Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ALJ1

Protein Details
Accession A0A178ALJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-141EDPRRGPQSYRRSRSRSRSPARRDATRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-139RRGPQSYRRSRSRSRSPARRDAT
149-169ERRDERRGGGYGRERSRSPPR
Subcellular Location(s) extr 15, nucl 6, cyto_nucl 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004087  KH_dom  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00013  KH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50084  KH_TYPE_1  
CDD cd00105  KH-I  
Amino Acid Sequences MAAPTPDLNAILAALAAGRGPSTTPSQTPQQVPPAQHPPPPQLPPGFPGAMPTASPPAIPGYNFPQPTHSGSLDLSAIKPVSSGSVSIQDALAKARGFAAQKGLAFDPRPAHQEDPRRGPQSYRRSRSRSRSPARRDATRDGYNPYRDERRDERRGGGYGRERSRSPPRRDTFSPSHAPYGGAQPRSPPPNDNSEVILIDSSLVGLVIGRQGESLRRIEQESSTRIQFINGPESGPQRQCRITGTPGARISAKREINRIIEENGGNPARETGRNARPGAKTVGQQQPALREGEQSSQIMVPDRTVGLIIGRGGETIRDLQERSGCHVNIVGENKSVNGLRPVNLIGSPSAAAHAKELIMEIVDSDTKQMDGSAQPQQPIQNNRRDNFDPYAGGAAGGGAGNKINDNIMVPSDAVGMIIGKGGETIKQMQSETGCKINVSQASGADIERDIGLVGTRQAIEDAKRAIWEKVDQVREKNNSRRRDNGNANGGYDNSYSQQPPAPSNGYGGAPPAQPPAAGAPPAAGAADPYAVYGGYQNYLAMWYASFAQQQQGGQPPQPGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.04
3 0.04
4 0.04
5 0.04
6 0.04
7 0.05
8 0.08
9 0.14
10 0.18
11 0.2
12 0.25
13 0.32
14 0.39
15 0.43
16 0.46
17 0.5
18 0.51
19 0.52
20 0.55
21 0.57
22 0.54
23 0.55
24 0.54
25 0.53
26 0.55
27 0.57
28 0.55
29 0.5
30 0.49
31 0.46
32 0.47
33 0.4
34 0.32
35 0.31
36 0.28
37 0.24
38 0.22
39 0.22
40 0.2
41 0.19
42 0.19
43 0.16
44 0.17
45 0.18
46 0.18
47 0.19
48 0.22
49 0.29
50 0.32
51 0.31
52 0.31
53 0.33
54 0.37
55 0.39
56 0.33
57 0.27
58 0.26
59 0.27
60 0.25
61 0.22
62 0.18
63 0.16
64 0.15
65 0.13
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.1
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.17
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.16
84 0.17
85 0.18
86 0.21
87 0.21
88 0.22
89 0.25
90 0.25
91 0.26
92 0.25
93 0.27
94 0.25
95 0.24
96 0.27
97 0.27
98 0.3
99 0.33
100 0.42
101 0.46
102 0.51
103 0.57
104 0.58
105 0.55
106 0.57
107 0.6
108 0.62
109 0.65
110 0.65
111 0.66
112 0.7
113 0.79
114 0.82
115 0.84
116 0.84
117 0.83
118 0.85
119 0.85
120 0.87
121 0.84
122 0.82
123 0.78
124 0.75
125 0.72
126 0.68
127 0.61
128 0.57
129 0.57
130 0.53
131 0.49
132 0.46
133 0.45
134 0.41
135 0.46
136 0.48
137 0.51
138 0.55
139 0.56
140 0.56
141 0.53
142 0.55
143 0.49
144 0.49
145 0.47
146 0.47
147 0.49
148 0.47
149 0.43
150 0.47
151 0.56
152 0.58
153 0.59
154 0.61
155 0.6
156 0.65
157 0.67
158 0.69
159 0.66
160 0.63
161 0.61
162 0.53
163 0.51
164 0.44
165 0.42
166 0.34
167 0.36
168 0.34
169 0.28
170 0.26
171 0.27
172 0.31
173 0.35
174 0.35
175 0.3
176 0.27
177 0.34
178 0.36
179 0.34
180 0.3
181 0.27
182 0.26
183 0.22
184 0.19
185 0.11
186 0.08
187 0.07
188 0.05
189 0.04
190 0.03
191 0.03
192 0.02
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.08
200 0.1
201 0.12
202 0.13
203 0.15
204 0.16
205 0.17
206 0.2
207 0.23
208 0.24
209 0.24
210 0.23
211 0.23
212 0.21
213 0.21
214 0.21
215 0.18
216 0.19
217 0.17
218 0.16
219 0.17
220 0.2
221 0.23
222 0.24
223 0.24
224 0.23
225 0.24
226 0.24
227 0.26
228 0.26
229 0.25
230 0.29
231 0.29
232 0.31
233 0.3
234 0.31
235 0.29
236 0.26
237 0.28
238 0.29
239 0.32
240 0.28
241 0.3
242 0.33
243 0.34
244 0.35
245 0.33
246 0.26
247 0.24
248 0.22
249 0.19
250 0.19
251 0.17
252 0.15
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.15
258 0.18
259 0.24
260 0.29
261 0.31
262 0.35
263 0.34
264 0.36
265 0.37
266 0.32
267 0.27
268 0.3
269 0.35
270 0.31
271 0.32
272 0.3
273 0.29
274 0.28
275 0.28
276 0.21
277 0.16
278 0.15
279 0.16
280 0.16
281 0.14
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.13
308 0.14
309 0.18
310 0.21
311 0.2
312 0.19
313 0.2
314 0.19
315 0.2
316 0.22
317 0.18
318 0.14
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.11
324 0.13
325 0.14
326 0.13
327 0.15
328 0.15
329 0.15
330 0.15
331 0.14
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.11
359 0.18
360 0.2
361 0.21
362 0.22
363 0.26
364 0.3
365 0.38
366 0.41
367 0.42
368 0.47
369 0.47
370 0.53
371 0.52
372 0.51
373 0.46
374 0.42
375 0.33
376 0.27
377 0.28
378 0.21
379 0.18
380 0.13
381 0.09
382 0.07
383 0.06
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.06
402 0.05
403 0.04
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.08
411 0.12
412 0.14
413 0.16
414 0.16
415 0.18
416 0.2
417 0.23
418 0.24
419 0.23
420 0.21
421 0.2
422 0.2
423 0.24
424 0.23
425 0.22
426 0.21
427 0.17
428 0.19
429 0.2
430 0.19
431 0.15
432 0.12
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.09
445 0.12
446 0.13
447 0.17
448 0.18
449 0.17
450 0.2
451 0.22
452 0.22
453 0.23
454 0.24
455 0.27
456 0.33
457 0.41
458 0.42
459 0.45
460 0.52
461 0.58
462 0.64
463 0.66
464 0.67
465 0.68
466 0.7
467 0.74
468 0.73
469 0.75
470 0.76
471 0.75
472 0.76
473 0.68
474 0.64
475 0.56
476 0.49
477 0.42
478 0.33
479 0.25
480 0.17
481 0.19
482 0.17
483 0.18
484 0.22
485 0.21
486 0.23
487 0.27
488 0.29
489 0.27
490 0.28
491 0.29
492 0.26
493 0.23
494 0.23
495 0.21
496 0.18
497 0.18
498 0.19
499 0.17
500 0.16
501 0.17
502 0.19
503 0.19
504 0.19
505 0.18
506 0.15
507 0.15
508 0.16
509 0.15
510 0.09
511 0.07
512 0.07
513 0.08
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.09
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.11
526 0.11
527 0.09
528 0.08
529 0.08
530 0.1
531 0.12
532 0.14
533 0.14
534 0.17
535 0.19
536 0.2
537 0.24
538 0.31
539 0.33
540 0.34