FuNGI

A0A178AYN8

Protein Details

Accession

A0A178AYN8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
412-438	NMKSSKRGTYYRKRRRWERVKNVVDET	Hydrophilic
589-613	EGRVEARGHHGKKKRKVAAETAVPL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
424-426	KRR
595-604	RGHHGKKKRK

Subcellular Location(s)

cyto 12, mito 10, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017423 TRM6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031515 C:tRNA (m1A) methyltransferase complex GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF04189 Gcd10p

Amino Acid Sequences

MHSHVRPNTHVALRLPSGLFKIVEITPNQSINLGKFGTFNSNLLLGRPYYLTYELLDKDDGRSKTELRVVPAAELHAEALGSDHAPAAETSDETAEGGAGFDIVGDDGEVIMRNNRLTIDDASRQGLSMEEIEELKKAGTGSGKDIIAKIMASHNAIDEKTSFSLAKYTLRKSRKYLKRFTALPMDVGVLTEYVLEKEAYKIMELREDLLGLICSWANIHCGATSRVQTAEDGVSQVGGGRWLVVDDTGGLVTAALAERMGVLYPDEDEDSSEDDDAPESAPAERPATNGAKDSAENTDQNGDTEMPDVDASVSTHAQPNAASSEPALQPRKPPRPHIPQMSAQTNTLTVLHPNNQPNLSYLKYFGYDYGAPAPSHPLYKHLKSLSWLSLLHPEDDPQYDEPETLSDEVLANMKSSKRGTYYRKRRRWERVKNVVDETRAGGFDGLVVASSMDATSVLKELVPLVRGGGKIVVYNQNVEPLVELCDYYSKERRAAFIAHEFGPSTKQLKQQNGKTNRYDDDAETNDSTTEGGNEEDDFPVNPTLLLAPSLQTARARQWQVLPQRTHPMMTSRGGAEGYIFTATRVLPIEGRVEARGHHGKKKRKVAAETAVPL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.38
3	0.32
4	0.3
5	0.28
6	0.26
7	0.2
8	0.22
9	0.19
10	0.23
11	0.22
12	0.26
13	0.27
14	0.28
15	0.28
16	0.26
17	0.26
18	0.24
19	0.27
20	0.22
21	0.19
22	0.19
23	0.2
24	0.25
25	0.25
26	0.24
27	0.21
28	0.24
29	0.23
30	0.23
31	0.24
32	0.17
33	0.17
34	0.17
35	0.16
36	0.16
37	0.18
38	0.17
39	0.16
40	0.21
41	0.21
42	0.22
43	0.23
44	0.21
45	0.23
46	0.3
47	0.3
48	0.28
49	0.3
50	0.3
51	0.34
52	0.41
53	0.4
54	0.37
55	0.41
56	0.38
57	0.36
58	0.36
59	0.3
60	0.23
61	0.21
62	0.16
63	0.11
64	0.1
65	0.08
66	0.07
67	0.07
68	0.06
69	0.06
70	0.06
71	0.06
72	0.07
73	0.07
74	0.08
75	0.08
76	0.09
77	0.09
78	0.1
79	0.1
80	0.09
81	0.09
82	0.07
83	0.06
84	0.06
85	0.05
86	0.04
87	0.04
88	0.04
89	0.04
90	0.04
91	0.03
92	0.03
93	0.03
94	0.03
95	0.04
96	0.05
97	0.05
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.1
102	0.11
103	0.12
104	0.15
105	0.18
106	0.22
107	0.25
108	0.27
109	0.28
110	0.27
111	0.26
112	0.22
113	0.19
114	0.15
115	0.11
116	0.1
117	0.09
118	0.1
119	0.1
120	0.1
121	0.1
122	0.09
123	0.09
124	0.08
125	0.09
126	0.13
127	0.14
128	0.17
129	0.21
130	0.22
131	0.21
132	0.21
133	0.2
134	0.17
135	0.15
136	0.12
137	0.11
138	0.12
139	0.13
140	0.13
141	0.13
142	0.15
143	0.15
144	0.15
145	0.12
146	0.14
147	0.13
148	0.15
149	0.14
150	0.12
151	0.15
152	0.16
153	0.22
154	0.25
155	0.3
156	0.37
157	0.44
158	0.48
159	0.52
160	0.61
161	0.64
162	0.68
163	0.71
164	0.71
165	0.72
166	0.7
167	0.68
168	0.67
169	0.58
170	0.49
171	0.4
172	0.33
173	0.25
174	0.22
175	0.18
176	0.08
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.05
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.07
185	0.09
186	0.09
187	0.09
188	0.11
189	0.11
190	0.15
191	0.15
192	0.15
193	0.14
194	0.13
195	0.13
196	0.11
197	0.11
198	0.07
199	0.07
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.06
205	0.06
206	0.07
207	0.07
208	0.09
209	0.11
210	0.14
211	0.15
212	0.15
213	0.15
214	0.15
215	0.14
216	0.14
217	0.13
218	0.1
219	0.1
220	0.08
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.06
225	0.05
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.03
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.06
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.07
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.13
274	0.15
275	0.15
276	0.15
277	0.15
278	0.14
279	0.14
280	0.15
281	0.14
282	0.14
283	0.13
284	0.13
285	0.14
286	0.13
287	0.13
288	0.13
289	0.1
290	0.08
291	0.09
292	0.08
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.06
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.08
306	0.09
307	0.1
308	0.1
309	0.09
310	0.07
311	0.11
312	0.12
313	0.18
314	0.19
315	0.18
316	0.25
317	0.34
318	0.44
319	0.44
320	0.49
321	0.53
322	0.61
323	0.68
324	0.68
325	0.64
326	0.61
327	0.63
328	0.6
329	0.52
330	0.42
331	0.35
332	0.27
333	0.23
334	0.17
335	0.12
336	0.09
337	0.1
338	0.14
339	0.19
340	0.21
341	0.23
342	0.22
343	0.22
344	0.22
345	0.24
346	0.21
347	0.17
348	0.16
349	0.14
350	0.15
351	0.15
352	0.13
353	0.14
354	0.12
355	0.13
356	0.16
357	0.17
358	0.15
359	0.15
360	0.19
361	0.16
362	0.18
363	0.17
364	0.19
365	0.23
366	0.25
367	0.31
368	0.29
369	0.29
370	0.29
371	0.33
372	0.3
373	0.27
374	0.25
375	0.2
376	0.26
377	0.26
378	0.25
379	0.21
380	0.19
381	0.18
382	0.19
383	0.2
384	0.13
385	0.15
386	0.14
387	0.14
388	0.13
389	0.12
390	0.12
391	0.11
392	0.1
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.1
397	0.09
398	0.08
399	0.09
400	0.1
401	0.13
402	0.14
403	0.16
404	0.19
405	0.27
406	0.36
407	0.45
408	0.56
409	0.64
410	0.72
411	0.79
412	0.85
413	0.88
414	0.9
415	0.9
416	0.9
417	0.9
418	0.88
419	0.83
420	0.79
421	0.72
422	0.62
423	0.51
424	0.42
425	0.33
426	0.25
427	0.21
428	0.14
429	0.1
430	0.09
431	0.08
432	0.06
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.03
437	0.04
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.06
447	0.07
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.09
452	0.12
453	0.12
454	0.13
455	0.13
456	0.12
457	0.12
458	0.16
459	0.22
460	0.19
461	0.22
462	0.22
463	0.24
464	0.24
465	0.23
466	0.2
467	0.14
468	0.16
469	0.13
470	0.13
471	0.1
472	0.13
473	0.15
474	0.2
475	0.27
476	0.26
477	0.3
478	0.32
479	0.34
480	0.33
481	0.34
482	0.34
483	0.33
484	0.35
485	0.31
486	0.31
487	0.29
488	0.26
489	0.26
490	0.24
491	0.2
492	0.21
493	0.27
494	0.33
495	0.43
496	0.51
497	0.58
498	0.66
499	0.73
500	0.76
501	0.75
502	0.73
503	0.65
504	0.61
505	0.54
506	0.46
507	0.43
508	0.39
509	0.38
510	0.33
511	0.31
512	0.26
513	0.23
514	0.21
515	0.14
516	0.12
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.11
522	0.11
523	0.12
524	0.11
525	0.13
526	0.13
527	0.13
528	0.11
529	0.1
530	0.11
531	0.1
532	0.11
533	0.09
534	0.09
535	0.12
536	0.13
537	0.14
538	0.16
539	0.18
540	0.23
541	0.31
542	0.33
543	0.33
544	0.38
545	0.45
546	0.53
547	0.59
548	0.58
549	0.54
550	0.61
551	0.6
552	0.55
553	0.49
554	0.45
555	0.4
556	0.38
557	0.36
558	0.28
559	0.28
560	0.26
561	0.24
562	0.2
563	0.16
564	0.14
565	0.13
566	0.12
567	0.1
568	0.12
569	0.12
570	0.13
571	0.15
572	0.15
573	0.14
574	0.16
575	0.19
576	0.2
577	0.22
578	0.21
579	0.2
580	0.19
581	0.27
582	0.35
583	0.37
584	0.44
585	0.51
586	0.6
587	0.69
588	0.79
589	0.8
590	0.79
591	0.82
592	0.82
593	0.82

A0A178AYN8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer