FuNGI

A0A178AQX6

Protein Details

Accession

A0A178AQX6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-50	PSPSMHVSPRKRTVRQMPSRTPSGL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1204-1219	AVRGRSAGGRGRGKSG

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 9, cyto 5.5, mito 5, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR034397 Prp24_RRM1 IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR031766 RRM_occluded IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF16842 RRM_occluded
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12296 RRM1_Prp24 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MDINSLLSPSDSPAGTPTPQPPPAIPSPSMHVSPRKRTVRQMPSRTPSGLSQQITSSPQPHAALQQIPSPGFAHITNGARAMHSAMTTPQPLGSPRDARITPPNPTFRQASTPGMDTLADLASMQQQQAARQTPVAHQRPVTLQHLGQHLSGESVASIMSESSPRPRNFVTRSLDQQHIEWLEQLDQTLIENPFDYYSHLSLVTTLHQGLQNHLATFESGPHAYELVQTLRDAYKAMCEKYPLGETLWHYRLNDEKTLAQSIEDRMGVLEYHKQATQEEPYSAKLWAAYGEYTSYLVACSWEQEAIEEWSEEDRMIGRELFKPQLVLEALEQGAERVKYNLQESNLVWDRYLQVLEEDLERGGFSQEKAARVASIYDQRLSQPHATWSNTFSRYSSFNTRYYKDHYEQLMEQALQKNTHIKQQYANREEYEFKVLQAFQAGDQEAEYHAVTRYLKWEKKTMGVYSFHLVNALYERATLRFPVDPSIWEDHVEFLIWQKDRSVDLLNVLERATRHCPWSGALWSHRILTLEAENKAFEDLEHVKHTATGSGLLEHADLEELIKVQIAWCGYLRRRAFDDPAATEDDVDIAEVGIRSALEFVREVGIKKHGRDWSDPKWRLERIHMKFWLQRGNVDEARTIWESLVTRQGESYDFWYRWYIFEMVFWSQHATRNTSNAGQQLLTPERATAVLERGMERLTTLDHPEPLLEMYINHCEQHESVIKVRSAAIERRRAERAISIRREKERATAAALASQKETPPSEVADGSTKRKRDEVSQDEHATTKKSRVDDLQGPHAVVNGDARTASEAPSESQTLGPKRDREHTSVIVRKLPAGTTQTRIRQFFTDAGTVRNLDLKDEQGTMTAIVEFESPEEAEYALSKQAKGFEGHEITIERGQSTTLYVTNYPPHADEAFLRNLFGPFGEIVGIRFPSLKYAAHRRFCYVQYDNAEHATAATQLDGTDVEGHKLVVKISDPQAKKKREGALTEGREVYVKKVNFKIKEREVKDAFSQFGMIERINMPVLPNGNNKGHCFIIYASKEGAEAAVTEMHGKQFWGLDLTVEIASERAGAKPKVKSTLENVPSPNAREGTPGTNDASSEATNKPEGTIGSRSIAFLNIPDTVPDVRIKPLVEPFGFKRIDLEPQHGGAIIEFHTVEGAGKAEIALQGTDFEGRKLRIGTVKDLKQQKGEWKASNSFIQPNRVNRPAVRGRSAGGRGRGKSGISIGRPSIPKSATTNGGEAKSNADFRAMIMSKDTAKDADQDGDKMEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.2
3	0.24
4	0.28
5	0.33
6	0.36
7	0.38
8	0.36
9	0.39
10	0.45
11	0.46
12	0.42
13	0.37
14	0.4
15	0.42
16	0.43
17	0.42
18	0.44
19	0.47
20	0.55
21	0.63
22	0.66
23	0.67
24	0.73
25	0.79
26	0.81
27	0.83
28	0.84
29	0.84
30	0.81
31	0.82
32	0.74
33	0.66
34	0.58
35	0.55
36	0.53
37	0.44
38	0.39
39	0.35
40	0.37
41	0.39
42	0.38
43	0.34
44	0.28
45	0.31
46	0.31
47	0.3
48	0.3
49	0.31
50	0.32
51	0.3
52	0.33
53	0.32
54	0.3
55	0.31
56	0.28
57	0.23
58	0.21
59	0.2
60	0.19
61	0.21
62	0.23
63	0.23
64	0.24
65	0.24
66	0.22
67	0.23
68	0.21
69	0.17
70	0.14
71	0.14
72	0.14
73	0.18
74	0.19
75	0.19
76	0.18
77	0.19
78	0.21
79	0.25
80	0.3
81	0.3
82	0.31
83	0.39
84	0.38
85	0.4
86	0.48
87	0.48
88	0.48
89	0.52
90	0.58
91	0.53
