Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178B8F9

Protein Details
Accession A0A178B8F9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-29SSSFFTTPASQRKRKRTEGASSAPRRRDHydrophilic
196-222NSTPRRTPKKLIWRKGNKNKKGDRAYIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-29RKRKRTEGASSAPRRRD
199-217PRRTPKKLIWRKGNKNKKG
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 10.333, nucl 7.5, cyto_nucl 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSSSFFTTPASQRKRKRTEGASSAPRRRDADSNATRPAKNARRIEREESISGSDDSDDGREAFFGAEDGESESSADEGETAAEKRIRLAQRYLDNIRNEVQEEVGFDAEQIDKDLIAERLKEDVAENKGKIYRHIAEQLDFEEATHVFGHSGLQKAVTGCAVKLPYVWTVSKDLCVEKWELPDPKSYAPDPERPSNSTPRRTPKKLIWRKGNKNKKGDRAYIGHTGEIISIAVSDSGKYLATGDKHARLIIWDAETLTPRHLFTRHRDAVTSLSFRRGTEQLFSGGADRAVIVWSAPENAYIETLVGHQDTVIGIAGGLEVNQETCVSVGARDRSARLWRVVEENQLVFHGGGTARQKGMAKLRKGQFGKHVDEEDKANDEELPVAYAEGSIDCVALLDAGLFVTASDNGALSLWSVNRKKPLFVQPLAHGRDPPLPPDQMSANHDAATSAKPGPRLPRWVTALATVPFADLILSASWDGWIRAWKIGGDKRSLEPVGKVGRVPLEDEQMVNGDSNEDPILIRGIVNGLSVQERGDRGKEGLCIVAAVGKEPRVARWMSANVKNGIYVFEVPRKSLANGDAEDSEQGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.83
3 0.85
4 0.83
5 0.84
6 0.84
7 0.84
8 0.84
9 0.85
10 0.84
11 0.8
12 0.76
13 0.68
14 0.63
15 0.6
16 0.57
17 0.58
18 0.59
19 0.59
20 0.63
21 0.66
22 0.62
23 0.57
24 0.61
25 0.59
26 0.58
27 0.62
28 0.63
29 0.67
30 0.74
31 0.78
32 0.75
33 0.71
34 0.64
35 0.58
36 0.51
37 0.43
38 0.37
39 0.3
40 0.23
41 0.17
42 0.16
43 0.14
44 0.12
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.07
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.05
64 0.04
65 0.05
66 0.07
67 0.08
68 0.12
69 0.14
70 0.14
71 0.16
72 0.25
73 0.29
74 0.31
75 0.36
76 0.4
77 0.44
78 0.52
79 0.56
80 0.55
81 0.52
82 0.5
83 0.48
84 0.42
85 0.36
86 0.29
87 0.25
88 0.18
89 0.17
90 0.16
91 0.14
92 0.11
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.11
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.18
111 0.22
112 0.27
113 0.26
114 0.28
115 0.32
116 0.32
117 0.33
118 0.34
119 0.31
120 0.3
121 0.37
122 0.35
123 0.33
124 0.34
125 0.33
126 0.28
127 0.25
128 0.2
129 0.15
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.11
138 0.13
139 0.11
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.12
146 0.1
147 0.14
148 0.14
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.14
153 0.17
154 0.17
155 0.16
156 0.19
157 0.2
158 0.22
159 0.22
160 0.21
161 0.18
162 0.2
163 0.21
164 0.19
165 0.22
166 0.26
167 0.28
168 0.28
169 0.32
170 0.33
171 0.32
172 0.33
173 0.3
174 0.32
175 0.33
176 0.39
177 0.39
178 0.44
179 0.45
180 0.45
181 0.49
182 0.52
183 0.55
184 0.55
185 0.57
186 0.6
187 0.66
188 0.68
189 0.69
190 0.68
191 0.72
192 0.75
193 0.77
194 0.77
195 0.79
196 0.85
197 0.9
198 0.91
199 0.88
200 0.88
201 0.86
202 0.85
203 0.82
204 0.76
205 0.7
206 0.63
207 0.59
208 0.56
209 0.49
210 0.39
