Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AF80

Protein Details
Accession A0A178AF80    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-41APATKTRRTSSRSKKAAPKSKAAWHydrophilic
204-226LYHPTKPAPKKAKRVTKGKRASTHydrophilic
235-257TTNSTTTKKSKRGKKRTSEAMEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-38RRTSSRSKKAAPKSK
209-224KPAPKKAKRVTKGKRA
242-250KKSKRGKKR
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 7.5, cyto_nucl 6.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001370  BIR_rpt  
Pfam View protein in Pfam  
PF00653  BIR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50143  BIR_REPEAT_2  
CDD cd00022  BIR  
Amino Acid Sequences MDASMATYQARLASFQGAPATKTRRTSSRSKKAAPKSKAAWPLSAPSAEELAHAGFVWKPTSLSPDNVQCWACSCSLDGWEETDVPSFEHLTHSPQCGFAVVTAIRMRSGDPGRAEEDPIGEAMIKAREYTFGDVWPLDTAAGYPGVEQLAAAGWYFDPAEGTPDGVTCPYCELSLDAWDAGDDPLEEHRRRQPDCYFFTLSELYHPTKPAPKKAKRVTKGKRASTRSSTVSNATTNSTTTKKSKRGKKRTSEAMEEDTQISEPARDTSKRMRYSSMSSFPDDLPVGTPKKTPTDMENEPFTMSSLPADVLVGTPNKMPTDLDTEPFTMSSFPANLLVGTPKKTPSHLREVEGQDTTSEWQPIDMDVFFANQSDVRGFMNEVVIDAGLDELTVAGTTPEEVQAAILAGLTETEKGMTIEQWVLYNAKRGEEKLRMACETQIEAFEREGKRALGALGAIETY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.24
4 0.23
5 0.24
6 0.3
7 0.35
8 0.35
9 0.41
10 0.44
11 0.47
12 0.51
13 0.6
14 0.64
15 0.69
16 0.73
17 0.77
18 0.82
19 0.84
20 0.89
21 0.85
22 0.83
23 0.77
24 0.76
25 0.77
26 0.69
27 0.63
28 0.55
29 0.53
30 0.48
31 0.44
32 0.35
33 0.27
34 0.26
35 0.22
36 0.19
37 0.15
38 0.12
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.11
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.19
49 0.21
50 0.24
51 0.27
52 0.34
53 0.36
54 0.39
55 0.39
56 0.31
57 0.32
58 0.31
59 0.26
60 0.19
61 0.18
62 0.15
63 0.17
64 0.19
65 0.16
66 0.16
67 0.17
68 0.16
69 0.16
70 0.16
71 0.14
72 0.12
73 0.13
74 0.12
75 0.11
76 0.14
77 0.14
78 0.18
79 0.21
80 0.24
81 0.24
82 0.24
83 0.23
84 0.21
85 0.2
86 0.14
87 0.16
88 0.12
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.18
96 0.21
97 0.22
98 0.23
99 0.25
100 0.28
101 0.28
102 0.29
103 0.22
104 0.21
105 0.16
106 0.14
107 0.12
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.11
116 0.14
117 0.18
118 0.17
119 0.15
120 0.17
121 0.16
122 0.17
123 0.15
124 0.13
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.11
163 0.11
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.07
169 0.07
170 0.04
171 0.05
172 0.09
173 0.15
174 0.16
175 0.18
176 0.24
177 0.31
178 0.32
179 0.37
180 0.4
181 0.42
182 0.46
183 0.49
184 0.45
185 0.39
186 0.4
187 0.36
188 0.28
189 0.23
190 0.22
191 0.19
192 0.18
193 0.18
194 0.17
195 0.24
196 0.27
197 0.34
198 0.41
199 0.46
200 0.55
201 0.64
202 0.73
203 0.73
204 0.81
205 0.8
206 0.81
207 0.82
208 0.8
209 0.8
210 0.75
211 0.74
212 0.68
213 0.64
214 0.56
215 0.49
216 0.42
217 0.35
218 0.31
219 0.26
220 0.21
221 0.18
222 0.16
223 0.14
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.21
228 0.27
229 0.35
230 0.43
231 0.52
232 0.61
233 0.71
234 0.78
235 0.82
236 0.83
237 0.85
238 0.82
239 0.77
240 0.7
241 0.63
242 0.54
243 0.45
244 0.37
245 0.27
246 0.22
247 0.16
248 0.12
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.1
253 0.11
254 0.15
255 0.23
256 0.32
257 0.37
258 0.38
259 0.4
260 0.4
261 0.45
262 0.48
263 0.47
264 0.4
265 0.37
266 0.37
267 0.34
268 0.33
269 0.27
270 0.2
271 0.15
272 0.17
273 0.17
274 0.16
275 0.17
276 0.17
277 0.21
278 0.22
279 0.22
280 0.21
281 0.27
282 0.31
283 0.32
284 0.33
285 0.3
286 0.29
287 0.27
288 0.24
289 0.17
290 0.12
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.18
308 0.18
309 0.19
310 0.2
311 0.21
312 0.21
313 0.21
314 0.19
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.09
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.14
325 0.14
326 0.17
327 0.18
328 0.21
329 0.22
330 0.26
331 0.34
332 0.35
333 0.44
334 0.45
335 0.46
336 0.51
337 0.54
338 0.54
339 0.47
340 0.4
341 0.3
342 0.27
343 0.26
344 0.2
345 0.17
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.11
352 0.1
353 0.09
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.13
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.04
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.11
405 0.13
406 0.13
407 0.14
408 0.15
409 0.17
410 0.17
411 0.25
412 0.23
413 0.25
414 0.27
415 0.29
416 0.35
417 0.4
418 0.47
419 0.46
420 0.5
421 0.49
422 0.48
423 0.48
424 0.43
425 0.39
426 0.33
427 0.29
428 0.27
429 0.26
430 0.26
431 0.31
432 0.29
433 0.28
434 0.29
435 0.26
436 0.24
437 0.24
438 0.22
439 0.16
440 0.15
441 0.14