Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178B1C0

Protein Details
Accession A0A178B1C0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-69SGITNQKERKRLQNRLNKRISRQRKRLTSCKDDSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-59RKRLQNRLNKRISRQRK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 11.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021833  DUF3425  
Pfam View protein in Pfam  
PF11905  DUF3425  
Amino Acid Sequences MKILDNTPCIRHASYVEMRPTRHEPYIRRPGEDWSGITNQKERKRLQNRLNKRISRQRKRLTSCKDDSSDSACSSATSPDAACLEVAQASYSNVSMFSHCSKEDAAQKRAMLERFAEQALKTYMAGDPCADHHLKLIQFNIINGFTKNAAMLGYQHDWLICAAVSPFGRNGARCNQISAAIPSSLVPTRLQLTTTHHPWLDLFPFPKMRDNLLLAVSFLSAGEEQQLFEDVMESDGNKDEWTGLVVWGEPWDPKSWEVSIPFLERWAWLINGCPEIIASTNHWRRRRGEGPITPPPELVVEEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.4
3 0.46
4 0.47
5 0.47
6 0.51
7 0.54
8 0.51
9 0.51
10 0.52
11 0.5
12 0.55
13 0.66
14 0.62
15 0.6
16 0.56
17 0.54
18 0.54
19 0.5
20 0.41
21 0.35
22 0.39
23 0.38
24 0.39
25 0.39
26 0.41
27 0.44
28 0.51
29 0.5
30 0.55
31 0.63
32 0.71
33 0.74
34 0.78
35 0.81
36 0.84
37 0.9
38 0.86
39 0.84
40 0.85
41 0.86
42 0.86
43 0.86
44 0.86
45 0.86
46 0.88
47 0.89
48 0.87
49 0.85
50 0.8
51 0.77
52 0.7
53 0.62
54 0.56
55 0.51
56 0.45
57 0.35
58 0.3
59 0.22
60 0.2
61 0.18
62 0.16
63 0.12
64 0.1
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.1
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.15
88 0.15
89 0.19
90 0.27
91 0.31
92 0.32
93 0.33
94 0.33
95 0.34
96 0.38
97 0.35
98 0.27
99 0.21
100 0.2
101 0.19
102 0.19
103 0.18
104 0.13
105 0.15
106 0.15
107 0.14
108 0.12
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.12
117 0.12
118 0.1
119 0.1
120 0.14
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.15
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.06
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.14
158 0.18
159 0.23
160 0.22
161 0.24
162 0.22
163 0.23
164 0.24
165 0.22
166 0.18
167 0.13
168 0.13
169 0.11
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.1
174 0.09
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.12
179 0.19
180 0.24
181 0.27
182 0.29
183 0.26
184 0.26
185 0.26
186 0.27
187 0.23
188 0.2
189 0.18
190 0.18
191 0.23
192 0.24
193 0.3
194 0.28
195 0.28
196 0.28
197 0.29
198 0.28
199 0.25
200 0.24
201 0.18
202 0.17
203 0.14
204 0.1
205 0.08
206 0.07
207 0.05
208 0.05
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.09
237 0.1
238 0.13
239 0.14
240 0.15
241 0.18
242 0.19
243 0.22
244 0.23
245 0.25
246 0.25
247 0.27
248 0.26
249 0.24
250 0.23
251 0.19
252 0.2
253 0.19
254 0.16
255 0.13
256 0.17
257 0.19
258 0.2
259 0.19
260 0.17
261 0.14
262 0.15
263 0.16
264 0.14
265 0.15
266 0.25
267 0.33
268 0.42
269 0.48
270 0.52
271 0.54
272 0.62
273 0.65
274 0.64
275 0.67
276 0.67
277 0.7
278 0.75
279 0.77
280 0.68
281 0.6
282 0.51
283 0.42