Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AQB3

Protein Details
Accession A0A178AQB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-112GNKVAQEDKKKSKSKKATQAEAGEHydrophilic
408-427VSGLVRTKKKAKPAPAPVAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-103KKSKSK
415-422KKKAKPAP
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 12.5, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MADPATEVLAAVDETEELPKTKEKLDELTTAASIHYSTKNFSAAAENYANAAEIQVELNGEMAPENAELLFYYGRALYKVAVAKSDVLGNKVAQEDKKKSKSKKATQAEAGEGSSAANGAKTEPKEESVESKPFFQLTGDENWTDSEDEEDEEEGEQEEEDDDFGIAYETFDLARVLYSKQLEALEGGESADKGKGKAELSPQARKIKEKLADCYGFLVDISLENERFHAAIEDARSALALQEELNPFEHENVTESHYSLSLALEFASMSKVREDQTGKPSDAPEREDAPGDENKDGIDWDLRNEAAKQTELAIQSLQARLKKEEAALAAGTLTPEQQKEKKTIIEDKKGMLEELTTRVTDLKADPTKQEVDSIDPTVFQGLLGGLLGADSATQKAKIAEATASANDVSGLVRTKKKAKPAPAPVAAESSGKRKLDVDGEDVGGKRAKTEEPAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.09
3 0.1
4 0.1
5 0.13
6 0.17
7 0.2
8 0.24
9 0.28
10 0.3
11 0.36
12 0.39
13 0.41
14 0.39
15 0.39
16 0.35
17 0.3
18 0.27
19 0.2
20 0.16
21 0.16
22 0.18
23 0.17
24 0.19
25 0.2
26 0.22
27 0.22
28 0.22
29 0.26
30 0.22
31 0.26
32 0.25
33 0.23
34 0.22
35 0.22
36 0.21
37 0.14
38 0.13
39 0.08
40 0.07
41 0.07
42 0.06
43 0.07
44 0.06
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.08
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.09
65 0.14
66 0.19
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.2
71 0.2
72 0.25
73 0.21
74 0.18
75 0.19
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.23
80 0.22
81 0.29
82 0.36
83 0.44
84 0.54
85 0.61
86 0.65
87 0.73
88 0.8
89 0.82
90 0.84
91 0.83
92 0.82
93 0.8
94 0.77
95 0.7
96 0.6
97 0.5
98 0.39
99 0.3
100 0.22
101 0.14
102 0.1
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.12
108 0.12
109 0.15
110 0.16
111 0.18
112 0.2
113 0.22
114 0.26
115 0.26
116 0.32
117 0.3
118 0.31
119 0.29
120 0.27
121 0.26
122 0.21
123 0.18
124 0.15
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.19
129 0.19
130 0.2
131 0.17
132 0.14
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.11
183 0.11
184 0.14
185 0.18
186 0.25
187 0.29
188 0.35
189 0.4
190 0.44
191 0.45
192 0.44
193 0.42
194 0.42
195 0.43
196 0.4
197 0.38
198 0.38
199 0.38
200 0.35
201 0.34
202 0.26
203 0.2
204 0.17
205 0.13
206 0.06
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.09
259 0.1
260 0.15
261 0.18
262 0.22
263 0.29
264 0.33
265 0.33
266 0.33
267 0.34
268 0.34
269 0.33
270 0.32
271 0.27
272 0.25
273 0.25
274 0.25
275 0.23
276 0.21
277 0.22
278 0.21
279 0.18
280 0.15
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.1
285 0.11
286 0.09
287 0.1
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.15
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.16
298 0.16
299 0.16
300 0.14
301 0.13
302 0.15
303 0.18
304 0.19
305 0.18
306 0.2
307 0.22
308 0.24
309 0.24
310 0.23
311 0.23
312 0.21
313 0.2
314 0.18
315 0.15
316 0.13
317 0.12
318 0.11
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.14
324 0.19
325 0.22
326 0.26
327 0.3
328 0.33
329 0.37
330 0.46
331 0.5
332 0.55
333 0.55
334 0.52
335 0.53
336 0.49
337 0.43
338 0.33
339 0.26
340 0.18
341 0.2
342 0.19
343 0.15
344 0.14
345 0.15
346 0.15
347 0.16
348 0.15
349 0.21
350 0.25
351 0.27
352 0.28
353 0.31
354 0.35
355 0.33
356 0.35
357 0.27
358 0.26
359 0.27
360 0.28
361 0.24
362 0.21
363 0.21
364 0.18
365 0.16
366 0.11
367 0.08
368 0.06
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.03
376 0.03
377 0.04
378 0.05
379 0.07
380 0.07
381 0.09
382 0.1
383 0.12
384 0.12
385 0.14
386 0.13
387 0.14
388 0.17
389 0.16
390 0.17
391 0.15
392 0.14
393 0.12
394 0.12
395 0.1
396 0.09
397 0.13
398 0.17
399 0.23
400 0.29
401 0.38
402 0.43
403 0.53
404 0.6
405 0.65
406 0.71
407 0.76
408 0.8
409 0.79
410 0.78
411 0.69
412 0.65
413 0.56
414 0.49
415 0.4
416 0.36
417 0.35
418 0.31
419 0.31
420 0.28
421 0.31
422 0.34
423 0.36
424 0.34
425 0.3
426 0.32
427 0.34
428 0.33
429 0.32
430 0.28
431 0.24
432 0.21
433 0.21
434 0.22