92	0.57
93	0.56
94	0.48
95	0.5
96	0.46
97	0.44
98	0.39
99	0.38
100	0.35
101	0.32
102	0.3
103	0.23
104	0.2
105	0.14
106	0.11
107	0.08
108	0.08
109	0.12
110	0.13
111	0.12
112	0.14
113	0.15
114	0.17
115	0.24
116	0.28
117	0.25
118	0.26
119	0.29
120	0.33
121	0.42
122	0.46
123	0.43
124	0.39
125	0.41
126	0.44
127	0.47
128	0.44
129	0.37
130	0.33
131	0.34
132	0.38
133	0.36
134	0.31
135	0.27
136	0.23
137	0.2
138	0.19
139	0.14
140	0.09
141	0.07
142	0.07
143	0.05
144	0.05
145	0.04
146	0.06
147	0.07
148	0.09
149	0.17
150	0.26
151	0.26
152	0.31
153	0.34
154	0.42
155	0.45
156	0.52
157	0.51
158	0.49
159	0.57
160	0.57
161	0.6
162	0.52
163	0.48
164	0.45
165	0.4
166	0.34
167	0.28
168	0.24
169	0.21
170	0.2
171	0.19
172	0.13
173	0.11
174	0.12
175	0.15
176	0.14
177	0.13
178	0.13
179	0.13
180	0.14
181	0.14
182	0.16
183	0.14
184	0.14
185	0.15
186	0.15
187	0.14
188	0.14
189	0.15
190	0.15
191	0.13
192	0.13
193	0.14
194	0.17
195	0.17
196	0.2
197	0.25
198	0.25
199	0.23
200	0.23
201	0.21
202	0.18
203	0.18
204	0.18
205	0.14
206	0.12
207	0.13
208	0.13
209	0.13
210	0.12
211	0.13
212	0.14
213	0.13
214	0.13
215	0.13
216	0.15
217	0.15
218	0.15
219	0.15
220	0.12
221	0.18
222	0.22
223	0.25
224	0.24
225	0.26
226	0.27
227	0.29
228	0.31
229	0.24
230	0.21
231	0.23
232	0.25
233	0.3
234	0.32
235	0.31
236	0.29
237	0.3
238	0.35
239	0.35
240	0.35
241	0.3
242	0.29
243	0.3
244	0.33
245	0.3
246	0.24
247	0.23
248	0.21
249	0.22
250	0.19
251	0.16
252	0.13
253	0.14
254	0.13
255	0.12
256	0.16
257	0.15
258	0.17
259	0.18
260	0.18
261	0.19
262	0.22
263	0.26
264	0.23
265	0.23
266	0.23
267	0.25
268	0.25
269	0.25
270	0.21
271	0.16
272	0.13
273	0.12
274	0.12
275	0.1
276	0.09
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.09
282	0.07
283	0.07
284	0.08
285	0.07
286	0.08
287	0.08
288	0.09
289	0.08
290	0.09
291	0.11
292	0.12
293	0.12
294	0.11
295	0.11
296	0.11
297	0.12
298	0.11
299	0.09
300	0.08
301	0.09
302	0.1
303	0.11
304	0.12
305	0.16
306	0.2
307	0.22
308	0.21
309	0.2
310	0.18
311	0.22
312	0.2
313	0.17
314	0.14
315	0.15
316	0.14
317	0.14
318	0.14
319	0.09
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.12
325	0.14
326	0.17
327	0.2
328	0.19
329	0.23
330	0.23
331	0.3
332	0.33
333	0.3
334	0.27
335	0.25
336	0.25
337	0.22
338	0.22
339	0.13
340	0.09
341	0.1
342	0.11
343	0.1
344	0.1
345	0.08
346	0.08
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.08
351	0.07
352	0.14
353	0.17
354	0.18
355	0.19
356	0.19
357	0.18
358	0.18
359	0.19
360	0.16
361	0.2
362	0.2
363	0.2
364	0.2
365	0.21
366	0.23
367	0.26
368	0.24
369	0.19
370	0.23
371	0.27
372	0.29
373	0.29
374	0.3
375	0.33
376	0.32
377	0.31
378	0.26
379	0.24
380	0.24
381	0.28
382	0.34
383	0.31
384	0.35
385	0.4
386	0.41
