Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4W4G8

Protein Details
Accession J4W4G8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-159EPFLADRRKLRRKGRERTTLTYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-152RRKLRRKGR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKSDTIPADARRFLDERGSNVGLAPNGLNPANIMEKAVKDRITDSYFYKEQCFALNEADIVDRVVEHVRFIGGTSGTAQKPSPFLCLAFKLLELSPSDAVLAEYLAYGGEHFKYLRALACFYLRLTRQAKDVYETLEPFLADRRKLRRKGRERTTLTYMDEFVDDLLSKDRVCATSLWKMPKREILEDLEVLEPRVSPLGDLEDLLEEEDEGAEDEGRTSENDRNGREESGEISDRDGMDIDREDRRSDSRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.39
3 0.35
4 0.33
5 0.37
6 0.37
7 0.32
8 0.31
9 0.32
10 0.23
11 0.21
12 0.18
13 0.12
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.1
18 0.13
19 0.14
20 0.14
21 0.15
22 0.14
23 0.16
24 0.21
25 0.25
26 0.24
27 0.22
28 0.24
29 0.29
30 0.3
31 0.3
32 0.29
33 0.32
34 0.33
35 0.33
36 0.34
37 0.29
38 0.27
39 0.28
40 0.27
41 0.22
42 0.21
43 0.2
44 0.18
45 0.16
46 0.16
47 0.12
48 0.1
49 0.08
50 0.06
51 0.07
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.1
60 0.07
61 0.08
62 0.1
63 0.14
64 0.14
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.14
72 0.15
73 0.17
74 0.18
75 0.19
76 0.17
77 0.17
78 0.15
79 0.14
80 0.15
81 0.13
82 0.13
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.09
88 0.07
89 0.06
90 0.04
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.15
111 0.13
112 0.19
113 0.2
114 0.2
115 0.21
116 0.23
117 0.23
118 0.22
119 0.22
120 0.18
121 0.18
122 0.17
123 0.15
124 0.13
125 0.13
126 0.1
127 0.15
128 0.15
129 0.15
130 0.19
131 0.28
132 0.37
133 0.45
134 0.55
135 0.61
136 0.69
137 0.77
138 0.82
139 0.83
140 0.81
141 0.78
142 0.75
143 0.67
144 0.59
145 0.5
146 0.41
147 0.3
148 0.24
149 0.18
150 0.12
151 0.09
152 0.07
153 0.06
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.15
163 0.22
164 0.27
165 0.36
166 0.4
167 0.41
168 0.43
169 0.49
170 0.48
171 0.43
172 0.42
173 0.38
174 0.36
175 0.34
176 0.34
177 0.28
178 0.24
179 0.21
180 0.18
181 0.12
182 0.1
183 0.11
184 0.09
185 0.07
186 0.08
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.11
208 0.15
209 0.22
210 0.28
211 0.29
212 0.34
213 0.36
214 0.36
215 0.34
216 0.31
217 0.26
218 0.27
219 0.28
220 0.23
221 0.23
222 0.24
223 0.23
224 0.22
225 0.2
226 0.15
227 0.15
228 0.18
229 0.19
230 0.23
231 0.24
232 0.26
233 0.28
234 0.32