Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AVD4

Protein Details
Accession A0A178AVD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
351-375SMIEATPKRKRGRPRKNATQDPSLAHydrophilic
388-413SVTVTAGPKRRGRPKKPVQTPEAYALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
357-366PKRKRGRPRK
395-403PKRRGRPKK
Subcellular Location(s) extr 8, mito 7, nucl 5, pero 3, cyto 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003677  F:DNA binding  
Amino Acid Sequences MIFTLFLIAVAAFWAFIGLKLAQWLKQSGHSKPFKGRQINALAIRAANTSLTREMLSVLRLAARSIAGFLLDGLAIPDHLEPLGSLIMAFTAGTAASTSLHYFLRRNREHRARIDLAIYIVARVVESTPQYRNLLDRPEHLLNILDEQVMPVLNAHLTKGEAKVAMTQLKRKIWDDHEESQERVFKRRRSTAPERSILAESDADIQAQLFAEADEDDDSVMESVEDRSEEQRTPSAQRSTEVQAVDTSRGSPTPRMSSFTSQELCAYTTSSQSQTPLGSSTVVQAAFAPQFAMPPPPSLGKIGASLSTSHRRELESAVSSPNPPNLFYFSGYCLDYNNRTLYPTPTAAANSMIEATPKRKRGRPRKNATQDPSLATPACDPASAVRDSVTVTAGPKRRGRPKKPVQTPEAYALLASSPEQAQSLSDTQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.09
5 0.08
6 0.09
7 0.14
8 0.17
9 0.19
10 0.22
11 0.25
12 0.24
13 0.32
14 0.38
15 0.4
16 0.48
17 0.52
18 0.55
19 0.61
20 0.68
21 0.69
22 0.72
23 0.68
24 0.67
25 0.68
26 0.7
27 0.64
28 0.58
29 0.5
30 0.41
31 0.39
32 0.31
33 0.23
34 0.17
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.16
39 0.15
40 0.14
41 0.16
42 0.15
43 0.16
44 0.13
45 0.13
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.13
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.1
88 0.12
89 0.16
90 0.21
91 0.31
92 0.38
93 0.42
94 0.5
95 0.59
96 0.65
97 0.67
98 0.7
99 0.62
100 0.57
101 0.54
102 0.44
103 0.35
104 0.29
105 0.23
106 0.15
107 0.11
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.09
114 0.12
115 0.14
116 0.17
117 0.19
118 0.19
119 0.22
120 0.23
121 0.28
122 0.26
123 0.27
124 0.31
125 0.32
126 0.31
127 0.28
128 0.26
129 0.2
130 0.2
131 0.18
132 0.11
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.07
137 0.07
138 0.05
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.1
150 0.12
151 0.14
152 0.19
153 0.2
154 0.24
155 0.29
156 0.31
157 0.33
158 0.33
159 0.36
160 0.35
161 0.41
162 0.42
163 0.42
164 0.46
165 0.46
166 0.44
167 0.4
168 0.41
169 0.34
170 0.35
171 0.36
172 0.34
173 0.39
174 0.47
175 0.5
176 0.54
177 0.63
178 0.66
179 0.68
180 0.66
181 0.6
182 0.54
183 0.49
184 0.4
185 0.31
186 0.21
187 0.14
188 0.13
189 0.12
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.07
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.13
219 0.15
220 0.19
221 0.23
222 0.26
223 0.24
224 0.24
225 0.27
226 0.28
227 0.29
228 0.26
229 0.2
230 0.18
231 0.19
232 0.19
233 0.16
234 0.13
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.15
240 0.2
241 0.2
242 0.24
243 0.27
244 0.3
245 0.31
246 0.33
247 0.31
248 0.26
249 0.25
250 0.22
251 0.2
252 0.16
253 0.15
254 0.11
255 0.11
256 0.13
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.09
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.12
280 0.1
281 0.12
282 0.14
283 0.15
284 0.16
285 0.17
286 0.18
287 0.15
288 0.16
289 0.15
290 0.15
291 0.14
292 0.14
293 0.18
294 0.26
295 0.26
296 0.26
297 0.27
298 0.27
299 0.28
300 0.29
301 0.29
302 0.24
303 0.24
304 0.25
305 0.25
306 0.26
307 0.26
308 0.28
309 0.23
310 0.2
311 0.2
312 0.22
313 0.23
314 0.23
315 0.23
316 0.21
317 0.23
318 0.23
319 0.21
320 0.18
321 0.2
322 0.21
323 0.23
324 0.23
325 0.21
326 0.22
327 0.24
328 0.26
329 0.27
330 0.25
331 0.23
332 0.21
333 0.22
334 0.21
335 0.21
336 0.17
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.12
341 0.14
342 0.19
343 0.24
344 0.32
345 0.38
346 0.44
347 0.55
348 0.65
349 0.74
350 0.79
351 0.82
352 0.86
353 0.9
354 0.94
355 0.89
356 0.86
357 0.79
358 0.72
359 0.64
360 0.56
361 0.46
362 0.36
363 0.31
364 0.26
365 0.22
366 0.18
367 0.15
368 0.15
369 0.19
370 0.19
371 0.18
372 0.15
373 0.15
374 0.17
375 0.17
376 0.15
377 0.12
378 0.13
379 0.21
380 0.27
381 0.33
382 0.39
383 0.48
384 0.57
385 0.67
386 0.74
387 0.77
388 0.82
389 0.87
390 0.91
391 0.91
392 0.88
393 0.85
394 0.8
395 0.75
396 0.66
397 0.55
398 0.44
399 0.34
400 0.27
401 0.2
402 0.15
403 0.12
404 0.1
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.15