387	0.43
388	0.47
389	0.49
390	0.42
391	0.45
392	0.4
393	0.39
394	0.37
395	0.36
396	0.33
397	0.26
398	0.26
399	0.26
400	0.26
401	0.22
402	0.22
403	0.26
404	0.24
405	0.31
406	0.3
407	0.26
408	0.31
409	0.39
410	0.49
411	0.46
412	0.48
413	0.42
414	0.42
415	0.43
416	0.38
417	0.36
418	0.26
419	0.21
420	0.22
421	0.2
422	0.18
423	0.18
424	0.16
425	0.1
426	0.13
427	0.13
428	0.1
429	0.1
430	0.1
431	0.08
432	0.09
433	0.09
434	0.07
435	0.07
436	0.09
437	0.1
438	0.1
439	0.16
440	0.24
441	0.27
442	0.29
443	0.35
444	0.34
445	0.39
446	0.43
447	0.39
448	0.35
449	0.34
450	0.34
451	0.3
452	0.29
453	0.23
454	0.2
455	0.16
456	0.12
457	0.12
458	0.1
459	0.08
460	0.07
461	0.08
462	0.09
463	0.09
464	0.1
465	0.1
466	0.11
467	0.12
468	0.15
469	0.15
470	0.15
471	0.18
472	0.22
473	0.2
474	0.19
475	0.19
476	0.16
477	0.15
478	0.14
479	0.1
480	0.08
481	0.13
482	0.13
483	0.12
484	0.12
485	0.14
486	0.14
487	0.16
488	0.17
489	0.12
490	0.14
491	0.16
492	0.16
493	0.15
494	0.14
495	0.13
496	0.11
497	0.15
498	0.17
499	0.16
500	0.18
501	0.18
502	0.19
503	0.19
504	0.23
505	0.22
506	0.21
507	0.21
508	0.23
509	0.22
510	0.22
511	0.22
512	0.19
513	0.16
514	0.14
515	0.16
516	0.16
517	0.16
518	0.16
519	0.15
520	0.15
521	0.15
522	0.13
523	0.09
524	0.1
525	0.12
526	0.14
527	0.16
528	0.16
529	0.15
530	0.16
531	0.17
532	0.12
533	0.1
534	0.1
535	0.08
536	0.08
537	0.09
538	0.08
539	0.08
540	0.07
541	0.06
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.04
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.06
552	0.05
553	0.06
554	0.07
555	0.12
556	0.13
557	0.21
558	0.21
559	0.22
560	0.26
561	0.27
562	0.29
563	0.28
564	0.3
565	0.23
566	0.25
567	0.25
568	0.21
569	0.18
570	0.15
571	0.12
572	0.09
573	0.08
574	0.05
575	0.03
576	0.03
577	0.03
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.05
587	0.07
588	0.08
589	0.08
590	0.09
591	0.17
592	0.18
593	0.19
594	0.25
595	0.27
596	0.29
597	0.34
598	0.39
599	0.41
600	0.5
601	0.53
602	0.5
603	0.52
604	0.52
605	0.48
606	0.49
607	0.5
608	0.44
609	0.48
610	0.47
611	0.45
612	0.45
613	0.46
614	0.45
615	0.34
616	0.32
617	0.27
618	0.31
619	0.29
620	0.27
621	0.25
622	0.18
623	0.21
624	0.2
625	0.17
626	0.11
627	0.11
628	0.11
629	0.12
630	0.18
631	0.14
632	0.14
633	0.14
634	0.15
635	0.14
636	0.14
637	0.17
638	0.15
639	0.14
640	0.16
641	0.17
642	0.17
643	0.16
644	0.18
645	0.15
646	0.11
647	0.12
648	0.13
649	0.12
650	0.12
651	0.12
652	0.11
653	0.11
654	0.16
655	0.17
656	0.19
657	0.18
658	0.2
659	0.22
660	0.21
661	0.22
662	0.19
663	0.18
664	0.14
665	0.14
666	0.15
667	0.15
668	0.15
669	0.13
670	0.11
671	0.11
672	0.11
673	0.11
674	0.08
675	0.08
676	0.09
677	0.1
678	0.1
679	0.11
680	0.11
681	0.1
682	0.09
683	0.08
684	0.07
