Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165PDX8

Protein Details
Accession A0A165PDX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
152-179STGTKRHRTSPNSPRKRRRTSSKLDLFSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
158-170HRTSPNSPRKRRR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047126  RNF141-like  
IPR027370  Znf-RING_euk  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13445  zf-RING_UBOX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MPAPGDESDDSFDFNEDELDQILAVQPLAQPAAPPPAPIATAPVLHAVQATRTDDDDFFDDFDEDTLAALDAFEAAYARQEQDAAAGLAPSHANQAAAVPAQPPAGPSAAPIRPAARASRPGPAASIHVSSSPAIESSLPASSAMSNNTNASTGTKRHRTSPNSPRKRRRTSSKLDLFSEPNTLRVDKSTVEKLAEEAQCPVCFEHMAEPHSVVPCGHSVCADCLNTWLTTKKKASKQLECPVCRSVLDPDTAVVPNFTLKSVLTATLPLLPADKQQTWLQRTEAWKGTWTYNNVPVPVVPLFLPDFESESDDDDLDSDSDDDISDDGEPDDDVENAAVEVAAVWIAEMPQDIFVDLT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.1
4 0.11
5 0.1
6 0.09
7 0.08
8 0.08
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.1
16 0.1
17 0.09
18 0.11
19 0.19
20 0.18
21 0.18
22 0.18
23 0.19
24 0.2
25 0.19
26 0.22
27 0.16
28 0.17
29 0.17
30 0.19
31 0.17
32 0.16
33 0.17
34 0.13
35 0.14
36 0.17
37 0.19
38 0.16
39 0.18
40 0.2
41 0.19
42 0.21
43 0.22
44 0.18
45 0.16
46 0.16
47 0.15
48 0.13
49 0.13
50 0.11
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.03
62 0.03
63 0.06
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.11
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.15
96 0.15
97 0.17
98 0.18
99 0.17
100 0.19
101 0.21
102 0.23
103 0.21
104 0.26
105 0.26
106 0.31
107 0.31
108 0.3
109 0.29
110 0.26
111 0.25
112 0.2
113 0.2
114 0.14
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.1
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.13
140 0.15
141 0.21
142 0.28
143 0.29
144 0.36
145 0.44
146 0.48
147 0.56
148 0.62
149 0.67
150 0.71
151 0.8
152 0.83
153 0.85
154 0.88
155 0.86
156 0.85
157 0.83
158 0.81
159 0.82
160 0.81
161 0.74
162 0.67
163 0.62
164 0.53
165 0.45
166 0.41
167 0.3
168 0.24
169 0.21
170 0.19
171 0.16
172 0.15
173 0.16
174 0.12
175 0.15
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.21
182 0.2
183 0.18
184 0.17
185 0.18
186 0.17
187 0.18
188 0.17
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.12
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.12
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.11
208 0.14
209 0.13
210 0.11
211 0.12
212 0.14
213 0.13
214 0.14
215 0.17
216 0.16
217 0.23
218 0.28
219 0.35
220 0.4
221 0.5
222 0.58
223 0.62
224 0.69
225 0.72
226 0.76
227 0.7
228 0.67
229 0.59
230 0.51
231 0.42
232 0.34
233 0.29
234 0.22
235 0.21
236 0.18
237 0.16
238 0.18
239 0.18
240 0.16
241 0.11
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.08
247 0.08
248 0.1
249 0.11
250 0.12
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.13
255 0.14
256 0.11
257 0.12
258 0.11
259 0.14
260 0.19
261 0.19
262 0.19
263 0.24
264 0.32
265 0.34
266 0.36
267 0.35
268 0.35
269 0.38
270 0.41
271 0.41
272 0.34
273 0.35
274 0.35
275 0.38
276 0.38
277 0.4
278 0.38
279 0.41
280 0.42
281 0.39
282 0.37
283 0.32
284 0.3
285 0.25
286 0.22
287 0.13
288 0.13
289 0.14
290 0.13
291 0.15
292 0.12
293 0.14
294 0.14
295 0.16
296 0.14
297 0.16
298 0.17
299 0.15
300 0.14
301 0.13
302 0.13
303 0.11
304 0.11
305 0.08
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.03
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.08
338 0.08