Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4WIX4

Protein Details
Accession J4WIX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-209HGPDTRQRKRGRCRDFDSKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-276RGGRAGRAGKKNRGGKNSSRG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR002483  PWI_dom  
IPR036483  PWI_dom_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR045137  RBM26/27  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01480  PWI  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12257  RRM1_RBM26_like  
Amino Acid Sequences MLFPEEDAPQLKTWIVKRIENTSDADSDVLADYVIALLKHDGDQAAIRKLCEEEIPDFLTEDSKAFVDDVFQAIADKSYMPGATPAPKLPSASNSQTPANLPPRPSNSRKRGFDDGRDEHNYNSYSRHGERAHKQLRRGGRRNDNYSGFAPPIGMGTGLPPFDTSNPMEAFLRMHTMSMPFPGMPDYSGHGPDTRQRKRGRCRDFDSKGYCSRGSTCLYDHGQETDVFGDFNFGDGFMDMAHMMSRGPQFMGDAPRGGRAGRAGKKNRGGKNSSRGSRAAFSAEGPVQDRSKSTIVVENIPEECLSEERVRDFFAQFGNIQQVTMQTHKHLAIVKYNSWDEASAAYKSPKVIFNNRFVKVFWYKDEIKGPNVRGTKFGASGLEDGSNGGDDVGPAPELDAEEFQRRQEEAQRSHEEKESKRSELELKRQELEKQQQELLAKHRAETERLQAKLYAKSSSGNGGGTTDENGPPTGSTDMLRAKLALLEQEAKILGIDPENPDTEEGSLGGFRGGYRGRVYRGRGSFARGGFAPRGRGSFRGSGERHAAYAQFSIDNRPKKVAIAGVDFTSTEKDEALRHFLISNGDFESVESGAEKTMVSFPDRKTAEKFYFSLQGKELPGISGKLELSWVNTPLPPVGTGGASSAPAGPSAIGKAAAESEDVGEDFGNMEDQEGEYAGVGKARQDEPKREVNMDYEMPDEEAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.37
4 0.4
5 0.47
6 0.5
7 0.47
8 0.48
9 0.43
10 0.39
11 0.35
12 0.31
13 0.22
14 0.19
15 0.17
16 0.13
17 0.08
18 0.07
19 0.06
20 0.06
21 0.08
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.09
26 0.1
27 0.12
28 0.11
29 0.11
30 0.16
31 0.2
32 0.27
33 0.28
34 0.27
35 0.27
36 0.28
37 0.28
38 0.26
39 0.25
40 0.2
41 0.23
42 0.25
43 0.23
44 0.23
45 0.22
46 0.21
47 0.17
48 0.15
49 0.12
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.11
56 0.12
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.12
69 0.14
70 0.2
71 0.22
72 0.24
73 0.26
74 0.28
75 0.29
76 0.29
77 0.3
78 0.32
79 0.35
80 0.38
81 0.37
82 0.37
83 0.37
84 0.37
85 0.4
86 0.4
87 0.38
88 0.36
89 0.41
90 0.47
91 0.53
92 0.6
93 0.63
94 0.65
95 0.72
96 0.74
97 0.74
98 0.76
99 0.74
100 0.75
101 0.74
102 0.69
103 0.66
104 0.66
105 0.61
106 0.51
107 0.51
108 0.43
109 0.34
110 0.32
111 0.27
112 0.27
113 0.27
114 0.34
115 0.33
116 0.4
117 0.47
118 0.55
119 0.61
120 0.6
121 0.63
122 0.63
123 0.69
124 0.71
125 0.73
126 0.72
127 0.73
128 0.78
129 0.8
130 0.8
131 0.73
132 0.66
133 0.59
134 0.51
135 0.41
136 0.32
137 0.25
138 0.18
139 0.15
140 0.11
141 0.09
142 0.06
143 0.07
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.14
151 0.14
152 0.17
153 0.17
154 0.19
155 0.18
156 0.18
157 0.18
158 0.15
159 0.18
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.15
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.16
179 0.22
180 0.31
181 0.35
182 0.41
183 0.47
184 0.56
185 0.66
186 0.75
187 0.79
188 0.78
189 0.79
190 0.82
191 0.79
192 0.78
193 0.73
194 0.68
195 0.64
196 0.58
197 0.51
198 0.42
199 0.39
200 0.34
201 0.31
202 0.28
203 0.23
204 0.25
205 0.26
206 0.26
207 0.24
208 0.21
209 0.2
210 0.18
211 0.18
212 0.13
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.07
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.04
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.12
238 0.16
239 0.14
240 0.15
241 0.15
242 0.16
243 0.17
244 0.16
245 0.13
246 0.14
247 0.22
248 0.26
249 0.35
250 0.4
251 0.46
252 0.55
253 0.63
254 0.65
255 0.63
256 0.63
257 0.61
258 0.64
259 0.66
260 0.61
261 0.56
262 0.51
263 0.47
264 0.42
265 0.36
266 0.28
267 0.2
268 0.17
269 0.17
270 0.16
271 0.15
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.17
282 0.18
283 0.2
284 0.2
285 0.19
286 0.18
287 0.18
