Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165JN43

Protein Details
Accession A0A165JN43    Localization Confidence Low Confidence Score 5.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-210PTCWNCGKVGHKKWKCPEPRKEKDSTEKSNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16, cyto_mito 11.833, cyto 5.5, cyto_nucl 5.166, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MVLRKTGAWDIVNGTITRPAGSTRDAKAWDDFAADALVTIGLCVEPSQYQYIQDAADGTAAWDSLKKKYEKNSRANRIALKRQFYGFKHDPDQPIHVYIAGITGTARKLKAIGVKIKDTDVMDVLILNLAPSWSSIAGTLSTTLDDLASIDDVTGALIDEEGRRGDEQTSSISVAMMARQPTCWNCGKVGHKKWKCPEPRKEKDSTEKSNLSVLSDAQY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.21
4 0.2
5 0.17
6 0.16
7 0.16
8 0.2
9 0.24
10 0.23
11 0.29
12 0.31
13 0.32
14 0.32
15 0.32
16 0.28
17 0.25
18 0.21
19 0.16
20 0.14
21 0.12
22 0.09
23 0.07
24 0.07
25 0.05
26 0.05
27 0.04
28 0.03
29 0.04
30 0.04
31 0.05
32 0.05
33 0.08
34 0.11
35 0.11
36 0.13
37 0.14
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.12
42 0.09
43 0.09
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.08
50 0.09
51 0.13
52 0.2
53 0.22
54 0.26
55 0.36
56 0.47
57 0.53
58 0.62
59 0.69
60 0.72
61 0.75
62 0.75
63 0.73
64 0.7
65 0.7
66 0.65
67 0.59
68 0.51
69 0.48
70 0.49
71 0.43
72 0.45
73 0.39
74 0.37
75 0.37
76 0.39
77 0.4
78 0.36
79 0.38
80 0.3
81 0.27
82 0.23
83 0.2
84 0.15
85 0.12
86 0.11
87 0.07
88 0.06
89 0.04
90 0.05
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.07
96 0.09
97 0.14
98 0.17
99 0.23
100 0.24
101 0.27
102 0.27
103 0.27
104 0.27
105 0.23
106 0.19
107 0.13
108 0.1
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.17
168 0.18
169 0.22
170 0.26
171 0.25
172 0.25
173 0.33
174 0.41
175 0.48
176 0.57
177 0.64
178 0.65
179 0.73
180 0.8
181 0.82
182 0.84
183 0.84
184 0.85
185 0.85
186 0.88
187 0.85
188 0.84
189 0.83
190 0.83
191 0.82
192 0.8
193 0.77
194 0.7
195 0.65
196 0.62
197 0.54
198 0.45
199 0.37