Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JX52

Protein Details
Accession J5JX52    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-282VLKAPAPKKKKQQQQQQQPPLRRWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-268PKKK
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 10.333, cyto 7, cyto_nucl 6.333, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010378  TRAPPC13  
Pfam View protein in Pfam  
PF06159  DUF974  
Amino Acid Sequences MSHQRYLSHDPIKEPHSVSVKVLRFVCTLNAWHPHLKSSRLEPSSIPLILTDPLSRLHSLSCPSLVPQYPIEPPFKPSTTTTTAIAAAADASPLPASLAYHPSSTNPSPFLLSPILNLPVSFGSAYVGETFSCTLCANNDLDDSSSTATTKRQIRDVRVEAEMKTPGQTKAQSLELGPAPSSQESAAVGAAAAAATDLAPGGTLQKIVSFDLKEEGNHVLAVTVSYYEAAETSGRTRTFRKLYQFICKPSLIVRTKVGVLKAPAPKKKKQQQQQQQPPLRRWVLEAQLENCSDDTMQLDRVVMELEPGLTCRDCNWTAGAGAGSGSGSAGVQKPVLQPGEVEQVCFVIETRRGGNEEEEEDVDVVARARAAGGPDARVVFGVLGIGWRGEMGNRGFLSTGKLGTRVVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.45
3 0.43
4 0.42
5 0.41
6 0.44
7 0.45
8 0.45
9 0.44
10 0.4
11 0.35
12 0.35
13 0.35
14 0.29
15 0.28
16 0.28
17 0.33
18 0.34
19 0.39
20 0.38
21 0.42
22 0.43
23 0.44
24 0.43
25 0.44
26 0.5
27 0.46
28 0.47
29 0.41
30 0.42
31 0.43
32 0.39
33 0.31
34 0.21
35 0.21
36 0.2
37 0.21
38 0.16
39 0.12
40 0.14
41 0.16
42 0.17
43 0.16
44 0.17
45 0.19
46 0.21
47 0.22
48 0.21
49 0.19
50 0.2
51 0.26
52 0.25
53 0.24
54 0.23
55 0.25
56 0.28
57 0.31
58 0.34
59 0.28
60 0.31
61 0.35
62 0.34
63 0.33
64 0.3
65 0.34
66 0.35
67 0.36
68 0.33
69 0.29
70 0.28
71 0.25
72 0.23
73 0.16
74 0.11
75 0.08
76 0.07
77 0.05
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.04
83 0.06
84 0.08
85 0.12
86 0.13
87 0.15
88 0.15
89 0.17
90 0.23
91 0.24
92 0.24
93 0.21
94 0.21
95 0.22
96 0.21
97 0.23
98 0.2
99 0.18
100 0.16
101 0.17
102 0.18
103 0.16
104 0.16
105 0.14
106 0.11
107 0.12
108 0.11
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.08
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.16
137 0.21
138 0.22
139 0.29
140 0.34
141 0.39
142 0.47
143 0.5
144 0.46
145 0.43
146 0.43
147 0.36
148 0.34
149 0.3
150 0.21
151 0.19
152 0.18
153 0.16
154 0.17
155 0.18
156 0.16
157 0.17
158 0.19
159 0.18
160 0.16
161 0.18
162 0.16
163 0.15
164 0.14
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.06
194 0.07
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.04
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.07
220 0.11
221 0.12
222 0.13
223 0.16
224 0.22
225 0.27
226 0.32
227 0.37
228 0.4
229 0.43
230 0.52
231 0.55
232 0.52
233 0.51
234 0.46
235 0.4
236 0.35
237 0.41
238 0.34
239 0.31
240 0.28
241 0.26
242 0.28
243 0.3
244 0.28
245 0.21
246 0.2
247 0.25
248 0.3
249 0.36
250 0.41
251 0.45
252 0.51
253 0.59
254 0.67
255 0.69
256 0.72
257 0.76
258 0.79
259 0.85
260 0.89
261 0.89
262 0.88
263 0.85
264 0.79
265 0.76
266 0.67
267 0.56
268 0.48
269 0.43
270 0.41
271 0.4
272 0.39
273 0.33
274 0.35
275 0.35
276 0.32
277 0.26
278 0.2
279 0.15
280 0.12
281 0.12
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.17
303 0.17
304 0.17
305 0.18
306 0.16
307 0.1
308 0.09
309 0.08
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.11
320 0.13
321 0.18
322 0.19
323 0.17
324 0.16
325 0.19
326 0.28
327 0.26
328 0.25
329 0.2
330 0.19
331 0.19
332 0.18
333 0.16
334 0.1
335 0.13
336 0.15
337 0.17
338 0.2
339 0.21
340 0.23
341 0.26
342 0.25
343 0.24
344 0.24
345 0.23
346 0.21
347 0.2
348 0.18
349 0.15
350 0.12
351 0.1
352 0.08
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.08
357 0.1
358 0.14
359 0.16
360 0.17
361 0.2
362 0.2
363 0.2
364 0.18
365 0.17
366 0.12
367 0.1
368 0.09
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.13
378 0.14
379 0.2
380 0.2
381 0.21
382 0.22
383 0.22
384 0.27
385 0.24
386 0.25
387 0.2
388 0.22