Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AMW4

Protein Details
Accession A0A178AMW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MAKTKPQDRKSKKNAKNGTSKSKASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-17RKSKKNAKN
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MAKTKPQDRKSKKNAKNGTSKSKASPEELLVQAATLLQTSQPEEALVAAKRALNLLQPSSTPSAAALPALNLLGEINVELGDPESAREAFEAAIAIDPQGSNDGAEKFLWMAQLNEEGGAESVGWFEKGIDVLKREIGELEGKLVKKNETTELLEEKKQKVANSLCGIAEVYMTDLSWEEDAEARCEAAVTEALLFAPSNPEPLQTLASIRISQLRHDDAKAALARSMELWKDLDPDDPKVPDYSTRISLSRLLMEAELEDEAIEVLERLIGENDGSVEAWYLGGWCLHLLAGKQKAKGEDDTATSLLRASRDWLENCLKLYSLLEYEDERLKDHADEILKELNDTLGPSTGEEEEDWEDAGDDEDDEDDEEMDGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.88
3 0.9
4 0.88
5 0.87
6 0.84
7 0.79
8 0.74
9 0.72
10 0.67
11 0.6
12 0.55
13 0.48
14 0.47
15 0.44
16 0.39
17 0.3
18 0.26
19 0.22
20 0.18
21 0.14
22 0.07
23 0.07
24 0.06
25 0.08
26 0.1
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.14
33 0.13
34 0.12
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.15
39 0.15
40 0.16
41 0.19
42 0.2
43 0.2
44 0.19
45 0.23
46 0.25
47 0.25
48 0.2
49 0.17
50 0.16
51 0.15
52 0.16
53 0.12
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.06
59 0.06
60 0.05
61 0.05
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.06
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.06
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.04
109 0.05
110 0.04
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.06
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.12
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.12
125 0.13
126 0.11
127 0.13
128 0.15
129 0.15
130 0.17
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.19
135 0.19
136 0.2
137 0.21
138 0.23
139 0.27
140 0.28
141 0.31
142 0.33
143 0.31
144 0.32
145 0.31
146 0.29
147 0.31
148 0.3
149 0.32
150 0.31
151 0.31
152 0.26
153 0.24
154 0.24
155 0.17
156 0.14
157 0.07
158 0.06
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.06
185 0.06
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.11
191 0.12
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.15
199 0.14
200 0.15
201 0.18
202 0.2
203 0.2
204 0.21
205 0.22
206 0.17
207 0.21
208 0.21
209 0.18
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.15
215 0.11
216 0.1
217 0.11
218 0.1
219 0.12
220 0.12
221 0.16
222 0.16
223 0.19
224 0.21
225 0.2
226 0.21
227 0.2
228 0.2
229 0.18
230 0.2
231 0.2
232 0.21
233 0.23
234 0.23
235 0.23
236 0.26
237 0.24
238 0.22
239 0.19
240 0.16
241 0.14
242 0.13
243 0.12
244 0.09
245 0.08
246 0.06
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.07
277 0.07
278 0.13
279 0.22
280 0.26
281 0.28
282 0.31
283 0.34
284 0.36
285 0.37
286 0.35
287 0.29
288 0.28
289 0.29
290 0.27
291 0.25
292 0.21
293 0.2
294 0.18
295 0.16
296 0.13
297 0.13
298 0.17
299 0.23
300 0.25
301 0.3
302 0.34
303 0.35
304 0.37
305 0.34
306 0.29
307 0.24
308 0.24
309 0.2
310 0.15
311 0.15
312 0.14
313 0.15
314 0.18
315 0.22
316 0.22
317 0.21
318 0.21
319 0.21
320 0.2
321 0.2
322 0.22
323 0.2
324 0.21
325 0.23
326 0.28
327 0.26
328 0.25
329 0.25
330 0.2
331 0.18
332 0.17
333 0.15
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.15
340 0.14
341 0.16
342 0.15
343 0.16
344 0.15
345 0.13
346 0.13
347 0.12
348 0.13
349 0.1
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.08