211 0.32
212 0.27
213 0.21
214 0.17
215 0.13
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.08
228 0.09
229 0.13
230 0.15
231 0.18
232 0.18
233 0.18
234 0.18
235 0.16
236 0.17
237 0.15
238 0.13
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.12
248 0.14
249 0.17
250 0.22
251 0.32
252 0.35
253 0.34
254 0.34
255 0.34
256 0.35
257 0.34
258 0.32
259 0.22
260 0.22
261 0.22
262 0.22
263 0.24
264 0.22
265 0.19
266 0.17
267 0.18
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.12
272 0.11
273 0.1
274 0.08
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.02
307 0.02
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.08
317 0.1
318 0.12
319 0.12
320 0.13
321 0.16
322 0.21
323 0.22
324 0.22
325 0.22
326 0.22
327 0.26
328 0.27
329 0.27
330 0.25
331 0.22
332 0.2
333 0.18
334 0.18
335 0.12
336 0.11
337 0.08
338 0.06
339 0.09
340 0.11
341 0.12
342 0.12
343 0.14
344 0.15
345 0.17
346 0.27
347 0.31
348 0.32
349 0.39
350 0.43
351 0.5
352 0.5
353 0.5
354 0.5
355 0.49
356 0.5
357 0.44
358 0.43
359 0.36
360 0.36
361 0.35
362 0.28
363 0.24
364 0.19
365 0.16
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.1
370 0.09
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.02
390 0.03
391 0.03
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.06
401 0.07
402 0.15
403 0.18
404 0.2
405 0.29
406 0.3
407 0.31
408 0.37
409 0.46
410 0.46
411 0.47
412 0.49
413 0.47
414 0.55
415 0.57
416 0.51
417 0.41
418 0.36
419 0.4
420 0.36
421 0.33
422 0.28
423 0.25
424 0.25
425 0.26
426 0.26
427 0.23
428 0.26
429 0.28
430 0.25
431 0.24
432 0.23
433 0.21
434 0.21
435 0.18
436 0.17
437 0.15
438 0.16
439 0.17
440 0.21
441 0.28
442 0.32
443 0.39
444 0.41
445 0.45
446 0.48
447 0.49
448 0.47
449 0.41
450 0.41
451 0.34
452 0.31
453 0.23
454 0.18
455 0.15
456 0.14
457 0.11
458 0.06
459 0.07
460 0.05
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.13
469 0.14
470 0.16
471 0.17
472 0.18
473 0.25
474 0.31
475 0.34
476 0.34
477 0.35
478 0.36
479 0.42
480 0.41
481 0.35
482 0.3
483 0.33
484 0.34
485 0.32
486 0.3
487 0.26
488 0.28
489 0.27
490 0.29
491 0.25
492 0.24
493 0.24
494 0.24
495 0.22
496 0.2
497 0.19
498 0.16
499 0.14
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.1
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.11
508 0.09
509 0.09
510 0.08
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.1
517 0.1
518 0.11
519 0.12
520 0.14
521 0.17
522 0.19
523 0.2
524 0.21
525 0.23
526 0.25
527 0.23
528 0.22
529 0.19
530 0.17
531 0.15
532 0.16
533 0.13
534 0.13
535 0.14
536 0.13
537 0.17
538 0.18
539 0.2
540 0.21
541 0.23
542 0.22
543 0.27
544 0.35
545 0.39
546 0.46
547 0.5
548 0.48
549 0.48
550 0.47
551 0.4
552 0.34
553 0.28
554 0.25
555 0.25
556 0.29
557 0.3
558 0.3
559 0.33
560 0.34
561 0.32
562 0.33
563 0.32
564 0.3
565 0.3
566 0.32
567 0.3
568 0.28