Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AH03

Protein Details
Accession A0A178AH03    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
319-339ALPTLAKPRKKKVKGGDDGSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-277SKKIPRSKAEKKAK
325-332KPRKKKVK
Subcellular Location(s) mito 20, cyto_mito 12.333, cyto_nucl 3.666, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039197  Mrs1/Cce1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR015242  Ydc2_cat  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09159  Ydc2-catalyt  
CDD cd16963  CCE1  
Amino Acid Sequences MPPKPRPVTAKALQTLLTRIGSASSGTKDVLSHRLKRDILDSRLFSRRPEWQDQLKSDRQRGLRVFSIDMGIKNLAFCDVIVNYSERDARKPTMDVIQWDKLNLADATRELRRPLPNPLSRIKIEADEGEEVDPYSLYVLSRAAHNFITRHVLAGDPDIILIESQRWRSASSSAIQQWTVRVNTLEAMLWTTLHTIQVEYKKNNPEPKHYQMKRDYETFGVDPKRVGQFWLGQHAQAMAEKEGTTDSEMVVDALVEVEGDKASSKKIPRSKAEKKAKIAILRSWLATEPASTASTTPESAPNISFKIGIGATAAREALALPTLAKPRKKKVKGGDDGSVAETGKEMKKLDDITDCFLQAAAWVAWESNRLQLYEAWEKQVEKDGKLPDLDDEILKEMVKISGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.45
3 0.39
4 0.33
5 0.23
6 0.2
7 0.19
8 0.16
9 0.16
10 0.16
11 0.15
12 0.16
13 0.16
14 0.17
15 0.17
16 0.2
17 0.28
18 0.32
19 0.38
20 0.42
21 0.5
22 0.5
23 0.51
24 0.56
25 0.55
26 0.54
27 0.54
28 0.52
29 0.49
30 0.56
31 0.55
32 0.49
33 0.44
34 0.47
35 0.47
36 0.52
37 0.54
38 0.55
39 0.63
40 0.67
41 0.71
42 0.71
43 0.7
44 0.68
45 0.68
46 0.61
47 0.61
48 0.58
49 0.56
50 0.53
51 0.48
52 0.44
53 0.37
54 0.38
55 0.31
56 0.28
57 0.25
58 0.2
59 0.17
60 0.15
61 0.14
62 0.12
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.13
72 0.18
73 0.16
74 0.19
75 0.23
76 0.24
77 0.26
78 0.28
79 0.28
80 0.31
81 0.32
82 0.33
83 0.35
84 0.38
85 0.35
86 0.34
87 0.31
88 0.24
89 0.25
90 0.2
91 0.14
92 0.1
93 0.11
94 0.15
95 0.17
96 0.19
97 0.18
98 0.24
99 0.28
100 0.3
101 0.38
102 0.44
103 0.46
104 0.49
105 0.52
106 0.52
107 0.47
108 0.48
109 0.4
110 0.31
111 0.28
112 0.24
113 0.22
114 0.17
115 0.17
116 0.14
117 0.13
118 0.11
119 0.1
120 0.09
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.12
132 0.14
133 0.13
134 0.14
135 0.19
136 0.17
137 0.17
138 0.15
139 0.14
140 0.13
141 0.14
142 0.13
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.14
156 0.15
157 0.15
158 0.14
159 0.19
160 0.21
161 0.21
162 0.21
163 0.2
164 0.2
165 0.21
166 0.19
167 0.14
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.1
184 0.17
185 0.21
186 0.22
187 0.27
188 0.33
189 0.37
190 0.44
191 0.42
192 0.44
193 0.47
194 0.53
195 0.59
196 0.55
197 0.59
198 0.59
199 0.64
200 0.59
201 0.54
202 0.48
203 0.38
204 0.38
205 0.3
206 0.28
207 0.23
208 0.2
209 0.18
210 0.19
211 0.2
212 0.17
213 0.18
214 0.14
215 0.18
216 0.19
217 0.25
218 0.23
219 0.21
220 0.21
221 0.2
222 0.19
223 0.15
224 0.15
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.04
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.06
250 0.11
251 0.14
252 0.22
253 0.3
254 0.37
255 0.45
256 0.56
257 0.64
258 0.71
259 0.78
260 0.78
261 0.76
262 0.77
263 0.74
264 0.69
265 0.63
266 0.56
267 0.51
268 0.44
269 0.39
270 0.32
271 0.27
272 0.23
273 0.19
274 0.16
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.15
286 0.17
287 0.18
288 0.18
289 0.18
290 0.18
291 0.17
292 0.13
293 0.15
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.11
309 0.19
310 0.25
311 0.31
312 0.37
313 0.47
314 0.58
315 0.64
316 0.7
317 0.73
318 0.78
319 0.81
320 0.8
321 0.76
322 0.68
323 0.63
324 0.55
325 0.46
326 0.34
327 0.25
328 0.19
329 0.17
330 0.16
331 0.18
332 0.17
333 0.17
334 0.21
335 0.24
336 0.27
337 0.31
338 0.31
339 0.33
340 0.34
341 0.33
342 0.28
343 0.26
344 0.22
345 0.14
346 0.16
347 0.1
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.13
353 0.13
354 0.15
355 0.17
356 0.16
357 0.18
358 0.2
359 0.27
360 0.35
361 0.36
362 0.35
363 0.36
364 0.36
365 0.37
366 0.44
367 0.4
368 0.33
369 0.38
370 0.38
371 0.39
372 0.39
373 0.38
374 0.3
375 0.31
376 0.3
377 0.25
378 0.22
379 0.21
380 0.21
381 0.2
382 0.18
383 0.15