685	0.08
686	0.11
687	0.11
688	0.11
689	0.12
690	0.12
691	0.12
692	0.1
693	0.09
694	0.06
695	0.05
696	0.07
697	0.11
698	0.11
699	0.11
700	0.11
701	0.11
702	0.11
703	0.15
704	0.17
705	0.15
706	0.18
707	0.21
708	0.21
709	0.21
710	0.21
711	0.2
712	0.19
713	0.24
714	0.27
715	0.32
716	0.34
717	0.37
718	0.39
719	0.38
720	0.35
721	0.35
722	0.37
723	0.38
724	0.43
725	0.46
726	0.49
727	0.52
728	0.54
729	0.49
730	0.45
731	0.4
732	0.33
733	0.3
734	0.27
735	0.23
736	0.25
737	0.26
738	0.22
739	0.19
740	0.18
741	0.15
742	0.15
743	0.15
744	0.12
745	0.12
746	0.12
747	0.12
748	0.12
749	0.13
750	0.17
751	0.19
752	0.23
753	0.27
754	0.28
755	0.27
756	0.3
757	0.31
758	0.32
759	0.4
760	0.41
761	0.43
762	0.47
763	0.48
764	0.46
765	0.45
766	0.39
767	0.31
768	0.26
769	0.24
770	0.22
771	0.21
772	0.22
773	0.24
774	0.3
775	0.33
776	0.36
777	0.37
778	0.35
779	0.34
780	0.31
781	0.29
782	0.23
783	0.17
784	0.15
785	0.08
786	0.08
787	0.07
788	0.07
789	0.09
790	0.09
791	0.09
792	0.09
793	0.09
794	0.1
795	0.12
796	0.13
797	0.11
798	0.13
799	0.17
800	0.19
801	0.23
802	0.26
803	0.28
804	0.3
805	0.38
806	0.4
807	0.4
808	0.43
809	0.44
810	0.49
811	0.51
812	0.5
813	0.46
814	0.42
815	0.39
816	0.34
817	0.28
818	0.23
819	0.22
820	0.22
821	0.23
822	0.28
823	0.34
824	0.39
825	0.39
826	0.38
827	0.35
828	0.35
829	0.33
830	0.3
831	0.28
832	0.23
833	0.23
834	0.23
835	0.21
836	0.19
837	0.2
838	0.17
839	0.14
840	0.15
841	0.15
842	0.15
843	0.16
844	0.15
845	0.12
846	0.12
847	0.11
848	0.1
849	0.08
850	0.06
851	0.06
852	0.06
853	0.05
854	0.05
855	0.06
856	0.06
857	0.06
858	0.06
859	0.06
860	0.06
861	0.06
862	0.07
863	0.11
864	0.12
865	0.12
866	0.12
867	0.15
868	0.17
869	0.18
870	0.19
871	0.21
872	0.22
873	0.22
874	0.23
875	0.21
876	0.21
877	0.21
878	0.19
879	0.13
880	0.11
881	0.11
882	0.1
883	0.1
884	0.1
885	0.09
886	0.11
887	0.12
888	0.14
889	0.17
890	0.18
891	0.17
892	0.17
893	0.18
894	0.16
895	0.16
896	0.16
897	0.18
898	0.22
899	0.21
900	0.2
901	0.19
902	0.19
903	0.18
904	0.15
905	0.12
906	0.07
907	0.07
908	0.08
909	0.07
910	0.07
911	0.09
912	0.09
913	0.08
914	0.09
915	0.09
916	0.11
917	0.13
918	0.15
919	0.18
920	0.29
921	0.38
922	0.44
923	0.46
924	0.47
925	0.5
926	0.5
927	0.52
928	0.44
929	0.42
930	0.4
931	0.42
932	0.39
933	0.36
934	0.34
935	0.26
936	0.23
937	0.17
938	0.12
939	0.09
940	0.07
941	0.06
942	0.06
943	0.07
944	0.06
945	0.06
946	0.1
947	0.1
948	0.11
949	0.11
950	0.11
951	0.13
952	0.13
953	0.13
954	0.1
955	0.11
956	0.15
957	0.2
958	0.29
959	0.29
960	0.39
961	0.48
962	0.52
963	0.55
964	0.58
965	0.6
966	0.57
967	0.59
968	0.57
969	0.58
970	0.57
971	0.56
972	0.49
973	0.41
974	0.37
975	0.34
976	0.3
977	0.27
978	0.24
979	0.26
980	0.33
981	0.41
982	0.47
983	0.53
