Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AN82

Protein Details
Accession A0A178AN82    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
213-233MEPPKFKHKRIPRGPPSPPPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
217-231KFKHKRIPRGPPSPP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MSVAALSKSLPRPKYTGEDEELTKSTRVLTAEQYETQVARRQNGPPAYGGRKNWRPRSAEDFGDGGAFPEVHVAQYPLDMGKKGEPSKSNAMVRRVDGEGKTKYDEIAKRGHGDSRIVQASFKDLIPLRQQADAGQLDLARPSQEVVQATKEKTEQALMALVAGQTAAQRPKNVQGRKNDEPTFVRYTPTAQMGEAQGQTRIFKIQQRQIDPMEPPKFKHKRIPRGPPSPPPPVLHSPPRKLTAEDQEMWKIPPPISNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFGEALQAADRHAREEVKQRAIMQQRLAEKEKLQKEEHLRELARQAREERANVSRRRSNSDSETDSEEEAVRKRQADRKERREDFQRELRQSRMGQERKIQMLAREQNRDISEKVALGLAKPTQSGESMYDSRLFNQSSGFNAGFNEDNHYDKPLFAAQDAISSIYRPSVQEDDGEDEGQTYDRLTKSSKFEVLGKAKQGFKGADLQESRDGPVQFEKDTDDPFQINKMINEVRGEKGEEKTGDKRAGLQESDGRSAKRARVEDDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.54
3 0.53
4 0.5
5 0.51
6 0.5
7 0.51
8 0.48
9 0.42
10 0.35
11 0.28
12 0.24
13 0.23
14 0.22
15 0.2
16 0.24
17 0.28
18 0.32
19 0.33
20 0.34
21 0.33
22 0.31
23 0.31
24 0.31
25 0.28
26 0.28
27 0.31
28 0.33
29 0.4
30 0.43
31 0.42
32 0.41
33 0.45
34 0.49
35 0.5
36 0.52
37 0.54
38 0.59
39 0.67
40 0.73
41 0.73
42 0.7
43 0.7
44 0.73
45 0.68
46 0.61
47 0.54
48 0.45
49 0.37
50 0.34
51 0.27
52 0.19
53 0.15
54 0.12
55 0.09
56 0.11
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.1
65 0.12
66 0.12
67 0.14
68 0.17
69 0.25
70 0.27
71 0.33
72 0.34
73 0.39
74 0.47
75 0.53
76 0.55
77 0.54
78 0.57
79 0.54
80 0.52
81 0.49
82 0.43
83 0.4
84 0.35
85 0.36
86 0.34
87 0.33
88 0.34
89 0.31
90 0.29
91 0.33
92 0.35
93 0.31
94 0.35
95 0.35
96 0.36
97 0.37
98 0.4
99 0.35
100 0.35
101 0.34
102 0.34
103 0.35
104 0.31
105 0.3
106 0.26
107 0.28
108 0.26
109 0.22
110 0.2
111 0.18
112 0.22
113 0.26
114 0.31
115 0.28
116 0.28
117 0.28
118 0.24
119 0.29
120 0.25
121 0.2
122 0.17
123 0.15
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.12
132 0.13
133 0.14
134 0.2
135 0.24
136 0.25
137 0.27
138 0.26
139 0.24
140 0.23
141 0.23
142 0.17
143 0.13
144 0.14
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.08
154 0.12
155 0.13
156 0.15
157 0.17
158 0.25
159 0.35
160 0.41
161 0.44
162 0.49
163 0.57
164 0.62
165 0.69
166 0.63
167 0.58
168 0.54
169 0.54
170 0.51
171 0.43
172 0.37
173 0.29
174 0.3
175 0.28
176 0.28
177 0.23
178 0.15
179 0.17
180 0.17
181 0.19
182 0.18
183 0.16
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.13
188 0.14
189 0.13
190 0.17
191 0.24
192 0.29
193 0.35
194 0.38
195 0.41
196 0.42
197 0.43
198 0.41
199 0.42
200 0.43
201 0.38
202 0.36
203 0.43
204 0.47
205 0.47
206 0.54
207 0.55
208 0.59
209 0.67
210 0.77
211 0.75
212 0.79
213 0.81
214 0.8
215 0.76
216 0.72
217 0.66
218 0.56
219 0.52
220 0.48
221 0.47
222 0.48
223 0.49
224 0.47
225 0.48
226 0.5
