Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0W685

Protein Details
Accession G0W685    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-23ESPNAQSKKVQQPSPRQQQPTHydrophilic
32-62TSTDGTAINPRNRRRRPKSRNKQTIDTVPDKHydrophilic
76-114LKGSNKPAKKRATQQQQKQQKRQKQRQKQDRNESNLFKLHydrophilic
209-235EENVPERSRNNPKKHQRTKAPKKDILEHydrophilic
310-365KNANKDKNKDKISKENKKEKQKGAKATTGTTEGKKKSRRSKKKKKNVPATNTNMGSHydrophilic
388-413ILEAAGKKELQKRKKQISKTSNVMPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-52RNRRRRPKSRN
81-86KPAKKR
219-230NPKKHQRTKAPK
313-354NKDKNKDKISKENKKEKQKGAKATTGTTEGKKKSRRSKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG ndi:NDAI_0B02610  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSESPNAQSKKVQQPSPRQQQPTGTTVAAGNTSTDGTAINPRNRRRRPKSRNKQTIDTVPDKEANSTAKSENATHLKGSNKPAKKRATQQQQKQQKRQKQRQKQDRNESNLFKLVLRHLPPNLNSENFIKNVSLSKNIHDLYLEWYYIQGHYSSKLFKQPHYSRAYFIFDSIVKLNKFASIVKNMKFIDDHENVMIPLLTLSSYIKSIEENVPERSRNNPKKHQRTKAPKKDILEGTIENDDLFKMFLGRSKENDKVIDYGNFSLLRPVRKEVSRQKEADIAAAKKSELALTKLAGGSASSTKDVTSQAKNANKDKNKDKISKENKKEKQKGAKATTGTTEGKKKSRRSKKKKKNVPATNTNMGSGNLTFESSTDNATNKKPTQNVVILEAAGKKELQKRKKQISKTSNVMPSLLSQTNNNHIDSPTKNIQSSIKILKREK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.8
3 0.85
4 0.85
5 0.8
6 0.76
7 0.77
8 0.73
9 0.66
10 0.59
11 0.48
12 0.4
13 0.35
14 0.32
15 0.24
16 0.19
17 0.15
18 0.11
19 0.12
20 0.1
21 0.1
22 0.08
23 0.09
24 0.18
25 0.25
26 0.32
27 0.4
28 0.49
29 0.6
30 0.7
31 0.8
32 0.81
33 0.85
34 0.89
35 0.92
36 0.95
37 0.95
38 0.96
39 0.93
40 0.9
41 0.87
42 0.85
43 0.81
44 0.76
45 0.68
46 0.61
47 0.57
48 0.5
49 0.43
50 0.37
51 0.32
52 0.28
53 0.28
54 0.25
55 0.24
56 0.26
57 0.26
58 0.3
59 0.32
60 0.31
61 0.3
62 0.33
63 0.33
64 0.37
65 0.44
66 0.46
67 0.49
68 0.55
69 0.62
70 0.66
71 0.7
72 0.74
73 0.76
74 0.78
75 0.8
76 0.82
77 0.85
78 0.87
79 0.9
80 0.91
81 0.91
82 0.89
83 0.9
84 0.91
85 0.92
86 0.92
87 0.93
88 0.93
89 0.94
90 0.95
91 0.95
92 0.93
93 0.91
94 0.87
95 0.8
96 0.72
97 0.65
98 0.55
99 0.45
100 0.38
101 0.33
102 0.32
103 0.3
104 0.31
105 0.3
106 0.34
107 0.35
108 0.38
109 0.37
110 0.31
111 0.31
112 0.31
113 0.3
114 0.25
115 0.25
116 0.19
117 0.17
118 0.2
119 0.2
120 0.23
121 0.22
122 0.23
123 0.28
124 0.28
125 0.28
126 0.23
127 0.22
128 0.2
129 0.21
130 0.19
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.11
140 0.14
141 0.15
142 0.22
143 0.24
144 0.25
145 0.36
146 0.39
147 0.46
148 0.51
149 0.5
150 0.44
151 0.46
152 0.48
153 0.37
154 0.33
155 0.26
156 0.19
157 0.2
158 0.2
159 0.21
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.17
167 0.21
168 0.26
169 0.26
170 0.32
171 0.31
172 0.31
173 0.29
174 0.28
175 0.27
176 0.24
177 0.24
178 0.18
179 0.19
180 0.18
181 0.17
182 0.15
183 0.07
184 0.05
185 0.04
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.09
195 0.11
196 0.14
197 0.16
198 0.19
199 0.21
200 0.22
201 0.23
202 0.27
203 0.36
204 0.41
205 0.47
206 0.54
207 0.62
208 0.72
209 0.81
210 0.83
211 0.83
212 0.85
213 0.88
214 0.89
215 0.88
216 0.81
217 0.74
218 0.73
219 0.64
220 0.55
221 0.47
222 0.36
223 0.29
224 0.25
225 0.22
226 0.14
227 0.12
228 0.1
229 0.07
230 0.06
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.08
235 0.13
236 0.15
237 0.18
238 0.22
239 0.26
240 0.28
241 0.29
242 0.27
243 0.24
244 0.24
245 0.24
246 0.21
247 0.17
248 0.18
249 0.17
250 0.15
251 0.18
252 0.19
253 0.2
254 0.2
255 0.22
256 0.25
257 0.26
258 0.35
259 0.4
260 0.47
261 0.51
262 0.5
263 0.49
264 0.49
265 0.47
266 0.43
267 0.38
268 0.3
269 0.25
270 0.24
271 0.22
272 0.18
273 0.18
274 0.16
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.15
280 0.14
281 0.14
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.12
291 0.15
292 0.18
293 0.19
294 0.22
295 0.3
296 0.35
297 0.41
298 0.46
299 0.53
300 0.55
301 0.59
302 0.62
303 0.64
304 0.67
305 0.69
306 0.69
307 0.7
308 0.75
309 0.78
310 0.8
311 0.82
312 0.83
313 0.86
314 0.89
315 0.87
316 0.87
317 0.85
318 0.85
319 0.81
320 0.78
321 0.69
322 0.62
323 0.55
324 0.49
325 0.44
326 0.38
327 0.4
328 0.38
329 0.44
330 0.5
331 0.57
332 0.62
333 0.71
334 0.78
335 0.82
336 0.88
337 0.91
338 0.94
339 0.96
340 0.96
341 0.96
342 0.95
343 0.94
344 0.92
345 0.89
346 0.86
347 0.76
348 0.66
349 0.56
350 0.45
351 0.37
352 0.27
353 0.21
354 0.13
355 0.13
356 0.11
357 0.1
358 0.14
359 0.12
360 0.15
361 0.15
362 0.17
363 0.2
364 0.24
365 0.31
366 0.32
367 0.38
368 0.39
369 0.4
370 0.45
371 0.47
372 0.46
373 0.42
374 0.39
375 0.32
376 0.31
377 0.3
378 0.24
379 0.19
380 0.17
381 0.18
382 0.26
383 0.36
384 0.43
385 0.52
386 0.62
387 0.72
388 0.81
389 0.85
390 0.88
391 0.89
392 0.88
393 0.85
394 0.83
395 0.79
396 0.71
397 0.62
398 0.51
399 0.44
400 0.41
401 0.37
402 0.29
403 0.26
404 0.29
405 0.37
406 0.39
407 0.37
408 0.32
409 0.3
410 0.35
411 0.34
412 0.38
413 0.37
414 0.39
415 0.38
416 0.39
417 0.43
418 0.42
419 0.47
420 0.5
421 0.47