984	0.59
985	0.61
986	0.7
987	0.67
988	0.69
989	0.64
990	0.61
991	0.59
992	0.53
993	0.44
994	0.34
995	0.32
996	0.22
997	0.22
998	0.21
999	0.15
1000	0.14
1001	0.13
1002	0.14
1003	0.14
1004	0.14
1005	0.12
1006	0.13
1007	0.16
1008	0.18
1009	0.21
1010	0.25
1011	0.3
1012	0.32
1013	0.33
1014	0.33
1015	0.32
1016	0.28
1017	0.26
1018	0.22
1019	0.26
1020	0.25
1021	0.25
1022	0.23
1023	0.22
1024	0.22
1025	0.2
1026	0.18
1027	0.09
1028	0.08
1029	0.07
1030	0.07
1031	0.07
1032	0.09
1033	0.1
1034	0.11
1035	0.11
1036	0.1
1037	0.1
1038	0.1
1039	0.11
1040	0.12
1041	0.11
1042	0.11
1043	0.11
1044	0.13
1045	0.11
1046	0.1
1047	0.09
1048	0.07
1049	0.07
1050	0.08
1051	0.08
1052	0.09
1053	0.14
1054	0.17
1055	0.23
1056	0.29
1057	0.34
1058	0.41
1059	0.42
1060	0.43
1061	0.44
1062	0.52
1063	0.5
1064	0.5
1065	0.47
1066	0.45
1067	0.45
1068	0.45
1069	0.43
1070	0.34
1071	0.29
1072	0.27
1073	0.29
1074	0.28
1075	0.29
1076	0.28
1077	0.26
1078	0.25
1079	0.24
1080	0.22
1081	0.21
1082	0.17
1083	0.17
1084	0.16
1085	0.17
1086	0.18
1087	0.18
1088	0.17
1089	0.17
1090	0.17
1091	0.19
1092	0.21
1093	0.21
1094	0.22
1095	0.22
1096	0.22
1097	0.21
1098	0.21
1099	0.16
1100	0.13
1101	0.14
1102	0.13
1103	0.12
1104	0.12
1105	0.14
1106	0.14
1107	0.16
1108	0.17
1109	0.17
1110	0.18
1111	0.21
1112	0.21
1113	0.22
1114	0.27
1115	0.32
1116	0.31
1117	0.34
1118	0.35
1119	0.41
1120	0.4
1121	0.36
1122	0.34
1123	0.29
1124	0.37
1125	0.35
1126	0.37
1127	0.32
1128	0.32
1129	0.33
1130	0.3
1131	0.28
1132	0.19
1133	0.18
1134	0.13
1135	0.11
1136	0.1
1137	0.09
1138	0.09
1139	0.09
1140	0.09
1141	0.08
1142	0.08
1143	0.06
1144	0.06
1145	0.06
1146	0.08
1147	0.08
1148	0.09
1149	0.08
1150	0.08
1151	0.09
1152	0.09
1153	0.14
1154	0.13
1155	0.14
1156	0.18
1157	0.19
1158	0.22
1159	0.23
1160	0.27
1161	0.29
1162	0.33
1163	0.4
1164	0.45
1165	0.5
1166	0.55
1167	0.62
1168	0.61
1169	0.6
1170	0.62
1171	0.62
1172	0.63
1173	0.64
1174	0.62
1175	0.61
1176	0.62
1177	0.61
1178	0.62
1179	0.56
1180	0.54
1181	0.51
1182	0.53
1183	0.53
1184	0.56
1185	0.6
1186	0.59
1187	0.6
1188	0.53
1189	0.59
1190	0.59
1191	0.6
1192	0.57
1193	0.5
1194	0.47
1195	0.51
1196	0.56
1197	0.53
1198	0.52
1199	0.53
1200	0.5
1201	0.53
1202	0.53
1203	0.46
1204	0.42
1205	0.41
1206	0.4
1207	0.35
1208	0.38
1209	0.36
1210	0.4
1211	0.42
1212	0.42
1213	0.43
1214	0.37
1215	0.37
1216	0.38
1217	0.41
1218	0.4
1219	0.41
1220	0.43
1221	0.4
1222	0.41
1223	0.39
1224	0.34
1225	0.34
1226	0.31
1227	0.31
1228	0.26
1229	0.24
1230	0.21
1231	0.2
1232	0.29
1233	0.26
1234	0.22
1235	0.23
1236	0.25
1237	0.26
1238	0.28
1239	0.29
1240	0.21
1241	0.21
1242	0.25
1243	0.24
1244	0.28
1245	0.27
1246	0.27

A0A178AQX6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer