Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J4VUX3

Protein Details
Accession J4VUX3    Localization Confidence High Confidence Score 25.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-88QDYATPLSKKRKRSGDNEVEDSAKKAKKARMDKKEKKEKKKKKQAEKASRKDKKNKRKDLKDLPGEDDBasic
99-133NDQPATKETKKKDKSKYNNKKDKKDKEDKKEEETVBasic
143-167EEDEKTPKKESKKDKKKTSSSDETTBasic
296-320KSDHRTEKIREKNRKLDDNRAKRIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-79KKRKRSGDNEVEDSAKKAKKARMDKKEKKEKKKKKQAEKASRKDKKNKRKD
107-159TKKKDKSKYNNKKDKKDKEDKKEEETVEKGKKDEKDEEDEKTPKKESKKDKKK
300-324RTEKIREKNRKLDDNRAKRIEKEKA
386-421GGGRRGGWGGRGRGGGGGRGRGGRGGGGRGRGGRNR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MKSKRAQEVEAAAADKPAKAQDYATPLSKKRKRSGDNEVEDSAKKAKKARMDKKEKKEKKKKKQAEKASRKDKKNKRKDLKDLPGEDDNDAEAANGDVNDQPATKETKKKDKSKYNNKKDKKDKEDKKEEETVEKGKKDEKDEEDEKTPKKESKKDKKKTSSSDETTAAAAPEDAIPNGASNGIDLDVEDASAAATAEDKDDKAARHIVFVGNLPYTATAASISAHFASLSPIAVRCLTQKGGDPSHTCKGIAFVEFANAITQRTCLDRFHHSEFDDGHSPARKINVELTAGGGGKSDHRTEKIREKNRKLDDNRAKRIEKEKAAKNSDDSADGAGGAGGGGGGESGTMEEQQEHMDEQVHPSRRAQMGSDAPPEDNFQNGSGGGGGGRRGGWGGRGRGGGGGRGRGGRGGGGRGRGGRNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.23
3 0.19
4 0.18
5 0.17
6 0.17
7 0.19
8 0.21
9 0.28
10 0.32
11 0.37
12 0.4
13 0.44
14 0.55
15 0.59
16 0.63
17 0.65
18 0.72
19 0.73
20 0.75
21 0.8
22 0.8
23 0.81
24 0.78
25 0.71
26 0.63
27 0.56
28 0.5
29 0.46
30 0.38
31 0.34
32 0.35
33 0.38
34 0.45
35 0.56
36 0.64
37 0.67
38 0.76
39 0.83
40 0.87
41 0.93
42 0.94
43 0.94
44 0.95
45 0.95
46 0.95
47 0.96
48 0.95
49 0.95
50 0.96
51 0.96
52 0.96
53 0.96
54 0.95
55 0.95
56 0.94
57 0.92
58 0.92
59 0.92
60 0.91
61 0.91
62 0.92
63 0.91
64 0.93
65 0.93
66 0.94
67 0.93
68 0.92
69 0.84
70 0.78
71 0.73
72 0.64
73 0.54
74 0.43
75 0.32
76 0.23
77 0.18
78 0.13
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.11
90 0.18
91 0.21
92 0.29
93 0.35
94 0.46
95 0.55
96 0.64
97 0.72
98 0.76
99 0.83
100 0.86
101 0.91
102 0.91
103 0.93
104 0.92
105 0.93
106 0.93
107 0.92
108 0.91
109 0.91
110 0.9
111 0.9
112 0.92
113 0.86
114 0.81
115 0.78
116 0.69
117 0.63
118 0.57
119 0.54
120 0.49
121 0.45
122 0.4
123 0.38
124 0.4
125 0.4
126 0.43
127 0.4
128 0.42
129 0.44
130 0.46
131 0.48
132 0.49
133 0.46
134 0.42
135 0.41
136 0.38
137 0.43
138 0.48
139 0.52
140 0.58
141 0.67
142 0.74
143 0.82
144 0.87
145 0.88
146 0.88
147 0.86
148 0.84
149 0.78
150 0.72
151 0.62
152 0.53
153 0.44
154 0.36
155 0.27
156 0.17
157 0.12
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.04
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.02
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.16
192 0.15
193 0.16
194 0.17
195 0.16
196 0.15
197 0.16
198 0.15
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.11
226 0.12
227 0.15
228 0.19
229 0.21
230 0.24
231 0.25
232 0.28
233 0.31
234 0.3
235 0.27
236 0.22
237 0.22
238 0.21
239 0.19
240 0.15
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.1
252 0.11
253 0.12
254 0.15
255 0.21
256 0.27
257 0.32
258 0.35
259 0.33
260 0.34
261 0.33
262 0.35
263 0.31
264 0.26
265 0.24
266 0.23
267 0.23
268 0.22
269 0.24
270 0.2
271 0.18
272 0.22
273 0.22
274 0.2
275 0.2
276 0.2
277 0.18
278 0.17
279 0.16
280 0.12
281 0.09
282 0.11
283 0.13
284 0.15
285 0.16
286 0.19
287 0.24
288 0.29
289 0.39
290 0.47
291 0.55
292 0.63
293 0.69
294 0.75
295 0.79
296 0.84
297 0.78
298 0.79
299 0.8
300 0.8
301 0.8
302 0.79
303 0.72
304 0.68
305 0.71
306 0.69
307 0.67
308 0.65
309 0.65
310 0.67
311 0.7
312 0.66
313 0.61
314 0.57
315 0.49
316 0.42
317 0.34
318 0.25
319 0.2
320 0.18
321 0.14
322 0.09
323 0.07
324 0.05
325 0.04
326 0.03
327 0.02
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.03
334 0.03
335 0.04
336 0.05
337 0.06
338 0.07
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.12
344 0.12
345 0.17
346 0.25
347 0.29
348 0.3
349 0.31
350 0.37
351 0.38
352 0.39
353 0.35
354 0.35
355 0.37
356 0.41
357 0.45
358 0.39
359 0.37
360 0.36
361 0.38
362 0.3
363 0.25
364 0.21
365 0.16
366 0.16
367 0.15
368 0.14
369 0.11
370 0.11
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.16
380 0.21
381 0.25
382 0.28
383 0.29
384 0.29
385 0.32
386 0.33
387 0.33
388 0.29
389 0.29
390 0.28
391 0.29
392 0.29
393 0.26
394 0.26
395 0.24
396 0.23
397 0.27
398 0.28
399 0.3
400 0.33
401 0.37