Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178AV53

Protein Details
Accession A0A178AV53    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-103RDPRNWSKVYRKLKKEAEKEKLBasic
274-295ASQVKKRKEAHSMFHKPKRRKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-295KKRKEAHSMFHKPKRRKI
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPVPSLYELAKLRLIKNIDLLNDIGDIPFSFLEPILRHIKNPDQLQELEETCPQIQGETGEIWLRLIKRDIPDWDQKPHQPRDPRNWSKVYRKLKKEAEKEKLAQETALKAQMQALQKDRAQNKTLIVDSKSGYGARSSRVFGLGSSSGWGSSGAPAKTGREAVDKLKRGMFDYKRERPRAANIPTHLLQARKSQVKAAPASMTTEYEAPRNMVISRQAAASVAKRKDSLPETKQPHITHRPIPQQNGGALPRPSLPAGQQFSAPRLKVEQDPASQVKKRKEAHSMFHKPKRRKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.3
3 0.35
4 0.35
5 0.31
6 0.3
7 0.29
8 0.24
9 0.22
10 0.2
11 0.14
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.12
20 0.12
21 0.17
22 0.23
23 0.24
24 0.25
25 0.3
26 0.37
27 0.41
28 0.44
29 0.44
30 0.41
31 0.41
32 0.41
33 0.4
34 0.34
35 0.29
36 0.26
37 0.24
38 0.19
39 0.2
40 0.18
41 0.13
42 0.13
43 0.11
44 0.12
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.15
54 0.18
55 0.19
56 0.24
57 0.28
58 0.31
59 0.4
60 0.42
61 0.45
62 0.47
63 0.51
64 0.55
65 0.57
66 0.59
67 0.59
68 0.63
69 0.68
70 0.74
71 0.76
72 0.74
73 0.75
74 0.74
75 0.74
76 0.76
77 0.76
78 0.75
79 0.73
80 0.76
81 0.77
82 0.8
83 0.8
84 0.81
85 0.78
86 0.75
87 0.71
88 0.67
89 0.6
90 0.51
91 0.42
92 0.33
93 0.27
94 0.22
95 0.23
96 0.17
97 0.14
98 0.16
99 0.19
100 0.21
101 0.22
102 0.23
103 0.24
104 0.25
105 0.32
106 0.34
107 0.34
108 0.33
109 0.32
110 0.3
111 0.3
112 0.3
113 0.26
114 0.23
115 0.21
116 0.19
117 0.18
118 0.17
119 0.14
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.14
129 0.11
130 0.14
131 0.12
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.05
139 0.07
140 0.11
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.14
146 0.15
147 0.14
148 0.13
149 0.15
150 0.2
151 0.28
152 0.29
153 0.3
154 0.31
155 0.3
156 0.29
157 0.37
158 0.34
159 0.36
160 0.43
161 0.51
162 0.57
163 0.6
164 0.6
165 0.54
166 0.57
167 0.57
168 0.53
169 0.5
170 0.43
171 0.45
172 0.44
173 0.44
174 0.38
175 0.3
176 0.26
177 0.26
178 0.3
179 0.29
180 0.29
181 0.31
182 0.32
183 0.37
184 0.36
185 0.33
186 0.28
187 0.24
188 0.27
189 0.23
190 0.21
191 0.16
192 0.17
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.15
202 0.15
203 0.15
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.16
208 0.19
209 0.24
210 0.24
211 0.25
212 0.26
213 0.27
214 0.33
215 0.36
216 0.4
217 0.39
218 0.46
219 0.51
220 0.55
221 0.62
222 0.57
223 0.61
224 0.6
225 0.59
226 0.57
227 0.59
228 0.64
229 0.63
230 0.66
231 0.62
232 0.56
233 0.52
234 0.51
235 0.45
236 0.4
237 0.35
238 0.31
239 0.27
240 0.26
241 0.25
242 0.21
243 0.22
244 0.24
245 0.28
246 0.27
247 0.3
248 0.3
249 0.33
250 0.39
251 0.36
252 0.29
253 0.29
254 0.31
255 0.32
256 0.38
257 0.39
258 0.36
259 0.43
260 0.46
261 0.51
262 0.53
263 0.56
264 0.57
265 0.6
266 0.63
267 0.62
268 0.68
269 0.67
270 0.71
271 0.75
272 0.78
273 0.79
274 0.83
275 0.86