288 0.16
289 0.11
290 0.11
291 0.08
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.13
298 0.14
299 0.14
300 0.12
301 0.12
302 0.13
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.12
307 0.11
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.13
312 0.12
313 0.1
314 0.12
315 0.13
316 0.15
317 0.17
318 0.16
319 0.21
320 0.23
321 0.24
322 0.25
323 0.24
324 0.23
325 0.19
326 0.18
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.13
336 0.16
337 0.18
338 0.26
339 0.29
340 0.38
341 0.44
342 0.44
343 0.43
344 0.39
345 0.41
346 0.36
347 0.34
348 0.27
349 0.25
350 0.25
351 0.28
352 0.34
353 0.3
354 0.29
355 0.33
356 0.32
357 0.33
358 0.35
359 0.32
360 0.28
361 0.29
362 0.27
363 0.23
364 0.22
365 0.16
366 0.14
367 0.14
368 0.13
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.07
373 0.06
374 0.05
375 0.04
376 0.03
377 0.03
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.07
388 0.11
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.13
393 0.14
394 0.21
395 0.28
396 0.29
397 0.36
398 0.43
399 0.44
400 0.46
401 0.49
402 0.46
403 0.41
404 0.45
405 0.42
406 0.36
407 0.34
408 0.35
409 0.39
410 0.41
411 0.48
412 0.46
413 0.45
414 0.46
415 0.47
416 0.48
417 0.47
418 0.49
419 0.45
420 0.4
421 0.38
422 0.38
423 0.39
424 0.38
425 0.35
426 0.34
427 0.27
428 0.25
429 0.3
430 0.29
431 0.3
432 0.3
433 0.34
434 0.33
435 0.34
436 0.34
437 0.32
438 0.33
439 0.35
440 0.34
441 0.27
442 0.21
443 0.21
444 0.21
445 0.21
446 0.19
447 0.14
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.12
453 0.11
454 0.1
455 0.11
456 0.11
457 0.1
458 0.1
459 0.11
460 0.1
461 0.09
462 0.09
463 0.12
464 0.15
465 0.16
466 0.16
467 0.14
468 0.14
469 0.14
470 0.14
471 0.11
472 0.11
473 0.12
474 0.12
475 0.13
476 0.13
477 0.11
478 0.11
479 0.1
480 0.09
481 0.07
482 0.09
483 0.1
484 0.12
485 0.13
486 0.13
487 0.13
488 0.13
489 0.13
490 0.11
491 0.09
492 0.08
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.09
499 0.09
500 0.11
501 0.14
502 0.17
503 0.21
504 0.27
505 0.32
506 0.37
507 0.39
508 0.42
509 0.4
510 0.43
511 0.44
512 0.38
513 0.37
514 0.29
515 0.3
516 0.28
517 0.29
518 0.28
519 0.24
520 0.27
521 0.26
522 0.28
523 0.29
524 0.31
525 0.31
526 0.36
527 0.36
528 0.37
529 0.4
530 0.38
531 0.34
532 0.29
533 0.27
534 0.2
535 0.2
536 0.17
537 0.14
538 0.14
539 0.21
540 0.27
541 0.33
542 0.33
543 0.35
544 0.35
545 0.33
546 0.35
547 0.32
548 0.29
549 0.28
550 0.28
551 0.25
552 0.25
553 0.24
554 0.21
555 0.19
556 0.16
557 0.11
558 0.1
559 0.1
560 0.13
561 0.16
562 0.21
563 0.2
564 0.2
565 0.2
566 0.21
567 0.24
568 0.22
569 0.21
570 0.17
571 0.17
572 0.16
573 0.16
574 0.16
575 0.12
576 0.11
577 0.1
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.08
583 0.11
584 0.12
585 0.16
586 0.21
587 0.22
588 0.31
589 0.33
590 0.34
591 0.36
592 0.43
593 0.45
594 0.44
595 0.44
596 0.38
597 0.46
598 0.45
599 0.43
600 0.36
601 0.36
602 0.32
603 0.32
604 0.29
605 0.21
606 0.21
607 0.19
608 0.18
609 0.16
610 0.15
611 0.13
612 0.15
613 0.14
614 0.16
615 0.18
616 0.19
617 0.18
618 0.19
619 0.2
620 0.2
621 0.2
622 0.17
623 0.15
624 0.14
625 0.13
626 0.12
627 0.12
628 0.12
629 0.11
630 0.11
631 0.11
632 0.1
633 0.1
634 0.1
635 0.09
636 0.09
637 0.1
638 0.1
639 0.1
640 0.1
641 0.1
642 0.11
643 0.11
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.1
649 0.1
650 0.08
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.08
655 0.07
656 0.08
657 0.08
658 0.08
659 0.09
660 0.08
661 0.08
662 0.07
663 0.09
664 0.09
665 0.1
666 0.1
667 0.12
668 0.17
669 0.21
670 0.3
671 0.36
672 0.44
673 0.48
674 0.57
675 0.59
676 0.56
677 0.55
678 0.49
679 0.48
680 0.42
681 0.38
682 0.31
683 0.27