Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J5JTD0

Protein Details
Accession J5JTD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-28SSGGSRSSRSRAPRRHKRELSDSSIQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-19RSRAPRRHK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MSSSGGSRSSRSRAPRRHKRELSDSSIQIIEIRIVNKRPRTEERPATPPPPPREEQRLHDFEDSPPRRFNRTFQRATAGRFFVLSRERCDEWDCPQEEFELAGSTGNVYTIRIGRELWCDCEHSIRGNVCKHLVYILHRVLKAPFHFLYQWALLSSELRQIYDNLSRGNAAENRKAVEGECAICYNDFESGEDAQSRAVVWCRAGCGQNLHKTCFERWARSCIGNVTCPLCRSTWEAGNEDEDGGESWSDYWEETRHNLERNSRRFRRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.77
3 0.81
4 0.87
5 0.89
6 0.87
7 0.87
8 0.85
9 0.82
10 0.79
11 0.7
12 0.62
13 0.54
14 0.45
15 0.36
16 0.28
17 0.22
18 0.16
19 0.17
20 0.18
21 0.24
22 0.32
23 0.37
24 0.42
25 0.47
26 0.53
27 0.59
28 0.64
29 0.68
30 0.67
31 0.68
32 0.68
33 0.65
34 0.62
35 0.64
36 0.6
37 0.57
38 0.54
39 0.53
40 0.57
41 0.58
42 0.58
43 0.59
44 0.56
45 0.53
46 0.54
47 0.48
48 0.43
49 0.49
50 0.46
51 0.39
52 0.42
53 0.4
54 0.43
55 0.43
56 0.48
57 0.48
58 0.54
59 0.55
60 0.51
61 0.57
62 0.53
63 0.56
64 0.54
65 0.44
66 0.34
67 0.3
68 0.28
69 0.24
70 0.29
71 0.26
72 0.24
73 0.27
74 0.28
75 0.29
76 0.32
77 0.3
78 0.28
79 0.34
80 0.32
81 0.28
82 0.28
83 0.27
84 0.23
85 0.21
86 0.16
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.04
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.1
102 0.16
103 0.17
104 0.19
105 0.18
106 0.2
107 0.19
108 0.22
109 0.21
110 0.17
111 0.2
112 0.18
113 0.22
114 0.22
115 0.22
116 0.21
117 0.2
118 0.19
119 0.16
120 0.16
121 0.15
122 0.18
123 0.21
124 0.23
125 0.23
126 0.24
127 0.23
128 0.25
129 0.23
130 0.22
131 0.18
132 0.17
133 0.17
134 0.17
135 0.19
136 0.15
137 0.15
138 0.11
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.15
149 0.18
150 0.19
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.15
155 0.18
156 0.19
157 0.19
158 0.21
159 0.22
160 0.23
161 0.23
162 0.23
163 0.2
164 0.18
165 0.16
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.12
180 0.11
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.13
190 0.17
191 0.18
192 0.18
193 0.23
194 0.29
195 0.37
196 0.39
197 0.4
198 0.41
199 0.43
200 0.42
201 0.45
202 0.43
203 0.43
204 0.43
205 0.47
206 0.46
207 0.45
208 0.46
209 0.42
210 0.4
211 0.35
212 0.34
213 0.31
214 0.3
215 0.29
216 0.29
217 0.23
218 0.22
219 0.25
220 0.27
221 0.3
222 0.32
223 0.33
224 0.32
225 0.34
226 0.33
227 0.27
228 0.22
229 0.16
230 0.13
231 0.11
232 0.1
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.1
239 0.11
240 0.14
241 0.18
242 0.25
243 0.29
244 0.34
245 0.39
246 0.47
247 0.55
248 0.62
249 0.7
250 0.72