227 0.45
228 0.42
229 0.42
230 0.41
231 0.39
232 0.36
233 0.34
234 0.32
235 0.32
236 0.3
237 0.28
238 0.21
239 0.16
240 0.18
241 0.19
242 0.27
243 0.3
244 0.38
245 0.42
246 0.47
247 0.52
248 0.49
249 0.49
250 0.42
251 0.41
252 0.37
253 0.4
254 0.37
255 0.37
256 0.39
257 0.35
258 0.32
259 0.32
260 0.28
261 0.19
262 0.17
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.13
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.15
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.11
277 0.12
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.07
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.13
292 0.21
293 0.27
294 0.28
295 0.3
296 0.3
297 0.36
298 0.4
299 0.41
300 0.34
301 0.33
302 0.32
303 0.36
304 0.38
305 0.33
306 0.3
307 0.35
308 0.38
309 0.39
310 0.36
311 0.38
312 0.42
313 0.47
314 0.47
315 0.45
316 0.4
317 0.37
318 0.42
319 0.42
320 0.36
321 0.32
322 0.3
323 0.31
324 0.33
325 0.33
326 0.3
327 0.31
328 0.38
329 0.4
330 0.44
331 0.43
332 0.43
333 0.5
334 0.49
335 0.47
336 0.44
337 0.46
338 0.43
339 0.4
340 0.41
341 0.34
342 0.31
343 0.27
344 0.22
345 0.19
346 0.17
347 0.19
348 0.16
349 0.18
350 0.22
351 0.28
352 0.37
353 0.46
354 0.55
355 0.61
356 0.7
357 0.72
358 0.72
359 0.76
360 0.72
361 0.69
362 0.68
363 0.66
364 0.62
365 0.62
366 0.59
367 0.55
368 0.5
369 0.5
370 0.5
371 0.46
372 0.43
373 0.47
374 0.49
375 0.47
376 0.49
377 0.43
378 0.35
379 0.4
380 0.45
381 0.44
382 0.44
383 0.42
384 0.44
385 0.44
386 0.44
387 0.35
388 0.29
389 0.24
390 0.19
391 0.19
392 0.16
393 0.14
394 0.12
395 0.14
396 0.13
397 0.12
398 0.12
399 0.13
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.17
405 0.18
406 0.19
407 0.22
408 0.22
409 0.23
410 0.26
411 0.24
412 0.19
413 0.2
414 0.2
415 0.18
416 0.23
417 0.21
418 0.17
419 0.17
420 0.18
421 0.18
422 0.17
423 0.2
424 0.17
425 0.2
426 0.2
427 0.23
428 0.22
429 0.19
430 0.22
431 0.19
432 0.18
433 0.16
434 0.18
435 0.15
436 0.17
437 0.17
438 0.17
439 0.13
440 0.13
441 0.13
442 0.12
443 0.13
444 0.11
445 0.15
446 0.16
447 0.17
448 0.19
449 0.21
450 0.24
451 0.24
452 0.24
453 0.2
454 0.17
455 0.17
456 0.15
457 0.13
458 0.09
459 0.12
460 0.12
461 0.14
462 0.17
463 0.22
464 0.28
465 0.33
466 0.36
467 0.34
468 0.38
469 0.46
470 0.51
471 0.51
472 0.51
473 0.51
474 0.5
475 0.5
476 0.5
477 0.41
478 0.35
479 0.39
480 0.34
481 0.36
482 0.34
483 0.36
484 0.37
485 0.37
486 0.37
487 0.34
488 0.33
489 0.27
490 0.32
491 0.31
492 0.26
493 0.26
494 0.29
495 0.26
496 0.29
497 0.29
498 0.25
499 0.24
500 0.25
501 0.27
502 0.26
503 0.26
504 0.23
505 0.28
506 0.27
507 0.28
508 0.32
509 0.32
510 0.31
511 0.31
512 0.35
513 0.32
514 0.32
515 0.37
516 0.35
517 0.38
518 0.41
519 0.45
520 0.45
521 0.42
522 0.45
523 0.45
524 0.49
525 0.44
526 0.43
527 0.42
528 0.43
529 0.49
530 0.46
531 0.4
532 0.38
533 0.42
534 0.43
535 0.45
536 0.44
537 0.43