Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JMB8

Protein Details
Accession J5JMB8    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-55LLEKHKDYSKRAKDYNKKKAQLKSLRVKAHydrophilic
210-234QDTEREKSLRRLRRQLENARKKVKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-52RAQPLERRRLGLLEKHKDYSKRAKDYNKKKAQLKSLR
165-167KPK
259-272TRRGKKIVVRARKR
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSMRNAVDRRVHRERAQPLERRRLGLLEKHKDYSKRAKDYNKKKAQLKSLRVKAAERNEDEFYFGMMSRKGPGSRIKDGKSWSGTVQGDRGNKVLDMDTARLLKTQDMGYIRTMKQVITKEIAKLEEQVVMTRGMDRLGEDDDNGDDFDGFDSDEDEPVRKPSKPKAARKILFFDDEDAQEDAMEEHLELEEREAEKEDGKHGEEEDSQDTEREKSLRRLRRQLENARKKVKVLTDAEEALEEQRAKMAKTATSGGTTRRGKKIVVRARKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.69
3 0.7
4 0.73
5 0.73
6 0.73
7 0.78
8 0.75
9 0.69
10 0.62
11 0.57
12 0.53
13 0.53
14 0.55
15 0.53
16 0.55
17 0.56
18 0.6
19 0.58
20 0.6
21 0.62
22 0.62
23 0.61
24 0.65
25 0.71
26 0.76
27 0.83
28 0.87
29 0.87
30 0.85
31 0.84
32 0.84
33 0.84
34 0.83
35 0.82
36 0.82
37 0.8
38 0.78
39 0.72
40 0.68
41 0.65
42 0.64
43 0.62
44 0.55
45 0.51
46 0.47
47 0.45
48 0.43
49 0.35
50 0.27
51 0.19
52 0.16
53 0.14
54 0.12
55 0.12
56 0.13
57 0.16
58 0.16
59 0.18
60 0.26
61 0.31
62 0.39
63 0.46
64 0.46
65 0.47
66 0.5
67 0.52
68 0.47
69 0.42
70 0.34
71 0.34
72 0.32
73 0.28
74 0.29
75 0.27
76 0.26
77 0.26
78 0.26
79 0.19
80 0.18
81 0.18
82 0.15
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.13
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.21
99 0.21
100 0.22
101 0.22
102 0.18
103 0.22
104 0.23
105 0.23
106 0.21
107 0.22
108 0.2
109 0.22
110 0.22
111 0.18
112 0.17
113 0.15
114 0.14
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.07
133 0.06
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.11
147 0.14
148 0.14
149 0.18
150 0.25
151 0.36
152 0.44
153 0.54
154 0.61
155 0.69
156 0.71
157 0.72
158 0.7
159 0.62
160 0.55
161 0.46
162 0.38
163 0.3
164 0.26
165 0.24
166 0.19
167 0.16
168 0.12
169 0.12
170 0.09
171 0.07
172 0.07
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.13
184 0.15
185 0.16
186 0.18
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.18
191 0.2
192 0.18
193 0.21
194 0.2
195 0.2
196 0.19
197 0.19
198 0.19
199 0.18
200 0.19
201 0.19
202 0.2
203 0.28
204 0.38
205 0.46
206 0.54
207 0.63
208 0.67
209 0.75
210 0.81
211 0.82
212 0.84
213 0.85
214 0.85
215 0.83
216 0.78
217 0.69
218 0.65
219 0.6
220 0.57
221 0.51
222 0.47
223 0.44
224 0.43
225 0.42
226 0.36
227 0.31
228 0.23
229 0.23
230 0.18
231 0.12
232 0.15
233 0.16
234 0.16
235 0.2
236 0.22
237 0.2
238 0.23
239 0.27
240 0.25
241 0.28
242 0.29
243 0.29
244 0.36
245 0.41
246 0.44
247 0.48
248 0.49
249 0.48
250 0.55
251 0.62
252 0.63