
342 0.17
343 0.17
344 0.17
345 0.17
346 0.15
347 0.13
348 0.11
349 0.1
350 0.09
351 0.12
352 0.12
353 0.14
354 0.15
355 0.16
356 0.15
357 0.15
358 0.13
359 0.1
360 0.12
361 0.12
362 0.13
363 0.12
364 0.13
365 0.16
366 0.19
367 0.19
368 0.23
369 0.24
370 0.31
371 0.35
372 0.4
373 0.41
374 0.45
375 0.48
376 0.48
377 0.45
378 0.37
379 0.32
380 0.26
381 0.22
382 0.15
383 0.12
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.09
392 0.09
393 0.11
394 0.12
395 0.15
396 0.21
397 0.24
398 0.23
399 0.24
400 0.24
401 0.23
402 0.21
403 0.21
404 0.19
405 0.15
406 0.23
407 0.25
408 0.27
409 0.26
410 0.27
411 0.25
412 0.27
413 0.28
414 0.22
415 0.21
416 0.2
417 0.21
418 0.21
419 0.21
420 0.16
421 0.16
422 0.18
423 0.24
424 0.25
425 0.24
426 0.24
427 0.26
428 0.32
429 0.38
430 0.43
431 0.42
432 0.49
433 0.5
434 0.51
435 0.54
436 0.48
437 0.4
438 0.36
439 0.34
440 0.27
441 0.29
442 0.26
443 0.21
444 0.2
445 0.2
446 0.15
447 0.1
448 0.09
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.04
454 0.06
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.08
459 0.13
460 0.16
461 0.17
462 0.18
463 0.19
464 0.2
465 0.23
466 0.24
467 0.2
468 0.19
469 0.2
470 0.2
471 0.23
472 0.22
473 0.21
474 0.2
475 0.2
476 0.19
477 0.21
478 0.25
479 0.25
480 0.27
481 0.29
482 0.36
483 0.35
484 0.36
485 0.32
486 0.26
487 0.24
488 0.24
489 0.22
490 0.15
491 0.18
492 0.2
493 0.26
494 0.3
495 0.31
496 0.32
497 0.31
498 0.29
499 0.27
500 0.24
501 0.21
502 0.16
503 0.14
504 0.13
505 0.18
506 0.18
507 0.19
508 0.24
509 0.27
510 0.33
511 0.41
512 0.45
513 0.47
514 0.54
515 0.56
516 0.56
517 0.54
518 0.49
519 0.44
520 0.39
521 0.33
522 0.25
523 0.23
524 0.18
525 0.13
526 0.13
527 0.1
528 0.09
529 0.08
530 0.1
531 0.1
532 0.13
533 0.14
534 0.18
535 0.18
536 0.2
537 0.19
538 0.19
539 0.27
540 0.28
541 0.32
542 0.35
543 0.4
544 0.43
545 0.47
546 0.47
547 0.41
548 0.45
549 0.44
550 0.43
551 0.39
552 0.34
553 0.33
554 0.32
555 0.28
556 0.21
557 0.16
558 0.11
559 0.09
560 0.09
561 0.11
562 0.14
563 0.15
564 0.17
565 0.2
566 0.25
567 0.32
568 0.37
569 0.42
570 0.46
571 0.52
572 0.61
573 0.66
574 0.71
575 0.75
576 0.78
577 0.79
578 0.82
579 0.8
580 0.77
581 0.78
582 0.73
583 0.64
584 0.58
585 0.49
586 0.41
587 0.38
588 0.33
589 0.25
590 0.24
591 0.25
592 0.24
593 0.28
594 0.33
595 0.38
596 0.46
597 0.51
598 0.56
599 0.6
600 0.66
601 0.7
602 0.73
603 0.72
604 0.71
605 0.7
606 0.69
607 0.73
608 0.76
609 0.74
610 0.68
611 0.69
612 0.69
613 0.68
614 0.69
615 0.66
616 0.63
617 0.62
618 0.67
619 0.69