Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178APM3

Protein Details
Accession A0A178APM3    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-49RTCSLPCYKRHQQWAQCSGQRHydrophilic
180-205AHPFAPREQHKTKKRKRNAQSPPATNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-196HKTKKRKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007529  Znf_HIT  
Pfam View protein in Pfam  
PF04438  zf-HIT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51083  ZF_HIT  
Amino Acid Sequences MSDETLLSELCSICNTNASKYRCPGCSARTCSLPCYKRHQQWAQCSGQRDPTKFVKKSQLVTPAGIDHDFNFLTGIERDIEKADKGLAENSHGSAPTPRSWSQSQASQKGQTNYQHLEAAGVKVIRAPKGLSRQKENKSHRSSTKKSTGSRNIMWTVEWLDDRKKRLLTETSSTCQIALAHPFAPREQHKTKKRKRNAQSPPATNSPTTQDAIPTTTNQDKPHSPSGGRVSDSSAQAAEEVQAQLAKEDSPNHSDDGSITKPMGNGEHRFFLLKPRTSSSKHVLIPLSATDTLGDCLYNRTVLEFPTIYAFPGTLPQLPDEFMLEEEYLRQEGEEQKEFDALISELDPEILKRLKEDGQQPDRQSTREEVDSKDILDVLKKDFGAVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.25
4 0.33
5 0.39
6 0.43
7 0.49
8 0.55
9 0.51
10 0.55
11 0.54
12 0.55
13 0.59
14 0.6
15 0.57
16 0.59
17 0.58
18 0.59
19 0.62
20 0.59
21 0.54
22 0.56
23 0.62
24 0.62
25 0.71
26 0.75
27 0.74
28 0.78
29 0.82
30 0.82
31 0.76
32 0.72
33 0.66
34 0.65
35 0.63
36 0.55
37 0.53
38 0.54
39 0.59
40 0.58
41 0.6
42 0.61
43 0.6
44 0.62
45 0.63
46 0.62
47 0.54
48 0.53
49 0.49
50 0.4
51 0.36
52 0.32
53 0.26
54 0.17
55 0.18
56 0.16
57 0.14
58 0.12
59 0.1
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.1
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.15
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.13
73 0.16
74 0.15
75 0.17
76 0.18
77 0.18
78 0.19
79 0.17
80 0.17
81 0.18
82 0.2
83 0.21
84 0.25
85 0.25
86 0.29
87 0.31
88 0.35
89 0.34
90 0.39
91 0.43
92 0.44
93 0.47
94 0.48
95 0.51
96 0.49
97 0.51
98 0.47
99 0.45
100 0.41
101 0.39
102 0.34
103 0.28
104 0.28
105 0.23
106 0.19
107 0.16
108 0.13
109 0.11
110 0.13
111 0.15
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.17
116 0.28
117 0.35
118 0.36
119 0.43
120 0.52
121 0.59
122 0.68
123 0.71
124 0.71
125 0.71
126 0.75
127 0.75
128 0.75
129 0.73
130 0.71
131 0.73
132 0.69
133 0.66
134 0.69
135 0.69
136 0.66
137 0.63
138 0.59
139 0.52
140 0.45
141 0.41
142 0.32
143 0.24
144 0.19
145 0.17
146 0.14
147 0.18
148 0.21
149 0.24
150 0.27
151 0.27
152 0.26
153 0.3
154 0.34
155 0.32
156 0.35
157 0.36
158 0.34
159 0.35
160 0.34
161 0.29
162 0.24
163 0.2
164 0.14
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.17
172 0.18
173 0.24
174 0.29
175 0.37
176 0.46
177 0.57
178 0.67
179 0.73
180 0.8
181 0.83
182 0.85
183 0.86
184 0.87
185 0.86
186 0.85
187 0.79
188 0.74
189 0.68
190 0.6
191 0.5
192 0.4
193 0.33
194 0.26
195 0.22
196 0.17
197 0.14
198 0.13
199 0.15
200 0.15
201 0.12
202 0.14
203 0.18
204 0.21
205 0.22
206 0.25
207 0.25
208 0.29
209 0.34
210 0.33
211 0.29
212 0.31
213 0.35
214 0.35
215 0.34
216 0.29
217 0.27
218 0.28
219 0.28
220 0.23
221 0.17
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.09
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.1
236 0.12
237 0.15
238 0.16
239 0.17
240 0.17
241 0.16
242 0.16
243 0.18
244 0.17
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.15
250 0.18
251 0.18
252 0.2
253 0.22
254 0.24
255 0.23
256 0.24
257 0.24
258 0.29
259 0.33
260 0.34
261 0.34
262 0.37
263 0.42
264 0.44
265 0.5
266 0.47
267 0.47
268 0.44
269 0.46
270 0.42
271 0.37
272 0.34
273 0.29
274 0.27
275 0.19
276 0.17
277 0.13
278 0.12
279 0.13
280 0.11
281 0.11
282 0.07
283 0.09
284 0.1
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.13
290 0.17
291 0.14
292 0.14
293 0.17
294 0.17
295 0.15
296 0.14
297 0.14
298 0.1
299 0.13
300 0.14
301 0.13
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.17
307 0.15
308 0.14
309 0.12
310 0.13
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.18
320 0.24
321 0.28
322 0.28
323 0.28
324 0.29
325 0.29
326 0.26
327 0.21
328 0.15
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.08
336 0.13
337 0.15
338 0.15
339 0.16
340 0.2
341 0.25
342 0.32
343 0.4
344 0.45
345 0.51
346 0.59
347 0.6
348 0.65
349 0.63
350 0.57
351 0.53
352 0.47
353 0.44
354 0.44
355 0.44
356 0.39
357 0.43
358 0.43
359 0.39
360 0.35
361 0.31
362 0.24
363 0.26
364 0.24
365 0.22
366 0.25
367 0.24